| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 997163 = | 71 (0.930) | 5 (0.070) | 5/268 | NT | 6.9% | coding (350/576 nt) | ssuE | NAD(P)H‑dependent FMN reductase |
| ? | NC_000913 | 997205 = | 66 (0.900) | coding (308/576 nt) | ssuE | NAD(P)H‑dependent FMN reductase | |||||
TTCTAGCGCGGTATCAAGACGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGCACCGGAATAGGCGGCTTTATACACAGGCGTGGCGACAATCAGCCCATCG > NC_000913/997015‑997312 | ttCGAGCGCGGTATCAAGACGGGTTTGCAGATTTGGCGGGAACTGGGGTCTGTGATGGTTATCAATTACTTGTGAGTCATCGGAAAACTCTCCGTGCAGTATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGAc < 1:420419/150‑1 (MQ=255)gtccggcactcaagaccttcaccgaacagctgcaacaggccgaagggctgaatgtcgccacgcctgtgtataaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaacgcgctttgcaaggcaaagtcgtgctAc < 1:869590‑M1/2‑1 (MQ=255) gccggcactcaagaccttcaccgaacagctgcaacaggccgatgggcagattgtcgccacgcctgcgtataaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaacgcgctttgcaaggcaaagtggtgctAcc > 1:637320‑M1/148‑150 (MQ=255) ccggcactcaagaccttcaccgaacagctgcaacaggccgatgggctgattgtcgccacgcgtgtgtataaagccgcctattccggtgcgtggaaaaccctgctcgaccttctgccagaacgcgctttgaaaggcaaagaggtgctACCg < 2:72388‑M1/4‑1 (MQ=255) aGCGCGGTATCAAGACGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGcc < 2:348124/150‑1 (MQ=255) cgcgGTATCAAGACGGGGTTGCAGATTTGGCGGGAACTGGGGTCTGGGATGGTAAGCAATTACTTGTGAGTCCTCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCcag < 2:81654/150‑1 (MQ=255) gTATCAAGCCGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTTGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGa < 2:763966/150‑1 (MQ=255) cAAGACGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCTCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATggg > 1:864043/1‑150 (MQ=255) aGACGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCTTCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGcc < 1:1062742/150‑1 (MQ=255) acgtggttGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGGCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCAc < 1:821686/144‑1 (MQ=255) ggTTTGCAGAATTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGt < 2:32666/150‑1 (MQ=255) gTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTa > 1:613108/1‑150 (MQ=255) ttGGCGTGACCTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCg < 1:237509/150‑1 (MQ=255) ggCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGcc > 2:1155539/1‑150 (MQ=255) cGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAg > 1:307774/1‑150 (MQ=255) gccgatgggctgattgtcgccactcctgtgtataaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaacgcgctttgcaaggcaaagtggtgctACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCg > 1:755112‑M1/111‑150 (MQ=255) aaCTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGt < 1:725262/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCCCGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAg > 2:112988/1‑150 (MQ=255) cTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAg > 2:1224548/1‑150 (MQ=255) atgggctgattgtcgccacgcctgtgtataaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaacgcgctttgcaaggcaaagtggtgctACGGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAg > 1:875414‑M1/107‑150 (MQ=255) tgggctgattgtcgccacgcctgtgtataaagccgcctattcctgtgctttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaccgcgctttgcaaggcaaagtggtgctACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACGGCCCGTCGCCAGCGGTAGc > 2:648465‑M1/106‑150 (MQ=255) tGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGCTGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGc > 1:205810/1‑150 (MQ=255) ggggTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCTGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGAATTATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGca < 2:688540/150‑1 (MQ=255) ggggTCTGTGATGGTAAACAATTAGTTGGTAGTCATCGGCAACCAGGCCGTGCAGTATCTCCTGAGCTTGCAGTGCGCTGAAACCGGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGACACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGca < 2:795308/150‑1 (MQ=255) gggctgattgtcgccacgcctgtgtataaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgctcgacctgctgccagaacgcgctttgcaaggctaagtggtgctACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGca > 2:479527‑M1/105‑150 (MQ=255) ggTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCACCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGGTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCAACGGTACCGCCTGTCGCCAGCGGTAGctcc > 2:798519/1‑150 (MQ=255) gctgattgtcgccacgcctgtgtaaaaagccgcctattccggtgcgttgaaaaccctgcgcgacctgcggccagaacgcgcttagcaaggcaaagtggtgctACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGcacc > 1:635856‑M1/103‑150 (MQ=255) gtgATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACttt > 2:585750/1‑150 (MQ=255) 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tCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCaaa < 1:376440/150‑1 (MQ=255) cAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAg > 2:179721/1‑150 (MQ=255) aTTACTTGTGAGTCATCGTCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAgcg < 2:167430/150‑1 (MQ=255) aTTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAgcg < 1:278581/150‑1 (MQ=255) ttACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCAAGGCAAAgtgg < 1:328488/150‑4 (MQ=255) accTTGCGAGTCATCTGCAAACACGCCGTGCTGTATCACCGTATCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTATCAGCGCATAATCGACCGCCAGCAGACGGGCCACGGAACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCGCTTTGCCAGGCAAAgtggt < 2:633197/148‑5 (MQ=255) tgtgAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCCCCACTATGCCTTGCCAAGCGCGTTCt > 1:1014195/1‑150 (MQ=255) tgAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCCCTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTgg > 1:970452/1‑150 (MQ=255) gAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGgc > 2:713680/1‑150 (MQ=255) cAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAACGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCgc > 2:1093775/1‑149 (MQ=255) 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ggATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACg > 2:778772/1‑150 (MQ=255) gATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAACCTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCCCCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGc > 1:528979/1‑150 (MQ=255) tctcCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCAAGCTGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGCAc > 1:12462/1‑150 (MQ=255) ctcCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCACAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGGTTTCAACGCAcc > 1:759691/1‑150 (MQ=255) tcCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACAACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGCACCg > 2:1098212/1‑150 (MQ=255) 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ACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGCACCGGAATAGGCGGCTTTATACACAGGCGTGGCGACAATCAGCCCATCg > 2:751504‑M1/1‑150 (MQ=255) | TTCTAGCGCGGTATCAAGACGGGTTTGCAGATTTGGCGTGAACTGGGGTCTGTGATGGTAATCAATTACTTGTGAGTCATCGGCAAACACGCCGTGCAGGATCTCCTGAGCTTTCAGTGCGCTTAAAACTGGTTTAAGGGCATAATCGACCGCCAGCAGATGGGCCACGGTACCGCCCGTCGCCAGCGGTAGCACCACTTTGCCTTGCAAAGCGCGTTCTGGCAGCAGGTCGAGCAGGGTTTTCAACGCACCGGAATAGGCGGCTTTATACACAGGCGTGGCGACAATCAGCCCATCG > NC_000913/997015‑997312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |