Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,475,548 | 0 | A | C | 5.7% | 300.5 / 5.7 | 99 | A135A (GCA→GCC) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/45); new base C (2/4); total (50/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AATCAAAAATTGATTGTTCTTGGGAATTTGACAGTCAAAGGTAATATTTCCACTTTCTCTCTTTCTAATCCATGGGTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAA > NC_000913/1475399‑1475697 | aaTCAAAAATTGATTGTTCTTGGGAATTTGACAGTCAAAGGTAATATTTCCACTTTCTCTCTTTCTAATCCATGGGTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCa < 2:1237531/150‑1 (MQ=255) aaTCAAAAATTGATTGTTCTTGGGAATTTGACAGTCAAAGGTAATATTTCCACTTTCTCTCTTTCTAATCCATGGGTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCa > 2:504342/1‑150 (MQ=255) cAAAAATTGATTGTTCTTGGGAATTTGACAGTCAAAGGTAATATTTCCACTTTCTCTCTTTCTAATCCATGGGTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGt > 1:2969/1‑150 (MQ=255) 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cAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCg < 1:1458423/139‑1 (MQ=255) aaGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGTGGAGTATTAATTCGCGTGGTATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTAATGGTCAGTGCTAGTGACaa > 1:1447730/1‑150 (MQ=255) | AATCAAAAATTGATTGTTCTTGGGAATTTGACAGTCAAAGGTAATATTTCCACTTTCTCTCTTTCTAATCCATGGGTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAA > NC_000913/1475399‑1475697 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |