| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,499,851 | 0 | T | C | 8.0% | 432.0 / 20.3 | 137 | L394S (TTG→TCG) | ypdA | sensor kinase regulating yhjX; pyruvate‑responsive YpdAB two‑component system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/80); new base C (9/2); total (55/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-03 | |||||||||||
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Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GGAGGTTTCACGCGCCGAGCAGCTACGTGAAATGGCAAATAAGGCAGAGCTTCGCGCCCTGCAAAGCAAAATTAATCCCCATTTTCTGTTTAACGCTCTGAACGCTATTTCATCGTCAATCCGTCTGAATCCGGATACCGCTCGCCAGTTGATCTTTAATCTGTCGCGTTATCTGCGCTATAACATTGAATTAAAAGACGATGAGCAAATCGATATCAAAAAAGAGCTGTATCAAATTAAAGACTATATTGCCATTGAGCAGGCCCGCTTTGGTGACAAGCTGACGGTTATCTATGAT > NC_000913/2499702‑2499999 | tgAGGTTTCACGCGCCGAGCAGCTACGTGAAATGGCAAATAAGGCAGAGCTTCGCGCCCTGCAAAGCAAAATTAATCCCCATTTTCTGTTTAACGCTCTGAACGCTATTTCATCGTCAATCCGTCTGAATCCGGATACCGCTCGCCAGtt < 1:1072088/149‑1 (MQ=255)ggAGGTTTCACGCGCCGAGCAGCTACGTGAAATGGCAAATAAGGCAGAGCTTCGCGCCCTGCAAAGCAAAATTAATCCCCATTTTCTGTTTAACGCTCTGAACGCTATTTCATCGTCAATCCGTCTGAATCCGGATACCGCTCGCCAGtt < 1:1072074/150‑1 (MQ=255) ggTTTCACGCGCCGAGCAGCTACGTGAAATGGCAAATAAGGCAGAGCTTCGCGCCCTGCAAAGCAAAATTAATCCCCATTTTCTGTTTAACGCTCTGAACGCTATTTCATCGTCAATCCGTCTGAATCCGGATACCGCTCGCCAGTTGAt < 1:1757049/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |