New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 731990 = | NA (NA) | 8 (0.010) | 5/264 | NT | NA | coding (2408/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | 3621559 = | NA (NA) | coding (2368/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/732143‑731990 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctgCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCC > NC_000913/3621559‑3621707 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATG < 2:10122544/150‑1 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATG < 1:3972579/150‑1 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1:823848/1‑150 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATG > 2:774464/1‑150 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATG > 2:1330595/1‑150 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCAAGTTTCATG > 2:1384134/1‑150 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGAGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATG < 2:7281023/150‑1 CAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGC < 1:7669499/150‑1 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1:10223251/1‑150 AGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCGGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCC > 1:4734985/1‑150 AGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCC > 2:6975150/1‑150 AGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCC > 2:2688352/1‑150 AGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCC > 2:9825431/1‑150 AGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCC > 1:10269156/1‑150 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1:4789459/1‑150 GACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCT > 1:5268787/1‑150 GACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCT > 2:6567056/1‑150 GACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCT < 1:2243445/150‑1 GACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCT < 1:6950644/150‑1 GACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCT < 1:6589098/150‑1 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2:7883089/1‑150 CCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATAC < 1:4908780/150‑1 CCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGA > 1:1904982/1‑78 CCTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGA < 2:1904982/78‑1 caGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACC > 1:3323379/3‑150 CTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACC > 1:2576199/1‑150 CTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACC < 2:4094902/150‑1 CTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACC < 2:2088241/150‑1 CTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGG > 2:4828110/1‑102 CTGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGG < 1:4828110/102‑1 CTGCCCGCCGT‑GAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC < 2:9575454/150‑1 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC > 1:8910440/1‑150 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC < 1:7669809/150‑1 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC > 1:9621512/1‑150 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC < 2:10408193/150‑1 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC > 1:5859892/1‑150 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC > 2:4314846/1‑150 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC < 2:3845983/150‑1 TGCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCC < 2:1445767/150‑1 GCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCC > 1:8966602/1‑150 GCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACACC > 2:6595364/1‑150 TCAGACAGCAGGCTGTTCAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCAGCGTTTCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/732143‑731990 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctgCCCGCCGTGGAATGGCTGACCTACGGCAGCGGTTACCTGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATACCCC > NC_000913/3621559‑3621707 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |