| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,087,396 | T→G | 6.6% | F231V (TTC→GTC) | metK → | S‑adenosylmethionine synthetase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,087,396 | 0 | T | G | 6.6% | 936.9 / 10.0 | 368 | F231V (TTC→GTC) | metK | S‑adenosylmethionine synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (155/179); new base G (30/4); total (185/183) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.34e-06 | |||||||||||
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Only 100 of 385 total aligned reads displayed.
TCGATGCTGTCGTGCTTTCCACTCAGCACTCTGAAGAGATCGACCAGAAATCGCTGCAAGAAGCGGTAATGGAAGAGATCATCAAGCCAATTCTGCCCGCTGAATGGCTGACTTCTGCCACCAAATTCTTCATCAACCCGACCGGTCGTTTCGTTATCGGTGGCCCAATGGGTGACTGCGGTCTGACTGGTCGTAAAATTATCGTTGATACCTACGGCGGCATGGCGCGTCACGGTGGCGGTGCATTCTCTGGTAAAGATCCATCAAAAGTGGACCGTTCCGCAGCCTACGCAGCACG > NC_000913/3087247‑3087544 | tCGATGCTGTCGTGCTTTCCACTCAGCACTCTGAAGAGATCGACCAGAAATCGCTGCAAGAAGCGGTAATGGAAGAGATCATCAAGCCAATTCTGCCCGCTGAATGGCTGACTTCTGCCACCAAATTCTTCATCAACCCGACCGGtcgtt < 2:2094513/150‑1 (MQ=255) tGTCGTGCTTTCCACTCAGCACTCTGAAGAGATCGACCAGAAATCGCTGCAAGAAGCGGTAATGGAAGAGATCATCAAGCCAATTCTGCCCGCTGAATGGCTGACTTCTGCCACCAAATTCTTCATCAACCCGACCGGTCGTTTCGTTAt > 1:4780596/1‑150 (MQ=255) gTCGTGCTTTCCACTCAGCACTCTGAAGAGATCGACCAGAAATCGCTGCAAGAAGCGGTAATGGAAGAGATCATCAAGCCAATTCTGCCCGCTGAATGGCTGACTTCTGCCACCAAATTCTTCATCAACCCGACCGGTCGTTTCGTTATc < 2:2579690/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |