| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,287,116 | G→T | 5.5% | intergenic (+91/‑310) | agaI → / → yraH | galactosamine‑6‑phosphate isomerase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,287,116 | 0 | G | T | 5.5% | 263.8 / 5.3 | 103 | intergenic (+91/‑310) | agaI/yraH | galactosamine‑6‑phosphate isomerase/putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/48); new base T (4/2); total (53/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATAT > NC_000913/3286969‑3287264 | aTCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGcc > 2:1232013/1‑150 (MQ=255) cccGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTcctt < 2:1197709/150‑3 (MQ=255) ccGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGTTTGAACATAACGCCTAt > 1:152275/1‑150 (MQ=255) cTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACTCCTAACCACATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTATCAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCa < 2:144641/150‑1 (MQ=255) cATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCaaaa > 1:1126020/1‑150 (MQ=255) aTTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAg < 2:1250919/150‑1 (MQ=255) ttATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGt < 1:444563/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTa > 2:1317021/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGCACAGTAACTTTAATTGATTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTa < 2:196384/150‑1 (MQ=255) ggCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATg > 2:18359/1‑150 (MQ=255) gCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACCCCTAACCAGATGTAAAATTTGCTCTAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCCCGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTTAACAGAACGCGGCTAGCAAAAGGAGTTATGt > 1:666659/1‑150 (MQ=255) gCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCAGATAGCAAAAGGAGTTATGt > 1:780756/1‑150 (MQ=255) gCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTca > 1:1245126/1‑150 (MQ=255) gCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGAAAAAGGAGTTATGTTca > 2:45956/1‑150 (MQ=255) cacaGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaa < 2:458735/150‑1 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTcaacc < 2:604223/150‑2 (MQ=38) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaaca > 1:439484/1‑150 (MQ=255) caGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTcaaca > 2:1030046/1‑150 (MQ=255) gTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaat > 2:1225575/1‑150 (MQ=255) gTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaat > 2:1167647/1‑150 (MQ=255) aaCTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaattt < 1:890740/150‑1 (MQ=255) aCTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACTCCGATATCAAAAGGAGTTATGTAAAACaattta > 1:1165453/1‑150 (MQ=255) tttATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaat > 1:581177/1‑150 (MQ=255) ttATTTG‑TTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATTTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaattt < 2:832202/150‑1 (MQ=255) tATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATTTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGCTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACaatttaattt < 1:646289/150‑1 (MQ=255) ttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAg < 2:1118413/150‑1 (MQ=255) ttGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAg < 2:506209/150‑1 (MQ=255) tGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa < 2:280600/150‑1 (MQ=255) tGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGa < 1:1188883/150‑1 (MQ=255) gTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATGACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGat < 2:242064/150‑1 (MQ=255) gTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGat < 1:1232013/150‑1 (MQ=255) gTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATAAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGat > 1:627695/1‑150 (MQ=255) ctaacttaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTAAAACTGTTTACCTTAAATTATGTAACAGTCACGCATTATATTAACTAACAATTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAACGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGata < 2:192868/145‑1 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 1:1144273/1‑150 (MQ=255) taattaaCACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGAAGATAGAAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGAtata > 1:757538/1‑150 (MQ=255) ccTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACt > 1:581710/1‑150 (MQ=255) ccAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTc > 2:193739/1‑150 (MQ=255) cAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCt > 1:800219/1‑150 (MQ=255) gATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTAt > 1:1313418/1‑150 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAAATTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATta > 1:877899/1‑150 (MQ=255) taaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaa < 1:699560/149‑1 (MQ=255) gAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaa < 1:884565/150‑1 (MQ=255) aaaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaat > 2:120931/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGCTCAAAATGTTTAAATTAAGTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACTTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATtaata < 2:343152/150‑1 (MQ=255) tttGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATc < 1:1283995/150‑1 (MQ=255) tttGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATc < 1:383907/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAAAATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCAc > 1:153913/1‑150 (MQ=255) cTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCt > 2:335415/1‑150 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATTTACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg < 1:968448/150‑1 (MQ=255) cAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCg > 1:945871/1‑150 (MQ=255) aaaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGt > 1:291461/1‑150 (MQ=255) aaaTGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTAATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCTTa > 1:81969/1‑150 (MQ=255) gTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTACATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCt > 2:1283906/1‑150 (MQ=255) tAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGaa > 1:424807/1‑149 (MQ=255) aaaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACt < 1:308047/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACt < 2:934085/150‑1 (MQ=255) aaTTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTc > 2:416159/1‑150 (MQ=255) aTTAACTTATGTAACAGTCACGAATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACATGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCg < 2:955283/150‑1 (MQ=255) aaCTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGccc > 2:351128/1‑150 (MQ=255) aaCTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGccc > 2:1083517/1‑150 (MQ=255) aTGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTgg < 2:715249/150‑1 (MQ=255) aaCAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCgca < 2:1164204/150‑1 (MQ=255) tCACTCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCaaa < 1:798977/150‑1 (MQ=255) cACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAg > 2:1024982/1‑150 (MQ=255) cACGCATTATATAAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAg < 2:606155/150‑1 (MQ=255) cATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAg > 1:842740/1‑150 (MQ=255) aTTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAgg < 1:1243205/150‑1 (MQ=255) aTTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAgg < 1:265279/150‑1 (MQ=255) ttATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGc < 1:261367/150‑1 (MQ=255) aaTAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCATCAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATAc > 1:548682/1‑150 (MQ=255) tAACCTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATActa > 1:991140/1‑149 (MQ=255) tAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATActc > 1:485415/1‑150 (MQ=255) tAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATActc > 1:991130/1‑150 (MQ=255) tAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCACCCTGGCGCAGCATAGTCAGGCATTTATActc > 1:133052/1‑150 (MQ=255) cATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAATGAGTTATTTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCttt < 1:1017354/150‑1 (MQ=255) aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtttt > 1:1294743/1‑150 (MQ=255) aTTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCtttt < 2:81298/150‑1 (MQ=255) tttGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTg < 2:591155/150‑1 (MQ=255) tttGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTg < 2:581177/150‑1 (MQ=255) tttGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTg < 2:1171388/150‑1 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt > 2:698536/1‑150 (MQ=255) gACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAAt > 2:368238/1‑150 (MQ=255) aCTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATa < 2:627695/150‑1 (MQ=255) cTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGCTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATAc < 1:724179/150‑1 (MQ=255) aattgTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATAc > 1:915429/5‑150 (MQ=37) ttgTTGAACATAACTCCTTTTGCTATCGGCGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACAt > 1:666524/3‑150 (MQ=38) gggTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACAt < 2:954756/150‑1 (MQ=255) gggTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACAt > 1:1243703/1‑150 (MQ=255) tgTTGAACATAACTCGTTTTGCTATCGGCGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACATAGTATTCTGACTCGCCACCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATAATCTTTTGAATACATa > 1:75576/2‑150 (MQ=37) ggTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATa < 2:30467/150‑1 (MQ=255) aaCATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTAGAATAAATAGaaaa > 1:711133/1‑150 (MQ=255) aCATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACCCTTTTGAATACATAGAAAAt < 1:672963/150‑1 (MQ=255) aTAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTg < 2:708737/150‑1 (MQ=255) tAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGa > 2:523186/1‑150 (MQ=255) aagCCGATATCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGata < 1:886298/148‑1 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGgta < 1:796354/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGata < 1:1024982/150‑1 (MQ=255) aCGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCG‑CCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat > 1:880639/1‑150 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat < 1:656509/150‑1 (MQ=255) cGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTAAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGatat < 1:660726/150‑1 (MQ=255) | ATCCCGGCTTCATTTTTATGGCTGCACAGTAACTTTATTTGTTTAATTAACACCTAACCAGATGAAAAATTTGCTCAAAATGTTTAAATTAACTTATGTAACAGTCACGCATTATATTAAATAACATTTGACTGGGTTGAACATAACGCCGATAGCAAAAGGAGTTATGTTCAACAATTTAATTTTAGATATACATATAACTTGTTCTATTAATAAATCACCTCGTATTCTGACTCGCCCCCTGGCGCAGCAAAGTCAGGCATTTATACTCTTTTGAATACATAGAAAATTGATAT > NC_000913/3286969‑3287264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |