New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4321065 | 101 (1.320) | 3 (0.040) | 3/270 | NT | 2.9% | coding (183/585 nt) | phnH | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
? | NC_000913 | = 4321100 | 102 (1.380) | coding (148/585 nt) | phnH | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
TCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAGGGTCA > NC_000913/4320952‑4321246 | tCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCGGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTg > 1:406566‑M2/1‑149 (MQ=255) cATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCCGCACGCTgg < 2:550736‑M2/150‑3 (MQ=255) cggcACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTAGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCtggtggc < 1:520966/147‑2 (MQ=255) 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ccGGCGTGTAGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCt < 2:61407/150‑1 (MQ=255) gtgtCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACg > 1:221809/1‑150 (MQ=255) gtCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACggg < 1:551049/150‑1 (MQ=255) gcGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGa < 1:101090/149‑1 (MQ=255) ttATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGc > 2:588024/1‑150 (MQ=255) tATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCa < 2:937927/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATaaa > 1:517516/1‑150 (MQ=255) cAGAGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGc < 1:537158/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCg < 1:524696/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAGCACGCTGGAGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGtt > 1:159474/2‑150 (MQ=255) tCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGCGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGttt > 1:934547/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGttt < 1:1168907/150‑1 (MQ=255) tCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGttt > 2:1009822/1‑150 (MQ=255) gagcagcACGCTGGTGGTGGGGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACATTCACGCACGGCTCGCTCTTGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTTCTGGGCATCCTTCACGGGAAGCATAATAGCGGTTTc < 2:216926/149‑1 (MQ=255) gcagcaCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCa < 2:1139381/150‑1 (MQ=255) cagcaCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAg < 1:720953/150‑1 (MQ=255) cgctcgcgGGGGGGGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGTGCTGATGCAGGGCGACCATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAACAGCGGTTACCAgg < 2:454176/146‑1 (MQ=255) agcaCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAgg < 2:1278330/150‑1 (MQ=255) gcaCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAggg < 1:1156886/150‑1 (MQ=255) caCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAGGGt < 1:197042/150‑1 (MQ=255) caCGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAGGGt < 2:551619/150‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAGGGTCa < 2:463354/150‑1 (MQ=255) | TCATCCGTCACCGCGAAGGTCGCCTGTTCCGGCTGGCTGACCAGCGGCGCGTTGGTATGAAAACGCAGGCTCTGGTTGACGATATCGTTATTTAATGGGGTAGAAAGCCACACCGGCGTGTCGTTATCGGCCAGCGTCAGCAGCACGCTGGTGGTGGCGATATTCAGCGGTTGCCAGCCGCGTTTGAGCTGATGCAGGGCGACAATCACGCCCGGCTCGCTCATGGCCTTTAACAGGCGACGAAAACTGTGCTGGGCATCCTGCACGGGAAGCATAAAAGCGGTTTCCAGGGTCA > NC_000913/4320952‑4321246 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |