| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,579,569 | 0 | T | C | 7.8% | 361.8 / 17.0 | 128 | intergenic (‑227/+64) | yddA/ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (57/60); new base C (4/6); total (61/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
CAATATGAAATATAAAGGAATATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCATAATGTGGTAAAGCGGTACTCTGTTCTTAGCTAACTCTACCATGGCGTTCAT > NC_000913/1579421‑1579716 | cAATATGAAATATAAAGGAATATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTa < 1:1151488/150‑1 (MQ=255) atatGAAATATAAAGGAATATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATg < 1:785641/150‑1 (MQ=255) atatGAAATATAAAGGAATATTTCATTTTCAGTGGTTATGGTTATGCTATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATg < 1:1594654/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |