| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,596,503 | T→G | 6.3% | pseudogene (1485/3861 nt) | yneO ← | pseudogene, AidA homolog |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,596,503 | 0 | T | G | 6.3% | 271.7 / 6.8 | 91 | pseudogene (1485/3861 nt) | yneO | pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/43); new base G (3/3); total (45/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTT > NC_000913/1596354‑1596651 | tCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCAttt < 2:1435452/150‑1 (MQ=255) cACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtc < 1:1398072/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcc < 1:615220/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcc < 2:1370055/150‑1 (MQ=255) cgcgCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcct > 1:1176499/1‑150 (MQ=255) cgcTTTAACTATACCTCCGGTGTTAATATTCAGTTCACCCGTGACTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGATATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc < 1:221745/150‑1 (MQ=255) cgcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc < 2:1354936/150‑1 (MQ=255) cgcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc < 2:229194/150‑1 (MQ=255) gcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCg < 2:555897/150‑1 (MQ=255) gcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCg < 1:1271347/150‑1 (MQ=255) gcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCg < 1:487911/150‑1 (MQ=255) gcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACACGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCg < 1:1178538/150‑1 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACCCCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTATCGGAGGAAATGCCTCCggt < 2:114356/150‑3 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGAt > 1:1014878/1‑150 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGAt < 2:409838/150‑1 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCggt < 1:614521/150‑3 (MQ=255) ttACCTCTACCTCCGGTTGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATTCTCCGACCTGTAGCATTTGTGCGGTAGTAGATGATTTCTGTAAATTCCAGAGACTGTGCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTa < 2:679764/150‑1 (MQ=255) tataCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATcc < 2:639994/150‑1 (MQ=255) aataCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATcc < 2:1310364/149‑1 (MQ=255) taCCTCCGGTGGTAATATTCTGTTCACGCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCATTTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTGCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCAt < 2:385011/150‑1 (MQ=255) aCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCAGATAAATCCATa > 1:1435994/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTACATGATGTCTTTAAATTCCAGCGACTGTCCGTTGAAATATTAACAATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGc < 2:1306537/150‑1 (MQ=255) ccGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGccc > 2:133610/1‑150 (MQ=255) gtggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGtt < 2:1371954/150‑1 (MQ=255) gtggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGtt > 2:1294584/1‑150 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg < 1:1445047/150‑1 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg < 1:1314785/150‑1 (MQ=255) tAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAt < 1:426547/150‑1 (MQ=255) tAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAt > 2:1301338/1‑150 (MQ=255) tAATAGTCAGTTCACCCGGGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAAt < 2:50966/150‑1 (MQ=255) ttCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAgg < 1:1632539/150‑1 (MQ=255) aGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTg > 2:1713208/1‑150 (MQ=255) aGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATAAAGGGTg < 2:1164281/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTgg > 1:531253/1‑150 (MQ=255) cACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCAc < 1:549206/150‑1 (MQ=255) aCCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGAAcc > 1:822801/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCa > 1:531735/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCAtt > 1:1509798/1‑150 (MQ=255) gTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTa < 1:142014/150‑1 (MQ=255) tAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGAc > 2:515373/1‑150 (MQ=255) cacCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTa > 1:1182041/1‑150 (MQ=255) cacCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATACATAGACCGTTGAATTAAGGGTGGAACCATTACTGACATTTa > 2:50423/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGCAATTGTGTGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATAc > 2:289553/1‑150 (MQ=255) ccTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATAc < 2:422918/150‑1 (MQ=255) cTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATAcc < 2:1058980/150‑1 (MQ=255) gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTAc < 2:372894/150‑1 (MQ=255) gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTAc > 2:1676439/1‑150 (MQ=255) tgtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGATACCaaaa > 2:1068039/1‑150 (MQ=255) gtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAAt < 1:1713208/150‑1 (MQ=255) gCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTa > 2:1720223/1‑150 (MQ=255) cGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCAATAGCACGTTGAATTAAGGGTTGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAc > 1:1434258/1‑150 (MQ=255) gTTTGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCAGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACAATTACGATACCGCTACCAAAATTAcc > 1:1430603/1‑150 (MQ=255) gTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAcc > 2:376176/1‑150 (MQ=255) agtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGAc < 2:1529552/150‑1 (MQ=255) ttagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACa < 1:496880/149‑1 (MQ=255) tagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACAt > 2:1175185/1‑150 (MQ=255) agATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCATTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACAtt > 2:204308/1‑150 (MQ=255) atgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAc < 2:985200/150‑1 (MQ=255) tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAcc < 2:531735/150‑1 (MQ=255) tCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGc < 2:551712/123‑1 (MQ=255) tCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGc > 1:551712/1‑123 (MQ=255) cTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac < 1:1417136/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac > 2:1408475/1‑150 (MQ=255) tAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGt > 1:1669198/1‑150 (MQ=255) aTTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACAAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATc > 2:1552086/1‑150 (MQ=255) aTTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACAGTAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAATGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAACGACATTGATACCCACAGAATc > 1:1058352/1‑150 (MQ=255) ttCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCg < 1:1101033/150‑1 (MQ=255) cAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAAc > 2:212562/1‑150 (MQ=255) cAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAAc > 2:1405873/1‑150 (MQ=255) agagACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACg > 2:1406191/1‑150 (MQ=255) agagACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACg < 1:1720223/150‑1 (MQ=255) gagaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACga < 2:1323740/150‑1 (MQ=255) agaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTAACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCTTAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACgat < 2:666657/150‑1 (MQ=255) gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGCCATTTACGCTACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAACCACAGTATCGAACgaag > 2:253003/1‑148 (MQ=255) gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACgatg > 2:25080/1‑150 (MQ=255) gaCTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACgatg < 2:1509798/150‑1 (MQ=255) aaaTATTAACTATCCCATTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcca < 1:50423/150‑1 (MQ=255) tatTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCa < 1:133610/150‑1 (MQ=255) tatTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCa > 2:1034322/1‑150 (MQ=255) atTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAg > 1:422179/1‑150 (MQ=255) ttAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAgg < 1:988073/150‑1 (MQ=255) aCTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTc < 1:1408475/150‑1 (MQ=255) cTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCa > 1:1438692/1‑150 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 1:25080/150‑1 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 1:692423/150‑1 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 1:1033346/150‑1 (MQ=255) cccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCCCCATTACTGACATTTACGATACAGCTACCAAATTTACCGACATTGATACCCAAAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGtgtg > 1:299222/1‑150 (MQ=255) attACCGTAGGAATTTCCTCAGATAAATCCATAGAACGTTGAATTAAGTGTGGCACAATTACTTACATTTTCGATACAGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGATCAGTGTGcc < 1:80290/149‑1 (MQ=255) ttACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCg < 1:953199/150‑1 (MQ=255) tatcGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAATTTACCGACAATGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGa > 1:290466/4‑150 (MQ=255) tACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGa > 1:593621/1‑150 (MQ=255) atcGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGAt > 1:1010610/3‑150 (MQ=255) ccGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATa > 2:1608247/1‑150 (MQ=255) ccGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATa < 2:1014878/150‑1 (MQ=255) ggaggaAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc > 1:1547045/1‑150 (MQ=255) aGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTTCCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgc > 1:454101/1‑150 (MQ=255) ggCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgct > 2:1023243/1‑150 (MQ=255) cATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGTTTCAGTGTGCCTATACCgcttg > 1:151686/1‑150 (MQ=255) tttCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttgct < 1:515373/150‑1 (MQ=255) ttCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttgctt < 1:1301338/150‑1 (MQ=255) | TCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTGCTT > NC_000913/1596354‑1596651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |