| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 100,158 | C→T | 6.7% | P172L (CCG→CTG) | murG → | N‑acetylglucosaminyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 100,158 | 0 | C | T | 6.7% | 321.0 / 7.4 | 105 | P172L (CCG→CTG) | murG | N‑acetylglucosaminyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (48/49); new base T (4/3); total (52/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
ACTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAG > NC_000913/100009‑100304 | aCTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGcc > 2:459168/1‑150 (MQ=255)aCTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGcc > 1:498442/1‑150 (MQ=255)aCTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGcc > 1:786950/1‑150 (MQ=255) cTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCg < 2:4041/150‑1 (MQ=255) tCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgca < 1:883313/150‑1 (MQ=255) tCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgca > 1:150618/1‑150 (MQ=255) cATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgcag > 2:183343/1‑150 (MQ=255) aTGACCAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTTATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgcagc < 1:516974/150‑1 (MQ=255) tGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgcagca > 1:554938/1‑150 (MQ=255) tGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgc > 1:354654/1‑146 (MQ=255) tGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCgc < 2:354654/146‑1 (MQ=255) gAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGTTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCaa > 2:752695/1‑150 (MQ=255) gAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCaa > 1:1196818/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACg > 2:12392/1‑150 (MQ=255) aaaaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCTGCGGCAACggc < 2:844201/150‑3 (MQ=255) aaaaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCTGCGGCAACggc < 1:546033/150‑3 (MQ=255) aaaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGttt > 2:1303803/1‑150 (MQ=255) aaaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGttt > 1:1579202/1‑150 (MQ=255) aaCGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGAAGCAGGCGTTTCCAGGTGCCTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCTGCGGCAACggcag < 1:411690/150‑5 (MQ=255) cGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGc < 1:1227895/150‑1 (MQ=255) cGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGc < 2:701161/150‑1 (MQ=255) gTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTg < 2:900444/150‑1 (MQ=255) cGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTg < 1:1494995/150‑1 (MQ=255) ttAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGt > 1:776736/1‑150 (MQ=255) cAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCATTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGAAGTGAAGGTCCGGt > 2:1122330/1‑150 (MQ=255) cAATAAATGGCTCGCGAAGCTTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGCGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCACTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGt < 2:92128/150‑1 (MQ=255) aaaTGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCgt > 2:869998/1‑150 (MQ=255) ggctggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGc < 1:1018882/150‑1 (MQ=255) ctggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTg > 2:1651413/1‑150 (MQ=255) ggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGt > 1:184348/1‑150 (MQ=255) ggcGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGt > 1:124911/1‑150 (MQ=255) cGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGAc > 1:686155/1‑123 (MQ=255) cGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGAc < 2:686155/123‑1 (MQ=255) gAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgt > 1:1487261/1‑150 (MQ=255) aaGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgtg < 1:12392/150‑1 (MQ=255) tGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAgtgggtgg > 1:918135/1‑150 (MQ=255) gCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTTGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGggtggt > 1:1190678/1‑150 (MQ=255) gCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGggtggt > 1:744635/1‑150 (MQ=255) gCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGggtggt < 2:175873/150‑1 (MQ=255) gCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGggtggt > 1:360519/1‑150 (MQ=255) ccaccaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTACTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGtt < 2:1693303/150‑1 (MQ=255) caccaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtc > 1:1024781/1‑150 (MQ=255) accaAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCAGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTtct > 2:548945/1‑150 (MQ=255) caAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCa > 2:196613/1‑150 (MQ=255) aaGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTACTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGGGCGTACCGATGTGTTGGCGCGGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGGTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAgg < 1:444285/150‑1 (MQ=255) aaGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAgg < 2:1579202/150‑1 (MQ=255) aGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAggg > 1:1092199/1‑150 (MQ=255) aGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAggg > 2:963068/1‑150 (MQ=255) aGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAggg < 2:786950/150‑1 (MQ=255) aGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCAGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAggg < 2:498442/150‑1 (MQ=255) ctGAGGCAGGCGTTCCCCGGTGCATTCCCTAATGCGGAAGGATTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTGGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGGGCTGGTAGTGGGGGGTTCTCAGGgc < 2:238680/149‑1 (MQ=255) ggATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCTGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGAACCTATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGgcg < 2:1092967/149‑1 (MQ=255) aTGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGAGAGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGcgca > 1:342804/1‑150 (MQ=255) gCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGcgcacg < 1:585724/150‑1 (MQ=255) cAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGcgcacgc > 1:213579/1‑150 (MQ=255) cAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGcgcacgc < 2:1273452/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCAt > 1:479517/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGGGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCAt < 2:308607/150‑1 (MQ=255) ggCGTATCCAGGCGCTTGCACTCATGCGGACGTAGTGGGCACCCCGGTGCGTCCCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCAGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCAt < 1:325390/150‑1 (MQ=255) gTTTCCAGGTGCTTTCCCAAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCt < 1:1421169/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTa > 2:31639/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCa > 2:116790/1‑150 (MQ=255) ggTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGGATTCTTAACCAg < 1:900264/150‑1 (MQ=255) gCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACa > 1:749544/1‑150 (MQ=255) ttgccTAAGGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGGGCGTACCGATGTGGTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTTGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATg < 1:343017/147‑1 (MQ=255) actGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCGGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAg < 1:682989/148‑1 (MQ=255) aaTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAg > 1:1650224/1‑150 (MQ=255) aaTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGGGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAA‑CAGACAATGCCGCAgg < 2:150618/150‑1 (MQ=255) aTGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAgg < 1:183343/150‑1 (MQ=255) ggAAGTAGTGGGTACCCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGGTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgc > 1:1622887/1‑150 (MQ=255) aaGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTtgctg < 1:869998/150‑1 (MQ=255) gtagtGGGTAAGCCGGGGCGTACCGATGTGTGGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCg < 1:1303803/150‑1 (MQ=255) agtGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGaa > 2:353561/1‑150 (MQ=255) tAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTggg < 1:298262/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGt < 2:776736/150‑1 (MQ=255) aaCCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGCTGCTGCGAAACTGGGt > 1:239468/1‑150 (MQ=255) aCCCGGTGCGTACCGATTTGTTGGCGCTGCCGTTGCCTCAGCAAAGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGTGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTg < 2:137988/150‑1 (MQ=255) cccGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGa > 1:1394284/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGAt > 1:693690/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCGTACCGATGTGTAGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGAt > 1:1138733/1‑150 (MQ=255) tGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTTAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAg < 2:458078/150‑1 (MQ=255) tGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAg < 2:375327/150‑1 (MQ=255) ggCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAg < 1:697273/149‑1 (MQ=255) gTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCa < 1:963068/150‑1 (MQ=255) gTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCa > 1:291923/1‑150 (MQ=255) gATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATc > 2:1305321/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCAGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCt < 1:548945/150‑1 (MQ=255) gggtTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGGGAAGGTCCGGGTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTgg < 1:459168/148‑1 (MQ=255) tgtcgatGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGTACGTGAAGTTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATc < 2:1190678/144‑1 (MQ=255) tGGCGCTGCCGTTGCTGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGGAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATc > 1:938725/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATc > 1:113151/1‑150 (MQ=255) gcgcTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCag < 2:124911/150‑1 (MQ=255) caaacGTTGCTGCGGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGc > 1:1015531/5‑150 (MQ=255) tGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCg < 2:744635/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCg < 2:360519/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCgg < 2:693690/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCgg > 1:255110/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCgg > 1:1298547/1‑150 (MQ=255) tGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAg > 1:382343/1‑150 (MQ=255) tGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGGGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAg < 2:1138733/150‑1 (MQ=255) | ACTTCATGAACAAAACGGTATTGCGGGCTTAACCAATAAATGGCTGGCGAAGATTGCCACCAAAGTGATGCAGGCGTTTCCAGGTGCTTTCCCTAATGCGGAAGTAGTGGGTAACCCGGTGCGTACCGATGTGTTGGCGCTGCCGTTGCCGCAGCAACGTTTGGCTGGACGTGAAGGTCCGGTTCGTGTGCTGGTAGTGGGTGGTTCTCAGGGCGCACGCATTCTTAACCAGACAATGCCGCAGGTTGCTGCGAAACTGGGTGATTCAGTCACTATCTGGCATCAGAGCGGCAAAG > NC_000913/100009‑100304 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |