| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,357,224 | 0 | G | A | 5.2% | 309.9 / 3.6 | 97 | intergenic (‑114/+199) | sapA/ymjA | antimicrobial peptide transport ABC transporter periplasmic binding protein/DUF2543 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/46); new base A (3/2); total (48/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
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CAATCACCAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATAATATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAACTTAGCGAGGAGCAGAGCGGTACGATCGTGAGAAACCCATTAAAGCACGCTGCAGTGCGTGTCATTGTTAGCCAGATGCGGCGTG > NC_000913/1357077‑1357373 | cAATCACCAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATAATATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTg < 2:488084/150‑1 (MQ=255) ccAATAGAGACGCTAATACATGGCGCATAATATTACTGGATTTAATGTTAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGGTCGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCg < 1:287590/150‑1 (MQ=255) ccAAAAGAGACGATAATACCTGGCGCATAATATTAAGGGATTTTATGTAAAGAGGCTATCTTACTAATATTTAATGACATTTGCCATTACCGTTTGTGTTCAGGGGTCGTAATGAGGGCCGTGTGGTTGGTCGTTGAACAGGTGACGTCg > 1:1108024/1‑150 (MQ=255) 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1:912770/3‑150 (MQ=255) tgTTGAACAGATGGCGACGTCACCTGTTCAACATTCGTACCCGTGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAACTTAGCGAGGAGCAGAGCGGTACGATCGTGAGAAACCCATTAAAGCACGCTGCAGTGCGTGTCATTGTTAGCCAg > 2:1352696/2‑150 (MQ=255) cGTTGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGAGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAACTTAGCGAGGAGCAGAGCGGTAAGATCGTGAGAAAACCATTAAAGCACGCTGCAGTGAGTGTCAGTGTTAGACAg > 2:1203445/1‑150 (MQ=255) cGTTGAACAGGTGAAGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCAGAGATTTCTCTATAACTATAAATAAAAGAACAAATTAGCGAGTAGCAGAGCGGTACTATCGTGAGAAAAACATTAAAGCAAGATGAAGTGAGTGTCATTGTTAGCCAg > 2:1203448/1‑150 (MQ=255) ttGAACAGATGGCGACGTCACCTGTTCAACATTCGTACCCGTGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAAATTAGCGAGGAGCAGAGCGGTACGATCGTGAGAAACCCATTAAAGCACGCTGCAGTGCGTGTCATTGTTAGCCAGAt > 1:699197/1‑150 (MQ=255) tGAACAGGTGACGTCGCCATCTGTTCAACATTCGTACCCGTGATTTCTCTATAACTATAACTCACAGAACAACTTAGCGAGGAGCAGAGCGGTACGATCGTGAGAAACCCATTAAAGCACGCTGCAGTGCGTGTCATTGTTAGCCAGATg < 1:641175/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |