| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2700550 = | 478 (0.750) | 27 (0.050) | 17/236 | NT | 6.0% | noncoding (31/77 nt) | ohsC | sRNA antisense regulator of shoB toxin |
| ? | NC_000913 | 2700601 = | 440 (0.810) | intergenic (+5/+17) | ohsC/acpS | sRNA antisense regulator of shoB toxin/holo‑[acyl‑carrier‑protein] synthase 1 | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2700716‑2700550‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG > NC_000913/2700601‑2700749 GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACG < 2:10573831/150‑1GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACG > 2:7749003/1‑150GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACG < 2:384684/150‑1GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACG > 2:5300512/1‑150 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG < 1:3301644/150‑1 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG > 2:5240382/1‑150 CATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGG < 2:4127422/150‑1 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG > 1:783002/1‑150 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG > 1:2469758/1‑150 ATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGG < 1:5549851/150‑1 TTAACACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG < 2:3489627/150‑1 TTAAAACTGGCGGTAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCTCTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGTAAGTTAAATATAATACGGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCGCCGAACTGGTAAGGAAGGGGG > 2:8493627/1‑150 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTGTTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG > 2:6778528/1‑150 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG > 2:10829737/1‑150 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG > 2:820330/1‑150 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGG > 2:5957545/1‑150 TTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGGAAGGAACGGGG > 2:9868573/1‑150 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1:3024651/1‑150 GAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTT < 1:9104938/150‑1 AAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTA > 2:7339252/1‑150 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTCACGCTGGCGGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 2:2464471/150‑1 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 1:6504939/150‑1 AAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA < 2:1571022/150‑1 TGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTT > 1:3466652/1‑122 CACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGTTAAGGAACGGGGG > 2:8683984/1‑91 CACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGTTAAGGAACGGGGG < 1:8683984/91‑1 CTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTAC > 1:3285018/1‑90 TAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATGGGTAACTTTCAAGAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCAGCTGCCAGCGGTCCATGCA > 2:7279880/1‑150 CTCTTTAAAAAGTAAAAACCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCAAAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAG > 1:6064954/1‑150 AAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTC > 1:7736424/1‑150 AAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCC 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ACTTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGT < 2:9325688/150‑1 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCGATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 1:10909260/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCGATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 1:3075563/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTgt > 1:5953548/1‑148 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT < 2:8069694/150‑1 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 1:1261963/1‑150 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGG < 2:7492786/147‑1 TTTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGG > 1:7492786/1‑147 TTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATTTTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG < 1:10111560/150‑1 TTTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTG > 1:5242071/1‑150 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGC > 2:5891646/1‑150 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT > 1:2308118/1‑148 TTTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTT < 2:2308118/148‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC > 1:17186/1‑150 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC > 1:1607394/1‑150 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 1:3698804/150‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 1:5259422/150‑1 TTAAAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCC < 1:9168485/150‑1 TAAAGTGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGGATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGGATTTTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTATTGCCTCGCCCCATTGCCGTAGCCGTGGTTTGCCG > 2:3647222/1‑150 AAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG < 2:656955/150‑1 GCATTAAAACTGGCGGAAAAGCTGGGCGTTGCAAATATGCATGTAACGCTGGCAGATGAGCGGCACTATGCTTGTGCCACGGTAATTATTGAAAGTTAAAAATAATACCGTTCTCTTTAAAAAGTAAAACCCCCGAACTGGTAAGGAACGGGGGTTTTACTTTTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2700716‑2700550‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgggggttttactttttaaAGAGAACGGTATTATTTTTAACTTTCAATAATTACCGTGGCACAAGCATAGTGCCGCTCATCTGCCAGCGTTACATGCATATTTGCAACGCCCAGCTTTTCCGCCAGTTTTAATGCCTCGCCCCATAGCCGTAGCCGTGGTTTGCCGAG > NC_000913/2700601‑2700749 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |