Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,413,968 | A→G | 6.0% | intergenic (‑41/+16) | ralR ← / ← recT | Rac prophage; restriction alleviation protein/Rac prophage; recombination and repair protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,413,968 | 0 | A | G | 6.0% | 344.6 / 9.0 | 117 | intergenic (‑41/+16) | ralR/recT | Rac prophage; restriction alleviation protein/Rac prophage; recombination and repair protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/61); new base G (5/2); total (54/63) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TTCGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTACACCGCCAGGCTGAATTATTCCTCTGAATTATCGATTACACTGTATTCCCCGGTTAATACAGAGGAATCTGCAGGATCGATTGTCAGTGGTTCCTTTTCATCCATTGATACTGCACGCTGGATCTCAATTGATACGGGCAAATATTTGA > NC_000913/1413819‑1414117 | ttCGGGATTCGCATCAGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCATTCACCGTTACTGATGGACAACCACAATATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCATGTTGGCGGTGCATTa < 2:1028569/150‑1 (MQ=255) cGGGATTCGCATCCGTTACCCTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTaca > 2:1530849/1‑150 (MQ=255) cGGGATTCGCATCCGTTACACTTCGCTCGGTAATATCCTGAAATGGCTTTCACCGTTACTGATGGACAACCACAAAATGGACATGGTTTAACATTGTCATATCTCATAATTTTTCTCATAAAAAATATTTCAAGTTGGCGGTGCATTac < 1:659279/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |