Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,325,042 | Δ1 bp | 7.7% | coding (287/1323 nt) | atoE → | short chain fatty acid transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,325,042 | 0 | A | . | 7.7% | 182.5 / 10.1 | 65 | coding (287/1323 nt) | atoE | short chain fatty acid transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/29); new base . (3/2); total (34/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.78e-01 |
GAAAATGTGGGGTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGCCTACATTG > NC_000913/2324896‑2325191 | gAAAATGTGGGGTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAggg < 1:406150/150‑1 (MQ=255) aTGTGGGGTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTGGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTc < 2:43160/150‑1 (MQ=255) gggTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCCTCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCt < 1:555096/150‑1 (MQ=255) gggTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCCTGTAC‑GGGCGTctttgc < 2:913399/150‑6 (MQ=255) gTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCCTGTAC‑GGGCGTctttgcgg < 2:216858/150‑8 (MQ=255) gTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGGTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTgg < 1:163843/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCAc > 2:342435/1‑150 (MQ=255) ggTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACt > 1:611390/1‑150 (MQ=255) tCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTttct > 2:1132816/1‑150 (MQ=255) cTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTttctt > 2:1037771/1‑150 (MQ=255) tGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTttcttc < 1:687036/150‑1 (MQ=255) gAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCgg < 1:783235/150‑1 (MQ=255) aagttGCTGGCGTTTGGTAGGCAGATGGCGCTTATCATGGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCGGGTGATAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTGCGCCGTAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGt < 2:76706/147‑1 (MQ=255) cTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTc < 2:1289760/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTc > 2:1082004/1‑150 (MQ=255) ggTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTGGTGtc > 1:810312/1‑150 (MQ=255) aTGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCCTGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtcatc < 2:545111/150‑1 (MQ=255) tGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGtcatca < 2:426942/150‑1 (MQ=255) cTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCGCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAttt < 1:1061637/150‑1 (MQ=255) tcatcGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAtttggtt > 2:256067/1‑150 (MQ=255) tcatcGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAtttggtt > 2:1067143/1‑150 (MQ=255) catcGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCGCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAtttggttt > 1:707575/1‑150 (MQ=255) aacGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTAAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAtttggtatt > 1:477686/3‑147 (MQ=255) cGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATtttgtttggt < 1:1037316/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATttggtttggt < 2:357246/150‑1 (MQ=255) cGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGGGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATttggtttggt < 2:334907/150‑1 (MQ=255) ttACCGGTCAGGCCCTTGCCAGCTCTGCGCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTAATGCTGGTCACTTTCTTCGGTGCAGTCGCTTGGGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTg < 2:96940/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTc < 1:1227841/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTc < 1:311273/150‑1 (MQ=255) ccGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGAGTTGGTGTGGTTGTCg > 1:634548/1‑150 (MQ=255) ccGGTCATGCCCTTGCCAGCGCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCg < 2:263415/150‑1 (MQ=255) cGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCGCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCATCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCgg < 1:538940/150‑1 (MQ=255) gcATGCCCTTGCCAGCGCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGgcgc < 1:1113222/149‑1 (MQ=255) cATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCa > 1:1242676/1‑150 (MQ=255) cATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCa < 2:10963/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAAt > 1:707735/1‑150 (MQ=255) cccTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGt > 1:800399/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTGGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGtt > 1:32256/1‑150 (MQ=255) ccTGGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGtt < 1:563464/150‑1 (MQ=255) tggCCAGCTCTGCTCCGTTGAAAAGGTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTg < 1:1082868/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGc < 2:1211235/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCg > 2:222109/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTc < 1:121642/150‑1 (MQ=255) cTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCg > 1:507338/1‑150 (MQ=255) gTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCgg > 2:189982/1‑150 (MQ=255) aaaGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACTGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTGAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAg > 2:650988/1‑150 (MQ=255) aaaGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCAGTGAAGTCGCCCGGCGAg > 2:1128613/1‑150 (MQ=255) ctgcGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATAAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGt > 1:947808/1‑150 (MQ=255) gcGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGGTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCGCCGGttg > 1:491358/1‑149 (MQ=255) tGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTCCAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCGTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCATTGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTa > 1:186201/1‑150 (MQ=255) ccgcAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCa > 2:1032092/1‑150 (MQ=255) ccgcAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGCCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCa > 1:800481/1‑150 (MQ=255) cAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTg < 2:707575/150‑1 (MQ=255) catgACGCCCTGTAC‑GGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGc > 1:439407/4‑150 (MQ=255) catgACGCCCTGTAC‑GGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGc > 1:667013/4‑150 (MQ=255) atgACGCCCTGTAC‑GGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGcc > 2:346505/3‑150 (MQ=255) aaGACGCCC‑GTACAGGGCGGCATGCTGGTCACGTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGcc < 1:36156/150‑1 (MQ=255) gACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTg < 1:1132816/150‑1 (MQ=255) aCGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTgc > 2:388435/1‑150 (MQ=255) cGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTgcg > 1:385802/1‑150 (MQ=255) gCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCACGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTgcgc > 1:672316/1‑150 (MQ=255) ccc‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGcc > 1:996017/1‑150 (MQ=255) ccc‑GTACAGGGCGTCATGCTGGGCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGCTGTTGGCGAAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCACCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGcc < 1:557344/150‑1 (MQ=255) cc‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGCCt > 2:1287165/1‑150 (MQ=255) cc‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGAGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGCCt > 1:701736/1‑150 (MQ=255) aGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGCCAACATTg > 2:1205955/1‑150 (MQ=255) | GAAAATGTGGGGTGACGGTTTCTGGAACTTGCTGGCGTTTGGTATGCAGATGGCGCTTATCATCGTTACCGGTCATGCCCTTGCCAGCTCTGCTCCGGTGAAAAGTTTGCTGCGTACTGCCGCCTCCGCCGCAAAGACGCCC‑GTACAGGGCGTCATGCTGGTCACTTTCTTCGGTTCAGTCGCTTGTGTCATCAACTGGGGATTTGGTTTGGTTGTCGGCGCAATGTTTGCCCGTGAAGTCGCCCGGCGAGTCCCCGGTTCTGATTATCCGTTGCTCATTGCCTGCGCCTACATTG > NC_000913/2324896‑2325191 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |