New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 780511 = | 86 (1.130) | 4 (0.060) +AAAAAGT |
4/264 | NT | 6.0% | intergenic (+122/‑43) | ybgF/lysT | periplasmic TolA‑binding protein/tRNA‑Lys |
? | NC_000913 | 780843 = | 45 (0.590) | noncoding (1/76 nt) | lysW | tRNA‑Lys |
CGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG > NC_000913/780695‑780987 | cGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGATGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTCATTAGCTCAGCTGGGACAGCACCGCCCTAACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGCTCCCGGCATCCCCCACCAC‑Cgg > 1:515517/1‑150 (MQ=21) tgaCGTAGTCGAGTCATCCTGCACGAACCACCTCTAACATAGTTTGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGGCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGt < 1:103576/149‑1 (MQ=18) agccGAAGTCGAGGCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGAAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGt < 2:173378/147‑1 (MQ=255) aCGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCg < 1:602185/150‑1 (MQ=255) gTCTAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGc < 1:784619/150‑1 (MQ=255) gTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGc < 1:701803/150‑1 (MQ=255) aGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTTGTATCGGGGGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGAGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAg < 2:1097986/150‑1 (MQ=255) tCCTGCACGACCCACCACAAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt < 2:372123/150‑1 (MQ=255) ccTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTTGTTAGCTCAGTTGGTa < 1:558280/150‑1 (MQ=255) aCCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTg < 2:108580/140‑1 (MQ=255) aCCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTg > 1:108580/1‑140 (MQ=255) actatgttagttGTAGTATCCAGCCTATTATCGGGTGATTATCTCAGCTGGGATAGCACCTCCCTTACCAGGAGGGGGGCGGCGGTTGGATCCCGTCATCACCCACCACTCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAAt < 2:202501/145‑1 (MQ=11) agttagttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAtt < 2:401939/150‑1 (MQ=40) agttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CCGGTCGTTATCTCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTAATCAATTTGta > 2:1093946/1‑149 (MQ=255) agttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGAACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTc > 1:441064/1‑150 (MQ=38) gttGTAGTATCCAGCGTATTATCGTGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCg < 2:198945/150‑1 (MQ=255) gttGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGGTCGATCCCGTCATCCCCCACCAC‑GGGGTACTTAGGTCAGGTGGGTGTGGCGTTGGGGTTTAATCCATTGGtag > 1:186807/1‑148 (MQ=11) gtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTAGTTAGCTGAGTTGGTAGAGCAGTTGCCTTTTTATCAATTGGTAGCACGtt > 1:714397/1‑150 (MQ=11) gtaTCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑AGGGTCGTTAGGTCAGTTGGTATAGGAGTTTTCGTTTAATAAATTTGTCGGAGGtt > 1:709943/1‑150 (MQ=11) tCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGa < 1:441468/150‑1 (MQ=35) gatgtaTCGGGTTTTTAGGTCACCTGGAATAGCACCTCCTTTACAAGTTGGGGGTCGGGGTTTCTTTCCCGACTTAACCCACCAA‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTg < 2:714397/147‑1 (MQ=11) taTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACg < 2:702683/150‑1 (MQ=33) aTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGa < 2:40369/150‑1 (MQ=33) aTCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑ACGGTACTTAACTAAGTTGGTATAGCAGTTGACTTTTAATAAATTGGTACCAAGTTACAATGCAGCACGa > 2:659563/1‑150 (MQ=11) gggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAAATGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCCCGAccc > 2:224773/1‑150 (MQ=18) ggTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCGCAGTTGGTTGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCTGCACGAcccc > 1:309798/1‑149 (MQ=255) tGATTAGCTCTGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACATTTAATCAATTGGTCGCAGGTTAGAAACCTGCACGACccacc > 2:1209063/1‑150 (MQ=255) gCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCCCCCACCAC‑CGGGTCGGTAGCTCAGTTGGTATAGCAGTTGACTTTTTATAAATTGGTCGCAGGTTCGAATACATCACGACccaccaaagtt > 2:1228367/1‑145 (MQ=11) cAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCCGTTGGGAGAGCAGTTGACTTTTTATCAATTGGTCGCAGGTTCGCATGCTGCACGCCCCACCAGTTTTAAc > 1:932293/1‑150 (MQ=11) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCg < 2:1020064/150‑1 (MQ=21) tGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCg < 2:408223/150‑1 (MQ=21) ggAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGaa < 1:728366/150‑1 (MQ=35) gagaGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAg > 2:804872/1‑150 (MQ=37) ccTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGAtt > 1:1030605/1‑149 (MQ=255) cTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGt > 2:688754/1‑150 (MQ=40) cTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAg < 1:557208/150‑1 (MQ=40) tttcgttgctttcggtttgtttgatatcccgtggcaacgaaaaagtGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACttt > 1:61201‑M2/47‑81 (MQ=255) tttcgttgctttcggtttgtttgatatcccgtggcaacgaaaaagtGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACttt < 2:61201‑M2/35‑1 (MQ=255) tACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAgag > 2:807004/1‑148 (MQ=255) cAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCgtg > 1:828029/1‑150 (MQ=40) cAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTAGTTATCTCATTTGGTAGAGCAGTTGAATTTTAATAAATTGGTAGCAGGTTCGAATCCAGGACGACCCACCAGTATTAAAAAAAAAAACAGATTTTAAGCgtg > 2:666594/1‑150 (MQ=11) cgttgctttcggtttgtttgatatcccgtggcaacgaaaaagtGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGa < 1:42992‑M2/96‑1 (MQ=255) cgttgctttcggtttgtttgatatcccgtggcaacgaaaaagtGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGa > 2:42992‑M2/44‑139 (MQ=255) caggGGGTCGGCGGTTCGATCCAGTTATCACCCAGCAC‑ATGTGCGATAGCTCAGTTGGTAGTGCAGTTGACTTTTAATCTTTTGTGCTCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAgg < 1:908787/149‑1 (MQ=14) ggcggTTCGTTCCCGTCATCACCCACCCA‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCTGTTGTCTTTTAATCAATTGTTCGAAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTg < 1:1148372/150‑1 (MQ=14) cggTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCg > 2:1304586/1‑150 (MQ=255) aTCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCaa > 1:707602/1‑150 (MQ=255) cacccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAcc > 1:1256338/1‑82 (MQ=37) cacccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGAcc < 2:1256338/82‑1 (MQ=37) cacccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAACACCGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGGCAGCAACGGCCCGTAg > 1:1157148/1‑150 (MQ=255) acccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGAAGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACTGCCCCTAgg > 2:859491/1‑150 (MQ=255) cccaccAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATAGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAggg > 2:944629/1‑150 (MQ=255) ccac‑cGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAACACAGATGTTAAGCGTGTACGATAACGTTTCGACAGCAACGGCCCGTAGGacgaa > 1:637465/1‑149 (MQ=11) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGa < 1:271991/89‑1 (MQ=32) gggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGa > 2:271991/1‑89 (MQ=32) | CGAGACGAAGTCGAGTCATCCTGCACGACCCACCACTAACATAGTTAGTTGTAGTATCCAGCGTAGTATCGGGTGATTAGCTCAGCTGGGAGAGCACCTCCCTTACAAGGAGGGGGTCGGCGGTTCGATCCCGTCATCACCCACCAC‑CGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCGAAGACAGATGTTAAGCGTGTAGGATAACGTTGCGTCAGCAACGGCCCGTAGGGCGAG > NC_000913/780695‑780987 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |