Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,057,595 | 0 | T | C | 8.5% | 319.6 / 17.5 | 117 | intergenic (+21/+432) | yeeN/asnW | UPF0082 family protein/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (52/55); new base C (3/7); total (55/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.64e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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cTGTCTTAACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGt < 2:735189/150‑1 (MQ=255) | GAAATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGT > NC_000913/2057449‑2057741 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |