| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 105,046 | A→C | 5.4% | Q355H (CAA→CAC) | ftsA → | ATP‑binding cell division FtsK recruitment protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 105,046 | 0 | A | C | 5.4% | 376.7 / 8.8 | 123 | Q355H (CAA→CAC) | ftsA | ATP‑binding cell division FtsK recruitment protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/55); new base C (5/2); total (66/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TGGTCAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGTTACAGCATCA > NC_000913/104901‑105193 | tGGTCAACGCAGAGATATTGCAGTTGCATGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTATCCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGc < 1:115790/150‑1 (MQ=255)tGGTCAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGc < 1:1472485/150‑1 (MQ=255) gTCAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGAAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCACAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGt > 2:913302/1‑150 (MQ=255) cAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTAt > 1:1167597/1‑150 (MQ=255) cAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTAt < 2:205057/150‑1 (MQ=255) aaCGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCTCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATc > 2:152782/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATc > 2:1561270/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATc < 2:1691696/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCgg > 2:1621438/1‑150 (MQ=255) aaGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACTAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGgcg > 1:117587/1‑150 (MQ=255) aaGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCACTTGCGTAtgaaac < 2:656500/150‑6 (MQ=255) gagaTATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGgcgcg > 2:1671931/1‑150 (MQ=255) agaTATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGgcgcgc > 2:1432271/1‑150 (MQ=255) 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tttCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGtt > 1:595793/1‑150 (MQ=255) gccgaTACGCACTTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGtt > 1:479551/5‑150 (MQ=255) ccgaTACGCACTTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGTTa > 1:1259992/4‑150 (MQ=255) ccgaTACGCACTTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCAAATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTTTTa > 2:251681/4‑150 (MQ=255) tACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGTTACAGc > 1:1340025/1‑150 (MQ=255) 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1:618879/150‑1 (MQ=255) cAAGTGCGTAGCGGCGCGCCGCGGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCGCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGTTACAGCATCa < 2:286003/150‑1 (MQ=255) | TGGTCAACGAAGAGATATTGCAGTTGCAGGAAAAGCTTCGCCAACAAGGGGTTAAACATCACCTGGCGGCAGGCATTGTATTAACCGGTGGCGCAGCGCAGATCGAAGGTCTTGCAGCCTGTGCTCAGCGCGTGTTTCATACGCAAGTGCGTATCGGCGCGCCGCTGAACATTACCGGTTTAACGGATTATGCTCAGGAGCCGTATTATTCGACGGCGGTGGGATTGCTTCACTATGGGAAAGAGTCACATCTTAACGGTGAAGCTGAAGTAGAAAAACGTGTTACAGCATCA > NC_000913/104901‑105193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |