Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,057,599 | 0 | T | A | 10.9% | 287.3 / 18.7 | 116 | intergenic (+25/+428) | yeeN/asnW | UPF0082 family protein/tRNA‑Asn |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/53); new base A (5/8); total (55/61) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.65e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
AATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCA > NC_000913/2057451‑2057745 | aaTGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTa < 1:445612/150‑1 (MQ=255) aaTGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTa < 2:1285825/150‑1 (MQ=255) gATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACgg > 1:1490527/1‑150 (MQ=255) 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cTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCa > 2:1672595/1‑150 (MQ=255) | AATGATTGCTCAATCTGAAGTTGAGCTTTCCCCAGAAGATTTAGAAATCTTTGAAGGGCTTGTTGATGCCCTTGAAGATGACGACGATGTACAAAAAGTTTATCATAACGTCGCAAATCTCTAATTATCTTTTAAAGAAATCTGTCTTTACGGCAGATTTCTTTAATCTCATATAATTCTTATAAAAAATATAATATTCAACTCGTCATATTGATTATA‑CCCCCCCGTTCCCAGAGAAATAATATTTATTAAAATTCCAGTTCTTCTTTTTCTGATTACAGAAGGCAAAGTGGCA > NC_000913/2057451‑2057745 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |