Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,491,268 | 0 | T | A | 5.9% | 295.0 / 4.7 | 99 | D228V (GAT→GTT) | oxc | oxalyl CoA decarboxylase, ThDP‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/44); new base A (4/2); total (53/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CAACAAGCATGACAACGTCAGCATTTGCCAGGGCAAACGAACGCGCAGCTGCCGCAGAAAGTGGATGCGTATCTTCAAGGATCCCTTTCGCCATAGACATTGGCAGGAATGGAATCTGAGCACTTTCAATAAATTCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGTTAACGCTTCG > NC_000913/2491119‑2491417 | caacaaGCATGACAACGTCAGCATTTGCCAGGGCAAACGAACGCGCAGCTGCCGCAGAAAGTGGATGCGTATCTTCAAGGATCCCTTTCGCCATAGACATTGGCAGGAATGGAATCTGAGCACTTTCAATAAATTCACGAAGCTGTtcat < 1:375554/150‑1 (MQ=255) caaGCATGACAACGTCAGCATTTGCCAGGGCAAACGAACGCGCAGCTGCCGCAGAAAGTGGATGCGTATCTTCAAGGATCCCTTTCGCCATAGACATTGGCAGGAATGGAATCTGAGCACTTTCAATAAATTCACGAAGCTGTTCATCAg < 1:251266/150‑1 (MQ=255) cATGACAACGTCAGCATTTGCCAGGGCAAACGAACGCGCAGCTGCCGCAGAAAGTGGATGCGTATCTTCAAGGATCCCTTTCGCCATAGACATTGGCAGGAATGGAATCTGAGCACTTTCAATAAATTCACGAAGCTGTTCATCAGCTt‑g > 1:1477915/1‑150 (MQ=255) 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aaTAAATTCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACttt > 1:1495000/1‑150 (MQ=255) gcgtaTTCAC‑AAGCTGATGAACAGCTTCGTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTa > 1:999239/5‑150 (MQ=255) aaaTTCACGAAGTTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGACTTTGCCAAGGATAATTTATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAAc < 1:1214205/150‑1 (MQ=255) aaaTTCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGAATTTCAACTTTAAc < 1:687241/150‑1 (MQ=255) aaTTCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTATTGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTCACTTCGGGCATGGCAATATTGCTGGCGCCGGCTTTTCAACTTTACCa > 2:142127/1‑150 (MQ=255) tCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATc > 1:1526525/1‑150 (MQ=255) cACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCg > 1:1464643/1‑150 (MQ=255) cacaaGCTGATGAACAGCTTCGTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCg > 2:705465/4‑150 (MQ=255) cacaaGCTGATGAACAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGt > 1:857915/4‑150 (MQ=255) aCGAAGCTGTTCATAAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTTAGCTAGTGACTGACTTCGGGAATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGt < 1:25622/150‑1 (MQ=255) cGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTg < 1:1276767/150‑1 (MQ=255) cGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTg < 2:590518/150‑1 (MQ=255) aGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGtt < 1:176077/150‑1 (MQ=255) tcatcaGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGCCTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGTTACCGCt > 2:834280/1‑150 (MQ=255) catcaGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGTTAACGCtt > 1:621938/1‑150 (MQ=255) atcaGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGGCGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGTTAACGCTTc > 2:1322729/1‑150 (MQ=255) atcaGCTT‑CTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTAAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGAATAAGGGAATGGAAATAATCAGGCCGAC‑GAATTTAAACCTTAAAAAACGTTGTTaaacgatac > 2:664612/1‑143 (MQ=255) | CAACAAGCATGACAACGTCAGCATTTGCCAGGGCAAACGAACGCGCAGCTGCCGCAGAAAGTGGATGCGTATCTTCAAGGATCCCTTTCGCCATAGACATTGGCAGGAATGGAATCTGAGCACTTTCAATAAATTCACGAAGCTGTTCATCAGCTT‑GTGAATACGCCGCGCCTTTGCCAAGGATAATTAATGGCCGTTCAGCTTTTGCTAAAAGCGAAATTGCGCTAGTGACTGACTTCGGGCATGGCAATAATGCTGGCGACGGATTTTCAACTTTAACAATCGTGGTTAACGCTTCG > NC_000913/2491119‑2491417 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |