New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2094274 = | 73 (0.960) | 5 (0.070) | 5/262 | NT | 7.1% | coding (807/1068 nt) | hisB | histidinol‑phosphatase and imidazoleglycerol‑phosphate dehydratase |
? | NC_000913 | 2094336 = | 62 (0.860) | coding (869/1068 nt) | hisB | histidinol‑phosphatase and imidazoleglycerol‑phosphate dehydratase |
GTCAAAGGCGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGAAAACCAAAG > NC_000913/2094125‑2094422 | ctggcgcagggtgcgaccaaatgctttgaacagaatctctacacggtgatgatcgtttttacctttggttttcaggtgtagcgtcacgcccatggtgtatgagagcgaacggaagaagtgctcgatcatttcggtgctgagatcgcccac > 2:285392‑M1/150‑150 (MQ=255) tCAAAGGCGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTgcg > 1:916507/1‑150 (MQ=255) aaaGGCGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTAGTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGCTGGACGAATGCCTTGCCCGCTgcgcg > 2:539070/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTg < 1:525187/150‑1 (MQ=255) cGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGa < 2:824209/150‑1 (MQ=255) aCCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGata < 2:1201092/150‑1 (MQ=255) ccactATATCGACGATCACCACACCGTCGAACATACCGGACTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATAGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATATGCCGGATTGGTATAGTGCGACCGCTGGACGATTGACTAGCACGCAGCGAGCTGGatat > 2:1196211/4‑150 (MQ=255) tctATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCTATGGCCGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATAtct > 2:233420/1‑150 (MQ=255) ccaaaggctttgaacagactctctacacggtgatgatcgtttttacctttggttttcaggtgtagcgtcacgcccatggtgtatgagagcgaacggaagaagtgctcgatcatttcggtgctgagatcgcccaCGCGCTGGATATCTCTg < 1:1163273‑M1/17‑1 (MQ=255) atatCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTg < 2:1009590/150‑1 (MQ=255) tatCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTgg < 2:623811/150‑1 (MQ=255) tatCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAAACGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTgg < 2:619835/150‑1 (MQ=255) atCGCCGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGt < 2:1208251/150‑1 (MQ=255) atCGACGATCACCACACAGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAATCGCTAAAAATCGCCCTCTGAGACAACCGAGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGt < 2:506067/150‑1 (MQ=255) cgacgaTCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCg > 1:1049433/1‑150 (MQ=255) cgacgaTCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCg < 1:1104558/150‑1 (MQ=255) gacgaTCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGc > 1:446085/1‑150 (MQ=255) acgaTCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGATGCGCTAACAATCGCCCTCGGAGACTAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGcc < 1:113454/150‑1 (MQ=255) 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cgcTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATTGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTtacctacc < 1:1061610/150‑1 (MQ=255) ttttacctttggttttcaggtgtagcgtcacgcccatggtgtatgagagcgaacggaagaagtgctcgatcatttcagtgctgagttcgcccaCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCa > 1:1241939‑M1/94‑150 (MQ=255) cTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCTGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAg < 2:843904/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAg < 1:1125626/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAg > 2:732984/1‑150 (MQ=255) 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atcgcTAAAAATATCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGATACCGATTTAAGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCACACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTggg < 2:209580/148‑1 (MQ=255) ggttttcaggtgtagcgtcacgcccatgttgtatgagagcgaacggaagaagtgctcgatcatttcggtgctgagatcgcccaCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGTGTGGGc > 1:197536‑M1/84‑150 (MQ=255) gcgcTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGc > 1:395462/1‑150 (MQ=255) cgcTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGGCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCg < 1:929932/150‑1 (MQ=255) cTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCgtt > 1:940565/1‑148 (MQ=255) 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ggACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCCCCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGAc > 1:922311/1‑150 (MQ=255) ggACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGAc < 1:22752/150‑1 (MQ=255) ggACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGGCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGAc < 2:1175008/150‑1 (MQ=255) aCGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGc < 2:100775/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTac < 1:301715/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTac < 2:738352/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGACGAGTTTACCTACCAGCGCGTCGGCCATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGCCGCTTCAcc > 2:1260874/1‑150 (MQ=255) gCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGGGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGaaa < 2:346330/150‑1 (MQ=255) cGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGAAAAcc < 2:1149196/150‑1 (MQ=255) gcgctcTTGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTTGAATATAGAGCCGAGGTTACCTACCAGCGCGGGGGCGATNTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTNCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGAAAACCaaac < 1:839859/150‑2 (MQ=255) gcgcgcTGTATATCTCTGGTGGGCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTTCCAGCGCGTTGGCGATCTCAGCACCTAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCTTGGGAGTGACGCTACACCTGAAAACCAAAg < 1:655438/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATAAAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGAAAACCAAAg < 1:655436/150‑1 (MQ=255) | GTCAAAGGCGACCTCTATATCGACGATCACCACACCGTCGAAGATACCGGCCTGGCGCTGGGCGAAGCGCTAAAAATCGCCCTCGGAGACAAACGCGGTATTTGCCGCTTTGGTTTTGTGCTACCGATGGACGAATGCCTTGCCCGCTGCGCGCTGGATATCTCTGGTCGCCCGCACCTGGAATATAAAGCCGAGTTTACCTACCAGCGCGTGGGCGATCTCAGCACCGAAATGATCGAGCACTTCTTCCGTTCGCTCTCATACACCATGGGCGTGACGCTACACCTGAAAACCAAAG > NC_000913/2094125‑2094422 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |