Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 137,020 | A→T | 6.6% | intergenic (‑103/‑63) | yacC ← / → cueO | PulS_OutS family protein/multicopper oxidase (laccase) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 137,020 | 0 | A | T | 6.6% | 306.1 / 8.8 | 106 | intergenic (‑103/‑63) | yacC/cueO | PulS_OutS family protein/multicopper oxidase (laccase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/47); new base T (5/2); total (56/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.45e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.18e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACGGCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTATTTGCGGC > NC_000913/136871‑137168 | aCGGCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTa < 2:107759/150‑1 (MQ=255) gCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAgg > 2:88451/1‑150 (MQ=255) ccATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAggg < 2:796210/150‑1 (MQ=255) ccATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAggg > 1:1164868/1‑150 (MQ=255) ccATCAGGCTGCCGAATAACACTGTGCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAggg < 1:1592110/150‑1 (MQ=255) cATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAgggg < 1:1184843/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCCTTACGGGAAgg < 2:761093/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGa < 1:88451/150‑1 (MQ=255) gCTGTCGAATAACACTGTTCTGAAAAACTTCTTAATAGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCCTTACGGGAAggtc < 2:134738/150‑3 (MQ=255) cGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGc > 1:883344/1‑150 (MQ=255) cGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGc < 2:1249777/150‑1 (MQ=255) cGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGc > 2:1264548/1‑150 (MQ=255) gAATAACACTGTTTTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCt > 2:1158276/1‑150 (MQ=255) aTAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCa < 2:260211/150‑1 (MQ=255) tAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCaa > 1:1404087/1‑150 (MQ=255) aaCACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAAc > 1:596476/1‑150 (MQ=255) acacTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACg > 1:1164458/1‑150 (MQ=255) cacTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGt > 2:1572352/1‑150 (MQ=255) cTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCAATATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGttt > 2:724031/1‑150 (MQ=255) tGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTg < 1:101103/150‑1 (MQ=255) tCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGAtt < 2:222207/150‑1 (MQ=255) tGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGAtttt > 1:1429996/1‑150 (MQ=255) gAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTg > 2:1593172/1‑150 (MQ=255) aaaaCGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGTTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGtt < 2:448403/150‑1 (MQ=255) aaaaCGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCTCACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGtt < 1:68458/150‑1 (MQ=255) aaaaCGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGtt < 1:626179/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGttt > 1:684383/1‑150 (MQ=255) cGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGc > 1:1680923/1‑150 (MQ=255) gTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTCAAGAAGATAAACGTTAGCTCACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGAGTCTGCGGCTGGACCTTCCGGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGcc < 1:1090364/150‑1 (MQ=255) gTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGcc < 2:685355/150‑1 (MQ=255) tCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGACTATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCt < 2:253261/150‑1 (MQ=255) cATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCtt < 2:1128541/150‑1 (MQ=255) cATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCtt > 2:1462378/1‑150 (MQ=255) cATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCtt > 2:732122/1‑150 (MQ=255) ttGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTaa > 1:1342344/1‑150 (MQ=255) tGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAg < 1:1572352/150‑1 (MQ=255) gCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGa > 2:553471/1‑150 (MQ=255) tCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCGCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATa < 2:1052719/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGa < 1:47201/150‑1 (MQ=255) ccAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGa < 1:125926/150‑1 (MQ=255) aGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGATCGAGGCGACGACCATTATTTTCGATTAAATTTTGTAAGCGGCTTGACATTCCCGTAAGGGCAAGGACTATGCTCAAAGGTTGATTTTGTTTCGCGTGCATAACAATAAGGaaa > 1:115855/1‑150 (MQ=255) ggggCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAAt < 1:732122/150‑1 (MQ=255) gggCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATa > 2:1018883/1‑150 (MQ=255) gCTTAAATAAGATAAAAGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAAc < 1:78926/150‑1 (MQ=255) gCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAAc > 1:1027084/1‑150 (MQ=255) aaaGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAATTAACTAtt > 1:1249866/1‑149 (MQ=255) aaaGAAGATAAACGTTAGAACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCTTAAGGGGAAGGACTATTCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATg > 1:1256530/1‑150 (MQ=255) aagaagATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGc > 2:221062/1‑150 (MQ=255) agaagaTAACCGTTAGCACACTGCGTGAGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCa < 1:341275/150‑1 (MQ=255) agaTAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAAcg > 1:364381/1‑150 (MQ=255) tAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAAcgtcg < 1:1593172/150‑1 (MQ=255) cGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGAt > 1:571676/1‑150 (MQ=255) tAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTc < 2:883344/150‑1 (MQ=255) gCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCtt > 2:526867/1‑150 (MQ=255) gCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCtt > 2:1161565/1‑150 (MQ=255) gCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCtt > 2:1073079/1‑150 (MQ=255) cacaCTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTa < 2:684383/150‑1 (MQ=255) cacaCTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTa < 1:1131999/150‑1 (MQ=255) acacTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTaa < 2:1027084/150‑1 (MQ=255) cacTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTaaa < 1:283038/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAat < 1:1410303/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAat < 2:1342344/150‑1 (MQ=255) cTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAat > 2:1157124/1‑150 (MQ=255) gcgagcgaGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAatat > 1:931081/1‑150 (MQ=255) gagcgagGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTc < 2:1164458/150‑1 (MQ=255) gcgagGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCg < 2:1164868/150‑1 (MQ=255) gagGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTc < 1:1642017/150‑1 (MQ=255) gacgacCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTCAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCt < 1:1468392/150‑1 (MQ=255) gacgacCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCt > 1:1613553/1‑150 (MQ=255) cgacCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTgg > 2:17719/1‑150 (MQ=255) cATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGgtgt > 2:429099/1‑150 (MQ=255) ttattGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTgg < 1:1264548/150‑1 (MQ=255) tattGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGc < 2:1680923/150‑1 (MQ=255) attGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCt < 1:744441/150‑1 (MQ=255) gTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCg > 2:537458/1‑150 (MQ=255) cGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTaaa > 1:1577514/1‑120 (MQ=255) cGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTaaa < 2:1577514/120‑1 (MQ=255) gATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGATCAACGTTTTATTTTTTTTCGCCAGCTTAAGAAAAAGGAAATAAATATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTAAGTAGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCt > 1:1084115/1‑150 (MQ=255) ttAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTTATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCttt < 1:429099/150‑1 (MQ=255) ttAAATTGTGTCTGCGGATTGACATTCCCGAAAGGGGAAGCACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCGTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGAATTCTTAAAATATTCAGTCGCGCAGGGTGTGTATTCGGCtat > 1:436587/1‑148 (MQ=255) aaaTTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGc > 1:1485759/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTAGTGATTTCTTAAAATATTACGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGc > 1:1715543/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTAAGCTCAACGTTTGATTTTGTTTAGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGTCtttta > 2:850770/1‑148 (MQ=255) aTTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCg < 1:1462378/150‑1 (MQ=255) gtgtCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGACGcgg > 1:1072414/1‑148 (MQ=255) tCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTgg < 1:1018883/150‑1 (MQ=255) tCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTgg > 1:612357/1‑150 (MQ=255) ggCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCcg < 1:553471/150‑1 (MQ=255) gCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTATGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCcgc > 1:529010/1‑150 (MQ=255) cTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCcgcg < 1:448635/150‑1 (MQ=255) gtccTTCCCCTTACGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAg > 1:708693/3‑150 (MQ=255) gtccTTCCCCTTACGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAg > 1:528139/3‑150 (MQ=255) gtccTTCCCCTTACGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAg > 2:759144/3‑150 (MQ=255) gtccTTCCCCTTACGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAg > 2:798890/3‑150 (MQ=255) gACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAg > 1:1409383/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATTAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTa < 1:1323489/150‑1 (MQ=255) ccTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTa > 1:426034/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTa > 1:33272/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTa > 1:243943/1‑150 (MQ=255) tAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTATTTGCGGc < 1:221062/150‑1 (MQ=255) | ACGGCCATCAGGCTGCCGAATAACACTGTTCTGAAAAACGTCTTCATTGCTTCTACCAGGGGCTTAAAGAAGATAAACGTTAGCACACTGCGAGCGAGGCGACGACCATTATTGTCGATTAAATTGTGTCTGCGGCTTGACCTTCCCGTAAGGGGAAGGACTATGCTCAACGTTTGATTTTGTTTCGCCTGCTTAAGAATAAGGAAATAACTATGCAACGTCGTGATTTCTTAAAATATTCCGTCGCGCTGGGTGTGGCTTCGGCTTTGCCGCTGTGGAGCCGCGCAGTATTTGCGGC > NC_000913/136871‑137168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |