Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,553,468 | G→T | 6.0% | A82S (GCC→TCC) | hemF → | coproporphyrinogen III oxidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,553,468 | 0 | G | T | 6.0% | 245.8 / 2.2 | 86 | A82S (GCC→TCC) | hemF | coproporphyrinogen III oxidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/43); new base T (3/3); total (40/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACT > NC_000913/2553319‑2553615 | tCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTg < 1:682190/150‑1 (MQ=255) aaGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCg > 1:480977/1‑150 (MQ=255) gATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCggg < 1:506228/150‑1 (MQ=255) tAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGgcg < 1:986513/150‑1 (MQ=255) tAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGgcg < 2:763673/150‑1 (MQ=255) cttGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGCTGCGTAATGGTGGTGATTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGCAAGTTCCGGgcgat < 1:160253/149‑3 (MQ=255) ttGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGGTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGCAAGTTCCGGgcgatg < 2:242795/150‑4 (MQ=255) ttGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGAGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTATTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAg < 2:230409/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGt > 2:1067615/1‑150 (MQ=255) aGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCg < 2:985468/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAg < 2:558492/150‑1 (MQ=255) cgAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGc > 2:772238/1‑150 (MQ=255) cgAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCCGAACTTGCCGGGCGCAGTTTggcggc > 2:523663/1‑150 (MQ=255) cgAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGGCGGGTGTTGCGTAATGGTGGGGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTACGCATGGCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGc < 1:843337/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGCGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATgg > 1:1206846/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCAAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATggg < 2:313789/150‑1 (MQ=255) ggcggcggcGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGc > 1:422164/1‑150 (MQ=255) gcggcggcgGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCg < 1:746694/150‑1 (MQ=255) cggcggGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCTATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTc < 1:578454/150‑1 (MQ=255) gcgggcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGGGTGTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTACGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCAc < 2:109576/150‑1 (MQ=255) cgggcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACt > 2:755009/1‑150 (MQ=255) cgggcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCAACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACt > 1:352285/1‑150 (MQ=255) cgggcgGAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCGTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACt < 2:1013658/150‑1 (MQ=255) ggcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCTCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTgg > 2:662121/1‑150 (MQ=255) ggcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTgg < 2:859119/150‑1 (MQ=255) gcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGt > 1:989930/1‑150 (MQ=255) gcgTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGt < 1:599171/150‑1 (MQ=255) gcgTAGTCGGGTGTGGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGGCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGt < 1:1045814/150‑1 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGt > 2:1301774/1‑119 (MQ=255) gTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGt < 1:1301774/119‑1 (MQ=255) tCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCa < 2:1134276/150‑1 (MQ=255) tCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCa < 2:104841/150‑1 (MQ=255) gtTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCa < 1:1076331/150‑1 (MQ=255) ttGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCAt < 2:670200/150‑1 (MQ=255) tGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATa < 2:1307932/150‑1 (MQ=255) gCGTAAAGGTGGTGGTGTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTCTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCTTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATaa < 1:199842/150‑1 (MQ=255) tAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGCACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAAccc > 1:68910/1‑150 (MQ=255) aaaTGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCAGCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCTATGGGCGTTTCACTCGTAGTGCATCCGCATAAccc > 2:794692/2‑150 (MQ=255) ggtgTGTTCGAACAGGCAGGCTTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGtt < 2:1055526/150‑1 (MQ=255) gtTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCCCCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCTTTACCCGTATGTTccc > 2:499855/1‑150 (MQ=255) tCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCccacca < 2:712115/150‑1 (MQ=255) aaCAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGcc > 2:665349/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGcc > 1:1273226/1‑150 (MQ=255) ggcaggcGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCAcgc < 1:1083281/150‑1 (MQ=255) ggcGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAAt > 1:1309653/1‑150 (MQ=255) ggcGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCACATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCCCTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCCCGCGAAt > 2:676927/1‑150 (MQ=255) cGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAAtgt > 1:13249/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAAtgtg > 1:1142224/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAAtgtg > 1:753421/1‑150 (MQ=255) 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gCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGATTCGAGGCGATGGGCGATTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCACACCAGCCACGCGAAGGTGCGGTTTTTGAt > 1:246645/1‑150 (MQ=255) tGTCCTCGGTGCGGCGATGCGTGCTTCCGCCACCGCTCCTCGCCCGGAACATGCCGTGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGc < 1:49240/150‑1 (MQ=255) gTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGcc > 1:28296/1‑150 (MQ=255) gTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAAATTGCCGCGCGGAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGGAGTGCATCCGCAGCACCCGTAGGTTCCCCCCAGCCCCGCGACTGTGCGGTTTTTGATTGcc > 1:227403/1‑150 (MQ=255) tCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCg < 2:917598/150‑1 (MQ=255) cACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGACCTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTAGTGCCGaa > 1:1240442/1‑150 (MQ=255) aCGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGaaa < 1:665349/150‑1 (MQ=255) cGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGaaaa > 1:347177/1‑150 (MQ=255) gAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCg < 1:951980/150‑1 (MQ=255) gAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTAGCCGGGGGCAGGTTCGAGGCGATGGGCGTGTCACTGGTAGTGCATCCGCAAAACCCGTATGTTCCCACGCGCCACGCGAATGTGCGCTTTATTATAGCCGAAAAACCg > 1:194015/1‑150 (MQ=255) 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cACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtggtg < 1:371634/150‑1 (MQ=255) aCCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCtggtgg < 1:119296/150‑1 (MQ=255) aCCGCGCATCGCCCGGACAGTGCCGGGCGCCGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGGAGGGCATCCGCATATCCCGTATGTTCGCCCCAGCCACGCGAATGGGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGGGCCGATCCCGTCtggtgg < 1:707051/150‑1 (MQ=255) cTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTg > 2:557879/1‑150 (MQ=255) ctgcGCCCGGCAAGTTCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGc > 2:339158/4‑150 (MQ=255) ctgcGCCCGGCAAGTTCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGc > 2:384617/4‑150 (MQ=255) cATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCCTCCGCATAACCCGTATGTTCCCTCCAGCCACGCGAATGTGCGGTTGTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGc > 1:190363/1‑150 (MQ=255) cATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGc > 2:1035482/1‑150 (MQ=255) cccGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTgg > 2:8243/1‑150 (MQ=255) cccGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTgg < 1:1079844/150‑1 (MQ=255) aacaggCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCg < 1:1247449/145‑1 (MQ=255) aaCTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGAGCGGTGTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCg < 2:655484/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGAc > 1:457347/1‑150 (MQ=255) ttGCGGGGCGCAGTTTCGAGGCTATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGATTGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACt < 1:1068312/150‑1 (MQ=255) | TCGAAGATAGTTGGCAGCGCGAAGCTGGCGGCGGCGGGCGTAGTCGGGTGTTGCGTAATGGTGGTGTTTTCGAACAGGCAGGCGTCAACTTTTCGCATGTCCACGGTGAGGCGATGCCTGCTTCCGCCACCGCTCATCGCCCGGAACTTGCCGGGCGCAGTTTCGAGGCGATGGGCGTTTCACTGGTAGTGCATCCGCATAACCCGTATGTTCCCACCAGCCACGCGAATGTGCGGTTTTTTATTGCCGAAAAACCGGGTGCCGATCCCGTCTGGTGGTTTGGCGGTGGCTTCGACT > NC_000913/2553319‑2553615 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |