| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3022580 | 84 (1.100) | 4 (0.060) | 4/262 | NT | 5.0% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | NC_000913 | = 3022637 | 72 (1.000) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCGATGCCGATGTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTCCGCT > NC_000913/3022433‑3022729 | ccgatgccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATACCTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTCTGGACGGCGCTCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACGCAGTTACCTTGGCACTTACGCCGACAgg > 2:1166541/1‑150 (MQ=255)ccgatgccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:548860/1‑150 (MQ=255) cgatgccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATAGCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGt < 2:905933/150‑1 (MQ=255) gatgccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCCGCAGTGCCCGACTGATACACAGATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTAGGGTTAGCCACGCCTCCCCCCAGGTACCATGGCACTTACGCAGCCTGGTc > 1:807101/1‑150 (MQ=255) gccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTATACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcg > 2:637922/1‑150 (MQ=255) ccgatgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcacgc > 2:640036/1‑150 (MQ=255) atgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCCCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc > 2:802431/1‑150 (MQ=255) atgTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc > 2:386886/1‑150 (MQ=255) tgtgATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCt < 2:147184/150‑1 (MQ=255) tgATCATTGAGCGAACCTATAACTCACCGCAAGCGCCGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCCTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTAATCAACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCg < 2:220878/150‑1 (MQ=255) gATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATATGATTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATACACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGt > 1:819609/1‑150 (MQ=255) cATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTggg < 2:467366/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGGATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:940405/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCa < 1:116275/150‑1 (MQ=255) tGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCAt < 1:386886/150‑1 (MQ=255) tGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCAt < 1:802431/150‑1 (MQ=255) gAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATg > 2:371624/1‑150 (MQ=255) gAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATg < 2:393288/150‑1 (MQ=255) 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gCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGt < 2:891527/150‑1 (MQ=255) aGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 2:455380/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt < 1:531345/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCGCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt < 2:369622/150‑1 (MQ=255) cgcAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAttt > 1:964224/1‑149 (MQ=255) gcagcaGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgagg < 1:1288823‑M1/150‑49 (MQ=255) gcagcaGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTaa < 1:371445/150‑1 (MQ=255) gcagTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:641316/1‑150 (MQ=255) cagTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAagag < 2:368465/150‑1 (MQ=255) gCCCGACTGAAACACATATCTGCTATACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAATGTTCATGTCTTTAAAGAGCGAg > 1:796056/1‑150 (MQ=255) 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gCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTcc > 1:427709/1‑150 (MQ=255) cACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcgtaagtgccatggtacctgggtggaggcgtggataaccagacgatcgccgtccatacgagtaaagcagatat < 1:544026‑M2/150‑80 (MQ=255) cTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGATCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGAGCCTGGGCATCCTGCGTGACAGGGCGTCCGGt > 1:117685/1‑150 (MQ=255) tACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGtcc > 1:274226/1‑148 (MQ=255) tACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTAc > 2:1075156/1‑150 (MQ=255) aCGCCGCCAGGTCGCGCGACTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAGTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCATGATGGAAGAATTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACt > 2:606894/1‑150 (MQ=255) gcctccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTAATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcgtaagtgccatggtacatgtctggaggcattgataaccagacgatcgcagtaaataagagtaaagcagatatgagtttc < 2:927129‑M2/150‑87 (MQ=255) cccgccAGCTCGCGCGCCTCGCGGGCATGACACACCATAAAGCTCATGTCATTAACGAGCGAGTAGGCGGCGGTCTTTGTACCACCCAGGACATCCTGCAGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGAGACCGGGCGTCCGGTACTGt < 2:619863/149‑1 (MQ=255) ccgccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgtaagtgccatggtacctgggtggaggcgtggataaccagacgatcgccgtccatacgagtaaagcagatatgtgtttca > 2:1129143‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGtt > 1:278604/1‑150 (MQ=255) cgccAactctctctttaatgacatgaactttatgcagtttcatgcccacgcggcgcgcgacctggcggcgtaagtgccatggtaccttggtggaggcgtggataaccagacgatcgccgtccatacgagtaaagcagatatgtgtttcag < 2:637587‑M1/150‑146 (MQ=255) cgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGACATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTc > 2:1000853/1‑150 (MQ=255) cgccAGGTCGCGCGACTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGATCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTc < 1:48251/150‑1 (MQ=255) cgccAGGGCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTc < 1:977707/150‑1 (MQ=255) gccAacgcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgaccacgatgcgcgcgacctggcgtcgtaattgccatggtaactgggtggaggcgtggataaccagacgatcgccgtccatacgagtaaagcagatatgtgtttcagt < 1:1133324‑M1/150‑147 (MQ=255) aactcgctcttaaatgacatgaacttaatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgtaagtgccatggtacctgggtggaggcgtggataaccagacgatcgccgtccatacgagtaaagcagatatgtgtttcagtcgg < 2:360340‑M1/150‑150 (MQ=255) aGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTCCGCt > 1:1069530/1‑150 (MQ=255) | CCGATGCCGATGTGATCATTGAGCGAACCTATAACTCAACGCAAGCGCAGCAGTGCCCGACTGAAACACATATCTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGTTTTGGTTCCAAACAGGACATCCTGCTGGAAGAAGTGTGCGCCTGGGCAACCTGCGTGACCGGGCGTCCGGTACTGTTCCGCT > NC_000913/3022433‑3022729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |