| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,973,862 | T→G | 5.6% | G85G (GGT→GGG) | rffH → | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,973,862 | 0 | T | G | 5.6% | 227.6 / 2.3 | 92 | G85G (GGT→GGG) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/55); new base G (2/4); total (33/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
TATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTAT > NC_000913/3973713‑3974012 | tATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTACAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGt > 1:1088220/1‑150 (MQ=255) ccGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTg < 2:415258/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTg > 1:27449/1‑150 (MQ=255) cGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTgg < 2:495217/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAACGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGACCGTCCGGGCTgggc < 2:1120180/150‑3 (MQ=255) gTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCa > 1:861965/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAgg > 2:323978/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAgg < 2:771169/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGc > 1:939704/1‑150 (MQ=255) gTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGcc < 1:1207465/150‑1 (MQ=255) gCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGACCGGACGGTCTGGCGCAGGACtt > 1:15440/1‑150 (MQ=255) cTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCttt > 2:298905/1‑150 (MQ=255) tGATGCTGGACGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGcggtta > 1:656933/1‑145 (MQ=255) ggCTGGCCGGTAGCCGCGAAATTCTCATCCTCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGCGTGCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTatca < 1:94247/149‑1 (MQ=255) taggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAACGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGGCTGGCGCAGGCCTTTatcatc < 2:807169/148‑1 (MQ=255) ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGTTAACGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGTGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCgg < 1:11929/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGTCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCgg < 2:763902/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCgg < 1:1251991/150‑1 (MQ=255) ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCGTTATCATCgg > 2:792534/1‑150 (MQ=255) gCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGt < 1:1305164/150‑1 (MQ=255) ccGGTATCCACGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTg < 2:744228/150‑1 (MQ=255) ggTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGGTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACAGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGaa < 2:885119/150‑1 (MQ=255) gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATTAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcc < 2:342077/150‑1 (MQ=255) gcgAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATTGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcc < 2:711700/150‑1 (MQ=255) gAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcctt < 1:834289/150‑1 (MQ=255) gAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAccttcctt < 1:984906/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTaa < 1:525215/150‑1 (MQ=255) aTTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAAt > 2:1316280/1‑150 (MQ=255) tcatcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTg < 1:869872/150‑1 (MQ=255) catcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGATATTTCCAGCGCCTGCTTCGCGATGGTAGTGAGTTCTGTATCCAGCAGCAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACAGTCTGCCGCAGGCCATTATCAACTGTGAAACCTTCCTTAATGGTGa > 2:77886/1‑150 (MQ=255) catcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAAcc < 2:80388/150‑1 (MQ=255) aatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAAcc < 2:80386/149‑1 (MQ=255) cccTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTAAAACCTTCCTTAATGGTGAACcttc < 2:329644/148‑1 (MQ=255) 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aTAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTgg > 1:944250/1‑150 (MQ=255) tAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAACCCTTCCTTAATGGTGATCCTTCTTGTCTGGTGCTggg > 2:1225037/1‑150 (MQ=255) aaaaGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTggg < 2:778143/149‑1 (MQ=255) aaaGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGc < 2:629966/150‑1 (MQ=255) aaaGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGc < 2:902428/150‑1 (MQ=255) 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ccAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtctt > 2:147332/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACAtcttct < 1:1309062/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATcttctt < 1:496910/150‑1 (MQ=255) ggcCTGCTGGGCGTTGGTAGTGATTTCGGTATCCATCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTAGTGCTGGGCGATAACATCttcttc < 2:656933/149‑1 (MQ=255) gcCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCg < 2:1225621/150‑1 (MQ=255) 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tGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcgg < 2:1271229/150‑1 (MQ=255) ggAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATCGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcggc > 1:232426/1‑150 (MQ=255) gAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTAGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTgcggcg < 2:735971/150‑1 (MQ=255) atGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCa < 1:459505/150‑1 (MQ=255) cccaaCAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGGGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCTTCATGTTTCGGCGCGCACCg < 2:402295/147‑1 (MQ=255) cctgcgccagaccGTCCGGGCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGCAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAg > 2:374681/7‑150 (MQ=255) aaCAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAg < 2:445911/150‑1 (MQ=255) ctgcgccagaccGTCCGGGCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg > 1:963716/6‑150 (MQ=255) aCAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGGCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg < 1:694068/150‑1 (MQ=255) agcccagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgggg < 2:936171/150‑1 (MQ=255) gccccgcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGGCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGc < 1:485997/150‑1 (MQ=255) gcccagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGc < 2:23471/150‑1 (MQ=255) cagcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTATCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGAc > 1:24230/1‑150 (MQ=255) agcccTGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCTCACCGAAGGGGCGACg < 2:1088220/150‑1 (MQ=255) gcccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACgg > 2:1072808/1‑150 (MQ=255) ccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGtt > 2:877503/1‑150 (MQ=255) ccGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGGCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGtt < 1:605231/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTACTGGTGAACCTTCTTGGCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCGGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCt < 1:1258304/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCt < 2:27449/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCt > 1:666417/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTa < 1:649992/150‑1 (MQ=255) tCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGAT‑ACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGGCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTAt > 2:1245064/1‑150 (MQ=255) | TATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTGGCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTAT > NC_000913/3973713‑3974012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |