Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,046,787 | A→C | 6.6% | intergenic (‑185/‑179) | yihG ← / → polA | inner membrane protein, inner membrane acyltransferase/5' to 3' DNA polymerase and 3' to 5'/5' to 3' exonuclease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,046,787 | 0 | A | C | 6.6% | 532.8 / 21.1 | 150 | intergenic (‑185/‑179) | yihG/polA | inner membrane protein, inner membrane acyltransferase/5' to 3' DNA polymerase and 3' to 5'/5' to 3' exonuclease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/71); new base C (2/8); total (71/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCCTTTAC > NC_000913/4046638‑4046936 | tAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTaaaa < 2:100018/150‑1 (MQ=255) aGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTaaaaa < 1:1096642/150‑1 (MQ=255) aGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTaaaaa < 1:512141/150‑1 (MQ=255) gCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAg < 1:2303638/150‑1 (MQ=255) aGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCa < 2:1082229/150‑1 (MQ=255) gAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCAt < 2:2313884/150‑1 (MQ=255) cGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTTTTTACAGCATGatgt < 2:2213011/150‑3 (MQ=255) gACCCAAATACCGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATACACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTTTTTTTTACTGCATGAAATACAATGACAAACATCATGCTTTTTACAGCATGatgtt < 2:2418185/150‑4 (MQ=255) aCCCAACTAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTTTTTACAGCATGatgttt < 1:166722/150‑5 (MQ=255) aCCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTTTTTACAGCATGatgttt < 1:166807/150‑5 (MQ=255) cccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCATTTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCCGTAAAAAGCATGAtaataa < 2:2030842/150‑1 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATaaa > 2:1879915/1‑150 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATaaa < 1:1306768/150‑1 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATaaa < 1:1306830/150‑1 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATaaa > 1:807672/1‑150 (MQ=255) ccAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATaaa > 1:497303/1‑150 (MQ=255) aaaTAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAAtt > 1:101852/1‑150 (MQ=255) aaaTAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAAtt > 1:2337506/1‑150 (MQ=255) gatgatCCTTAATGATAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGa < 2:1502686/150‑1 (MQ=255) gatgatCCTTAATGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGa < 2:2654628/150‑1 (MQ=255) gatgatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGTGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGa < 2:1903996/150‑1 (MQ=255) gatgatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGa > 2:2271369/1‑150 (MQ=255) gatgatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATAAAAAGCGa > 1:1657031/1‑150 (MQ=255) atgatCCTTAAGTAGAAAAATAATTCATATCTATCCAAATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTTGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGAt < 1:2736496/150‑1 (MQ=255) atgatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCTTATCTATCCACATTATAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGTTGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGAt < 1:2736512/150‑1 (MQ=255) atgatCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGAt < 2:902079/150‑1 (MQ=255) tCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTaa > 2:1769542/1‑150 (MQ=255) ttAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAaata > 2:2721846/1‑150 (MQ=255) aaGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAaataat < 1:403399/150‑1 (MQ=255) tagaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCAATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTa < 1:2305374/149‑1 (MQ=255) gagaAAAATAATTCATATCTATCCACATTATAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTa < 1:1925049/150‑1 (MQ=255) gagaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTa > 2:305091/1‑150 (MQ=255) gagaAAAATAATTCATATCTATCCACATGAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTa < 2:1639665/150‑1 (MQ=255) agaAAAATAATTCATATCTATCTACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTAt < 2:251199/150‑1 (MQ=255) agaAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTAt < 1:856886/150‑1 (MQ=255) agaAAAATAATTCATATATATCTACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACATAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTAt < 2:25241/150‑1 (MQ=255) ataatTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACaa < 2:694648/150‑1 (MQ=255) taatTCATATCTATCCACATGAGAAAAAATCCCATTATCTCTATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACaaa < 1:2360535/150‑1 (MQ=255) ttCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGtt > 2:532471/1‑150 (MQ=255) cATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCACTTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTAt < 2:2266825/150‑1 (MQ=255) atatCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATc > 1:1883180/1‑150 (MQ=255) atctatcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCca < 2:260996/150‑1 (MQ=255) tcCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGa > 1:2302345/1‑150 (MQ=255) aTTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGAtt > 2:2438453/1‑150 (MQ=255) aGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgc < 2:1680974/150‑1 (MQ=255) aGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgc < 1:2380992/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcga > 2:1015066/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag < 2:28055/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag > 1:212845/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag > 2:699707/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTgcgag > 1:1660296/1‑150 (MQ=255) tCCCAGTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGCCAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATT‑AAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATcc < 2:1094209/150‑1 (MQ=255) ttATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCagaa < 1:614240/150‑1 (MQ=255) ctcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATc > 1:943371/1‑150 (MQ=255) ctcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATc < 1:1160610/150‑1 (MQ=255) tcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt < 1:1803606/150‑1 (MQ=255) tcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt > 2:2012084/1‑150 (MQ=255) tcAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt > 1:222953/1‑150 (MQ=255) tcAATTATTAGGGAAGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGGTAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCt > 2:2078545/1‑150 (MQ=255) aaTTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTAc < 1:282606/150‑1 (MQ=255) aattaGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAAATAAAACCGATCTAAATAAAATATGCACAAAGTTAACCACATGACGATTTGCGAGCGAACCAGAAGAACTACaaa < 2:1595133/149‑1 (MQ=255) attaGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACaaaa < 2:951587/150‑1 (MQ=255) ttaGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAg > 1:2462997/1‑150 (MQ=255) aGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGAt > 1:1816733/1‑150 (MQ=255) atttatttTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGa > 1:2694993/1‑150 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc > 1:1255731/1‑150 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc > 1:1255979/1‑150 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc < 1:1717950/150‑1 (MQ=255) tttttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGc > 1:2602568/1‑150 (MQ=255) tttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCgg < 1:890462/150‑1 (MQ=255) tttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCgg < 1:2074039/150‑1 (MQ=255) ttAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGt < 1:40781/150‑1 (MQ=255) aCTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaa > 1:1190939/1‑150 (MQ=255) cTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaa > 1:587237/1‑150 (MQ=255) tGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaaa > 2:240574/1‑150 (MQ=255) tGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGaaaa > 2:1159265/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAAc > 2:272418/1‑150 (MQ=255) tGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTAc < 2:168196/118‑1 (MQ=255) tGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTAc > 1:168196/1‑118 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACATCCTGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt < 1:875512/150‑1 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 1:82262/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 1:1329941/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 2:373893/1‑150 (MQ=255) aaaaaCAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCAt > 1:31526/1‑150 (MQ=255) aaCAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGtt > 2:436876/1‑150 (MQ=255) cAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGtttt > 2:1154781/1‑150 (MQ=255) aaGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCa < 1:1410343/150‑1 (MQ=255) cAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCct < 1:532471/150‑1 (MQ=255) cAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCct < 1:1588166/150‑1 (MQ=255) aaaCATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctg > 2:1428107/1‑150 (MQ=255) aaaCATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctg > 1:2438355/1‑150 (MQ=255) aaaCATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATATTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctg > 2:2175588/1‑150 (MQ=255) ttatcatGCTTTTTACAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtc > 1:2551791/3‑150 (MQ=255) ttatcatGCTTTTTACAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGAGTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTGTCATCctgtc > 2:1695444/3‑150 (MQ=255) tcatGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCctgtctgt < 1:1389536/150‑1 (MQ=255) catGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCtgtg < 2:587237/150‑1 (MQ=255) catGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCtgtg < 1:955377/150‑1 (MQ=255) atGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTgg > 1:860506/1‑150 (MQ=255) aaaGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCCTTTa < 2:2120118/150‑1 (MQ=255) aaGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCCTTTAc < 2:1782447/150‑1 (MQ=255) | TAGCAGAAAACGACCCAAATAACGGATGATCCTTAAGGAGAAAAATAATTCATATCTATCCACATTAGAAAAAATCCCATTATCTCAATTATTAGGGATGGATTTATTTTTAACTGCATGAAAAACAAAGACAAACATCATGCTGTAAAAAGCATGATAATAAATTAAAAGCGATGTAAATAATTTATGCACAAAGTTATCCACATGACGATTTGCGAGCGATCCAGAAGATCTACAAAAGATTTTCACGAAAAGCGGTGAAAAACTCATGTTTTCATCCTGTCTGTGGCATCCTTTAC > NC_000913/4046638‑4046936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |