| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3295753 = | 87 (1.100) | 5 (0.070) | 4/264 | NT | 6.2% | coding (360/396 nt) | yraN | UPF0102 family protein |
| ? | NC_000913 | 3295787 = | 70 (0.930) | coding (394/396 nt) | yraN | UPF0102 family protein | |||||
GCGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3295908‑3295753‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccactcaTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAAC > NC_000913/3295787‑3295934 GCGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC < 2:827214/150‑1GCGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATC < 1:1217859/150‑1 CGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCC > 1:115967/1‑150 CGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCC < 1:759642/150‑1 TCATGGCTGCACGGGTGATGGCATCCGGAAGAGCCTCTGCCGACGCAATTTGATTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCAC < 1:847696/150‑1 aATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT < 1:464847/149‑1 CATGGCTGTACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGATTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCATGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT < 1:1260547/150‑1 CATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT > 1:1053602/1‑150 CATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT > 2:8820/1‑150 CATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT > 2:1121535/1‑150 CATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACT > 1:500597/1‑150 TGGCTGCACGGGAGATGGCATGCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCA < 1:1079836/150‑1 TGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCA > 2:19681/1‑150 TGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCA < 1:1034661/150‑1 TTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCGAT > 1:1102805/1‑150 CCTTAATTATGAGTGGTCATAAAAGGCATCCTTAATCCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCC > 2:1201633/1‑150 CTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCG > 1:432451/1‑150 ATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCA > 1:476842/1‑150 ATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCA > 1:1334764/1‑150 CCACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATG > 2:212587/1‑150 ACTCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCCGCTCAATGGC < 1:614284/150‑1 CTCATAATTAAGGTGTAAGGATTAGCGTGCTAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCA < 1:1189679/150‑1 TCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAA > 1:485257/1‑150 TCATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAA < 2:37987/150‑1 CATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAAC > 1:407312/1‑150 CATAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAAC < 2:1051578/150‑1 GCGTCATGGCTGCACGGGAGATGGCATCCGGAAGCGCCTCTGCCGCCGCAATTTGAGTTTGAATGCTTTCAGTGAAGCAAGCTTTAATTCTTTCTTGCACGCTAATCCTTAAACCTTAATTATGAGTGGTCATTAAAGGCATCCTTAATCCACTCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3295908‑3295753‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccactcaTAATTAAGGTTTAAGGATTAGCGTGCAAGAAAGAATTAAAGCTTGCTTCACTGAAAGCATTCAAACTCAAATTGCGGCGGCAGAGGCGCTTCCGGATGCCATCTCCCGTGCAGCCATGACGCTGGTTCAGTCTCTGCTCAATGGCAAC > NC_000913/3295787‑3295934 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |