| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 4412102 = | 325 (0.830) | 3 (0.010) | 3/264 | NT | 0.96% | coding (124/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4412146 = | 310 (0.830) | coding (168/399 nt) | yjfL | UPF0719 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
ATTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCT > NC_000913/4411953‑4412251 | attGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCaaaa > 2:4245974/1‑150 (MQ=255) ttGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCaaaaa < 2:5912456/150‑1 (MQ=255) ttGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCaaaaa < 1:4635316/150‑1 (MQ=255) tGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAAc < 1:5611984/150‑1 (MQ=255) ggttaTTACAAGGTCGTTTACAATGGATTTCCGGGCTTCACTTCTTGGCTTTAGGGGCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACaa < 2:6186714/146‑1 (MQ=255) gTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACaa < 2:6253402/150‑1 (MQ=255) gTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACaa > 2:4113297/1‑150 (MQ=255) ttAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTATTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCATAAACaat < 1:1014660/150‑1 (MQ=255) attttttcgcttaatgcgggcatataaagtctgacaccagcaaaaacgagtaactgaatcaccagtgcaatcccgccccaggcgaaatagtctggaatactcaccgcattgattgccgcactggataaggggataacgtaacccAACaat < 2:3787681‑M1/6‑1 (MQ=255) attttttcgcttaatgcgggcatataaagtctgacaccagcaaaaacgagtaactgaatcaccagtgcaatcccgccccaggcgaaatagtctggaatactcaccgcattgattgccgcactggataaggggataacgtaacccAACaat < 1:3968434‑M1/6‑1 (MQ=255) ttACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATATATTCTAAAATTACACCGCACAACGAAAGGCAGTTAATCAAAAACAataata > 1:5066787/1‑150 (MQ=255) ttaatgcgggcatataaagtctgacaccagcaaaaacgagtaactgaatcaccagtgcaatcccgccccaggcgaaatagtctggaatactcaccgcattgattgccgcactggataaggggataacgtaacccaac > 1:3416100‑M1/135‑137 (MQ=255) gTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACCACCAATGGCAGTTAATCAAAAACAAAAATACCGCCGCGTc > 1:1206734/1‑150 (MQ=255) 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ttcttGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTgg > 2:4408345/1‑150 (MQ=255) tcttGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTggg < 2:4619998/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGtt > 1:4931661/1‑150 (MQ=255) tGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTa > 2:3047938/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTAc < 1:3558110/150‑1 (MQ=255) 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ggCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGt < 2:4966880/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGt < 2:2056834/150‑1 (MQ=255) aGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTAc < 2:5591146/150‑1 (MQ=255) aGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTAc > 2:2770000/1‑150 (MQ=255) gTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACt < 2:3394381/150‑1 (MQ=255) 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aaaaaCAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGttttt > 2:5425424/1‑150 (MQ=255) aaaaCAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTg > 2:2670091/1‑150 (MQ=255) | ATTGGTTAATTACAAGGACGTTTACAATGCATATACTGGATTCACTTCTTGCCTTTAGCGCCTATTTTTTTATTGGCGTGGCTATGGTGATTATTTTTCTGTTTATCTATTCTAAAATTACACCGCACAACGAATGGCAGTTAATCAAAAACAATAATACCGCGGCGTCACTGGCGTTCAGCGGTACATTGTTGGGTTACGTTATCCCCTTATCCAGTGCGGCAATCAATGCGGTGAGTATTCCAGACTATTTCGCCTGGGGCGGGATTGCACTGGTGATTCAGTTACTCGTTTTTGCT > NC_000913/4411953‑4412251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |