| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,437,909 | A→T | 5.5% | intergenic (+15/‑115) | trkA → / → mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel protein, high conductance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,437,909 | 0 | A | T | 5.5% | 269.9 / 3.9 | 91 | intergenic (+15/‑115) | trkA/mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel protein, high conductance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/41); new base T (3/2); total (48/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 | |||||||||||
GTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAT > NC_000913/3437761‑3438058 | gTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTaa > 2:1104463/1‑150 (MQ=255) ggAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATg < 1:1049411/150‑1 (MQ=255) gAAAAGAAGTGATGAATGCCAATGAAAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACATATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGa < 1:1184813/150‑1 (MQ=255) aaaCGACGTGATGATTGCCAATGACAATATGCTCATTGAGCAAGGCGATCAAGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGAc < 1:213970/150‑1 (MQ=255) cgacgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGcc > 1:374181/1‑150 (MQ=255) cgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCATTAGACGCCtta < 1:77786/150‑1 (MQ=255) cgTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCATTAGACGCCtta < 1:71378/150‑1 (MQ=255) tgatgaTTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttatt < 1:1126580/150‑1 (MQ=255) gatgatTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttatta < 2:711208/150‑1 (MQ=255) tgatTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTattatt > 1:286327/1‑150 (MQ=255) tatTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTAttt < 2:1137201/149‑1 (MQ=255) ttGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTcc < 2:907257/150‑1 (MQ=255) tGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTccc < 2:343608/150‑1 (MQ=255) gCCAATGACAATCTGCCCATTGAGCAAGGCGATCACTTTATTATGTTCCTCACAGCTAAAAAGTTTATTACCGACGGCGAAAGTCTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCt < 2:94686/150‑1 (MQ=255) aaTGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAAAGACGCCTTATTATTTCCCTTTg < 1:246313/150‑1 (MQ=255) aCAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGAAAACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTACCGCCAAGCCATTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCTTCTAATGACGCCTTATTTTTTCCCTTTGATTa > 1:618347/1‑150 (MQ=255) aTCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCa < 1:172373/150‑1 (MQ=255) gcATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGTCGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGatt < 1:695523/150‑1 (MQ=255) gaaaagAGCAAGGCGATCACTTAATTTGGTTCCTCAAAGATTAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGAATCTTCCAGCCAAGCCCTTTCAGCTAGTAAATAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTAATTCCCTTTGATTATCAAGGatt < 2:184497/145‑1 (MQ=255) cATTGAGCAAGTCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCATTTCTTCTTGTAATTAATAACGCTACTAATGACTCCTTATTATTTCACTTTAATTATCAAgtaata > 2:287912/1‑145 (MQ=255) ttGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaat < 1:349718/150‑1 (MQ=255) ttGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaat < 1:1212072/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTT‑CAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta < 2:293241/150‑1 (MQ=255) tGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTT‑CAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta < 2:21469/150‑1 (MQ=255) gAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCACGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta > 2:711406/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGTCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTGTGATTATCAAGGattatttatt > 2:1307571/1‑148 (MQ=255) ggCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAattca < 1:578037/150‑1 (MQ=255) gCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATAACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATTAAGCATTATTATTTAAATATGATTATAAAGGATTAATTAAattcat > 2:570160/1‑150 (MQ=255) cGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACTCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAattcatt < 1:636417/150‑1 (MQ=255) aTCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCCGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTcc > 2:1138749/1‑150 (MQ=255) cACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTg < 2:585215/150‑1 (MQ=255) aCGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTgg > 2:488291/1‑150 (MQ=255) tAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAg < 2:1256393/150‑1 (MQ=255) tATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGTCAGGaaa > 1:1174695/1‑150 (MQ=255) tATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaa > 2:944406/1‑150 (MQ=255) tATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaa > 1:1180106/1‑150 (MQ=255) tATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCATTCTTATTGTAATTAATAAGGCTTCTAATGACGCATTATTATTTCCCTTTGATTAACAAGGATTAATTAAATACATTCCTGTCAGCaaa > 1:283713/1‑150 (MQ=255) tttCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAATCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATg < 1:339614/149‑1 (MQ=255) ttCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGTATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATgg > 1:1016607/1‑150 (MQ=255) tCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTGTTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGc < 2:1075276/150‑1 (MQ=255) caGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACa > 1:489489/1‑150 (MQ=255) aaGATAAAAAGTTTATAACCGAGGTCGAAAGACTTTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCGTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAATATGGCTTAACa < 2:43821/149‑1 (MQ=255) tAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTg > 2:333962/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTTTATTACCGACGTCTAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGt < 1:887874/150‑1 (MQ=255) aaaaaGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGt > 2:750807/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTTATTACCGTCGTCGAAAGACTCTTCCAGCCATGCCCTTTATTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGtt < 2:20113/150‑1 (MQ=255) aaaGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTa < 1:1267902/150‑1 (MQ=255) aaaGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTa < 1:305133/150‑1 (MQ=255) tttATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACt < 2:284394/150‑1 (MQ=255) tattaCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTa > 1:1083881/1‑150 (MQ=255) taCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGAAGCCATATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATATGTTAGACTTATgt > 1:482025/1‑149 (MQ=255) aCCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTGATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTATATTAATTCCTGGCAGAAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGt > 1:189790/1‑150 (MQ=255) gTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCgg < 2:733780/150‑1 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt < 2:405890/150‑1 (MQ=255) gAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCCTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCtt > 2:271070/1‑150 (MQ=255) aaaGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTc > 1:288227/1‑150 (MQ=255) aaGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCa < 1:467729/150‑1 (MQ=255) aaGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCa < 2:97276/150‑1 (MQ=255) ctctTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTAGTCTTAATatt > 1:844178/1‑148 (MQ=255) tttCGAGCCAAGCCCTTTCTTGTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGAGTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGga < 2:423964/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGgag > 2:154892/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGCCGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGgaga > 2:159495/1‑150 (MQ=255) gCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATaa > 1:495954/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATaaa > 2:1119255/1‑149 (MQ=255) cAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGCCGCCTTATTATTTCGCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACa > 1:1127344/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGATTAACa > 1:1220648/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACa < 1:90511/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATAATCAATGATTTATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTATACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACa < 2:72863/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACAt > 2:891872/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATg < 2:1291681/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGGCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATg < 2:618347/150‑1 (MQ=255) cccTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTGTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAg > 1:844863/1‑150 (MQ=255) cTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCa > 1:615682/1‑150 (MQ=255) cttcttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCattat > 2:210920/1‑150 (MQ=255) ttcttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCattatt > 2:1082092/1‑150 (MQ=255) tcttGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCAttatta < 1:112719/150‑1 (MQ=255) tGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAg > 1:1084010/1‑150 (MQ=255) taattaatAAGGCGTCGAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAATGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGaa > 1:90745/1‑150 (MQ=255) aattaatAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAAt > 2:689402/1‑150 (MQ=255) aataaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcg < 1:488291/150‑1 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTATATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGGTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcgc > 2:610193/1‑150 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcgc > 2:137128/1‑150 (MQ=255) ataaGGCGTCATTAGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTagc > 1:37782/1‑150 (MQ=255) taacgagTCTAAAGACGCCTAATTATTTCCCTTTGATTTTCAATGATTAATTAAATTCAATCCTGGCACGAAAATGGCTTAACATTTGTAAGACTTATGGCTGTCGGCTTCATATGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTcgcg < 1:115595/144‑1 (MQ=255) taaGGCGTCTAATGCCGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATACCATGAGCATTATTAAAGAATTTcgcg > 2:938398/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCTCGa > 1:941840/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGCGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGa > 1:69217/1‑150 (MQ=255) aaGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATAAAATTCATTCCTGGAAGGAAAATCGCTTAACATTTCTTAGACTAATGGTTGTCGTCTTCATAGGGAGAATAAAATGATCATTATTAAAGAATATCTCGa > 1:582458/1‑150 (MQ=255) ggCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAAt > 2:894608/1‑150 (MQ=255) cGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAAttt > 2:304412/1‑150 (MQ=255) gTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTg > 2:1164180/1‑150 (MQ=255) cTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTAGCGAATTTGcc > 2:489329/1‑149 (MQ=255) aaTGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGATTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATACCATGAGCATAATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAt > 2:633892/1‑150 (MQ=255) | GTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGAT > NC_000913/3437761‑3438058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |