| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3336053 | 50 (0.660) | 3 (0.040) | 3/262 | NT | 6.1% | coding (442/1260 nt) | murA | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 3336086 | 46 (0.640) | coding (409/1260 nt) | murA | UDP‑N‑acetylglucosamine 1‑carboxyvinyltransferase | |||||
GCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGAAGCACGCATGGTTT > NC_000913/3335941‑3336232 | gCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGTCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatg > 1:1124228‑M2/1‑146 (MQ=255)gCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatg > 1:279468‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTTCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatgg < 2:797910‑M2/150‑6 (MQ=255) cGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatgg > 2:150136‑M2/1‑145 (MQ=255) cGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatgg > 2:308907‑M2/1‑145 (MQ=255) cGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatgg > 2:313828‑M2/1‑145 (MQ=255) tttCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatggtcg > 1:1218291‑M2/1‑142 (MQ=255) ttCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGCCCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTcgc > 1:1245887/1‑150 (MQ=255) aataatCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGcc < 1:990128/150‑1 (MQ=255) ataatCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCt < 1:565926/150‑1 (MQ=255) taatCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCGGTTTGATGGTCGCGCCTa > 2:45421/1‑150 (MQ=255) taatCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTa > 2:163581/1‑150 (MQ=255) atCGTGGTGCCGTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCCTCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAAt < 2:1218940/150‑1 (MQ=255) cGTGGTTCCTTCCGCCAGGGGTTCAGCACACATGATGGTCACCTTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCCACGGAAGCTTTATCGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTg < 2:71861/150‑1 (MQ=255) tggtgCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGCCCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTTAGTGtt > 1:950656/1‑150 (MQ=255) ccTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGGCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAgg < 1:892167/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGc < 2:1080598/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGcc < 2:1127519/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGcc < 1:544536/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGGGGTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAACCGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGcc < 1:96191/150‑1 (MQ=255) atCCGCCAGGGTTGCAGCACACTTGATGGGCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGcc < 2:546597/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGaa > 1:517531/1‑150 (MQ=255) ccAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGaaa < 1:1164602/150‑1 (MQ=255) gggTTGCACCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGAAATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTCATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAAagt > 1:1285520/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTTTCCATCACGATTTGTGCACCTTTCAAACTTCCATCGACGGAAGCTTTATCGTTACCTTCTTGCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTa < 1:713063/150‑1 (MQ=255) agcaCACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATc < 1:1278224/150‑1 (MQ=255) cacaTGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCTAcc > 1:1287284/1‑150 (MQ=255) acaTGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCGGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCg < 1:45421/150‑1 (MQ=255) acaTGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCg < 1:163581/150‑1 (MQ=255) tgGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAANCGACCATCGAAGGAAGCNTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGAcgcg > 1:1050402/1‑150 (MQ=255) tCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCAc < 1:472484/150‑1 (MQ=255) cACCGTTGCGCCCACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCAGCTTTCAAACGACCATCGACGGCAGCTTTAACGTAACCATCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCAcc < 2:489120/150‑1 (MQ=255) gcCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACa < 2:50198/150‑1 (MQ=255) cAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGAACGTACAAc > 1:276078/1‑150 (MQ=255) cGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCCCCGATCGTACAACCGc > 1:927663/1‑150 (MQ=255) ccTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTACCAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCATCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGcc < 2:1023182/149‑1 (MQ=255) gACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAgg < 1:681302/150‑1 (MQ=255) gACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAgg < 1:1275953/150‑1 (MQ=255) cATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGATGCCAGAAATGTGTAGATCACCCGGAAGCGCACCGATATTACAAACGCCAGGTAGTGAAAc > 2:1147521/1‑150 (MQ=255) cATCACGATATGTGCACATTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAAc < 2:1054648/150‑1 (MQ=255) cGATATGTGCACCTTTCAAACGAGCATCGACGGTAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGcc < 2:650580/150‑1 (MQ=255) cGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGcc < 2:1103683/150‑1 (MQ=255) atatGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGcccc < 2:1209441/150‑1 (MQ=255) gtgCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGAc < 1:372336/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAg < 2:972104/150‑1 (MQ=255) cTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatggtcgtttgaaaggtgcacatatcgtgatggataaagtcagcgttggcgcaacggtgaccatcatgtgtgctgcaaccctggcggaaggcaccacgat < 1:387534‑M2/150‑102 (MQ=255) aaCGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatggtcgtttgaaaggtgcacatatcgtgatggataaagtcagcgttggcgcaacggtgaccatcatgtgtgctgcaaccctggcggaaggcaccacgattattga < 1:1292745‑M2/150‑108 (MQ=255) cgcccATCGCCGGAAGCTTTAACGTATCCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCATAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTAcc < 2:131020/147‑1 (MQ=255) cGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTgatggtcgtttgaaaggtgcacatatcgtgatggataaagtcagcgttggcgcaacggtgaccatcatgtgtgctgcaaccctggcggaaggcaccacgattattgaaa < 1:1046521‑M2/150‑110 (MQ=255) aCCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTTATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAg < 2:1214149/150‑1 (MQ=255) tCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCATCCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGc < 1:456774/150‑1 (MQ=255) tCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGc < 1:652260/150‑1 (MQ=255) tCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGc < 1:864713/150‑1 (MQ=255) aCGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGcccc > 2:1085016/1‑150 (MQ=255) tttAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCACGCTGAACCCCAAATCAATAAAAAAAAAAATGTAGTGAAACTTGCGCCTGCCCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCa > 2:532609/1‑150 (MQ=255) tAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGa > 1:1261586/1‑150 (MQ=255) tAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGaa < 1:811139/150‑1 (MQ=255) ccTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCTTACAACCTCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGAAGcc > 2:1310893/1‑149 (MQ=255) ttcttcCAGTTTGATGGTAGCGTCTTATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACTGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCGAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGAAGCACg < 1:625512/150‑1 (MQ=255) gTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCTGAACCCCAACTAAATAAAAAAAAACAGGTTGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGAAGCACGCATGGttt > 2:518065/1‑150 (MQ=255) | GCGTTTTCAATAATCGTGGTGCCTTCCGCCAGGGTTGCAGCACACATGATGGTCACCGTTGCGCCAACGCTGACTTTATCCATCACGATATGTGCACCTTTCAAACGACCATCGACGGAAGCTTTAACGTAACCTTCTTCCAGTTTGATGGTCGCGCCTAATTGTTCGAGGCCAGAAATGTGTAGATCAACCGGACGCGCACCGATCGTACAACCGCCAGGTAGTGAAACTTGCCCCTGACCAAAGCGCGCTACCAGCGGCCCCAGCGCCCAGATAGAAGCACGCATGGTTT > NC_000913/3335941‑3336232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |