| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 126 (1.640) | 98/288 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TTCTCAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑AGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCC > NC_000913/1299351‑1299645 | ttctCAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aa < 1:263613‑M1/149‑2 (MQ=255)ttctCAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aa < 2:841623‑M1/149‑2 (MQ=255) tctcAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCAATGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aat > 1:971740‑M1/1‑147 (MQ=255) ctcAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aata < 2:127505‑M1/149‑4 (MQ=255) aaTTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataa > 2:652048‑M1/1‑142 (MQ=255) aTTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATTATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataat < 2:1123581‑M1/149‑9 (MQ=255) aTTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataat < 1:758464‑M1/149‑9 (MQ=255) cAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaat > 1:784292‑M1/1‑137 (MQ=255) agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaatt < 1:612368‑M1/149‑14 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTACTTAACTGCTTCTCCTAACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgtt < 1:187939‑M1/149‑17 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaa > 1:83232‑M1/1‑130 (MQ=255) ttaaGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaatt < 1:902838‑M1/148‑22 (MQ=255) taAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTGACCATAATGTTATTTTCGCTACATCATAATCCTGGGCTTTCTGAAGAATAATTGAAATTATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaatta < 1:938310‑M1/149‑23 (MQ=255) taAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaatta > 1:353537‑M1/1‑127 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgt > 1:1232592‑M1/1‑123 (MQ=255) gATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgt < 2:288401‑M1/149‑27 (MQ=255) aTTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtg < 2:27031‑M1/149‑28 (MQ=255) aTTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGATGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtt > 1:885‑M1/1‑122 (MQ=255) cTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:660821‑M1/149‑33 (MQ=255) ttAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcattta > 2:1181565‑M1/1‑116 (MQ=255) tAAATGATTCTCCTAACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttca < 1:208258‑M1/149‑35 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 2:210057‑M1/1‑114 (MQ=255) aaCTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcac > 2:311064‑M1/1‑114 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aattataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgt > 1:203325‑M1/1‑108 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgg > 1:24902‑M1/1‑108 (MQ=255) cttctcaccATCATGTTATTTTAGCAACATCATAATCCTGGGATTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTTCCTTTTGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:167547‑M1/146‑44 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGATTAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatatcactactggaa < 2:455890‑M1/149‑44 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 1:301390‑M1/149‑44 (MQ=255) ctcctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaa < 2:4324‑M1/149‑44 (MQ=255) cctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaact < 2:695704‑M1/149‑46 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 1:676525‑M1/1‑103 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 2:576442‑M1/1‑103 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactg > 2:874856‑M1/1‑103 (MQ=255) aCCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaa < 2:934589‑M1/149‑50 (MQ=255) ccATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGCAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGGAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaat < 2:108076‑M1/149‑51 (MQ=255) catcatGTTATTTTAGGCAAATAATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaatttttgtgcatttcactactggaactgtaatc < 1:219050‑M1/149‑52 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatca < 2:124535‑M1/149‑53 (MQ=255) atcatGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatca > 1:152566‑M1/1‑97 (MQ=255) atGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaa < 2:766550‑M1/149‑56 (MQ=255) gTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa > 1:1005021‑M1/1‑92 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGATTAATTGAAATGATATTATTAATTCAACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcataaaag > 1:180163‑M1/1‑91 (MQ=255) tATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaaga > 2:301322‑M1/1‑90 (MQ=255) tCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac < 2:584262‑M1/149‑65 (MQ=255) gCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacat < 2:700618‑M1/149‑67 (MQ=255) cacaTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgc > 2:1105429‑M1/1‑81 (MQ=255) atcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgctta < 1:817060‑M1/149‑72 (MQ=255) tcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttag > 2:9553‑M1/1‑77 (MQ=255) catAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagc < 2:1124085‑M1/149‑74 (MQ=255) tCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaata > 1:391875‑M1/1‑71 (MQ=255) tGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTTCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctct < 1:379699‑M1/149‑82 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctcta < 1:463852‑M1/149‑83 (MQ=255) ggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctat < 2:628361‑M1/149‑84 (MQ=255) ggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctat < 1:453683‑M1/149‑84 (MQ=255) ggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctat < 2:234073‑M1/149‑84 (MQ=255) ggCTTGCAGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataatactcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctat < 2:961673‑M1/149‑84 (MQ=255) gCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatt > 2:588836‑M1/1‑65 (MQ=255) gCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatt < 1:1090348‑M1/149‑85 (MQ=255) gCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatt < 2:1232769‑M1/149‑85 (MQ=255) cTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctattt > 1:74126‑M1/1‑64 (MQ=255) gCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgat < 1:319082‑M1/149‑89 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaataagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgat < 1:1004418‑M1/149‑89 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaa > 1:357364‑M1/1‑57 (MQ=255) aagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaa > 1:1266605‑M1/1‑57 (MQ=255) agaaTAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaat > 2:693389‑M1/1‑56 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTATTATTTCCAGTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattg < 2:295675‑M1/149‑96 (MQ=255) taatTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaa < 2:1232592‑M1/149‑98 (MQ=255) atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaag < 1:1231806‑M1/149‑100 (MQ=255) atTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaag > 1:989838‑M1/1‑50 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttacccaatctctatttgattgaattgaaaga > 1:458615‑M1/1‑49 (MQ=255) ttGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgataaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagcaaatataaatatgattgatatgaaaga > 2:202163‑M1/1‑49 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGTAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtt < 1:566435‑M1/149‑105 (MQ=255) aTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgttt > 1:640364‑M1/1‑44 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttg > 1:1246302‑M1/1‑43 (MQ=255) attattAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaa > 1:1041459‑M1/1‑39 (MQ=255) attattAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaa < 2:328549‑M1/149‑111 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaag < 1:273587‑M1/149‑112 (MQ=255) attaATTCCACTGACTTTTGTAGATGAAATTGCTA‑‑‑Aataataatcaatttttaaattattgtgcttttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaagtc < 1:124754‑M1/149‑114 (MQ=255) taATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcat < 2:391875‑M1/149‑116 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatgg > 2:136551‑M1/1‑32 (MQ=255) ttCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatgga > 2:1039693‑M1/1‑31 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggat < 1:518487‑M1/149‑120 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgca < 1:1065798‑M1/149‑123 (MQ=255) cTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagcta > 2:816128‑M1/1‑22 (MQ=255) tttGGTAGACTAAAGTGATA‑‑‑Aataatactaaatagtaaaattattttgtatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacattcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctat < 1:839443‑M1/149‑129 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctataga > 2:1011265‑M1/1‑18 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctataga < 1:588836‑M1/149‑132 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctataga < 1:311064‑M1/149‑132 (MQ=255) gTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagat > 2:1088883‑M1/1‑17 (MQ=255) tAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagatt > 1:718139‑M1/1‑16 (MQ=255) tAGAGGAAACTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcaattcactactggaactgtaatcagaaaagatcgacatgcatagccaatctctattagattgaattgaaagatgttttttaaggcatggatgcaagctatagatt < 2:192430‑M1/149‑134 (MQ=255) agagGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattc < 2:1130546‑M1/149‑135 (MQ=255) agagGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataataaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattc < 2:807402‑M1/149‑135 (MQ=255) agGAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctg < 2:1005021‑M1/149‑137 (MQ=255) ggAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctga < 2:289713‑M1/149‑138 (MQ=255) ggAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctga < 2:365076‑M1/149‑138 (MQ=255) gAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgat < 1:1188014‑M1/149‑139 (MQ=255) gAAAGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgat > 1:870772‑M1/1‑11 (MQ=255) aGTGCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgttcatttcactactcgaactgtaatcagaaaatatagacatgattagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgataaggcattgatgcaagctatagattctgatacg < 1:805323‑M1/149‑142 (MQ=255) gCTA‑‑‑Aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatacggtc > 1:28119‑M1/1‑5 (MQ=255) a‑‑‑aataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatacggtcaat < 1:210057‑M1/149‑148 (MQ=255) | TTCTCAAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA‑‑‑AGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCTTGTCCC > NC_000913/1299351‑1299645 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |