| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 476120 | 70 (0.890) | 4 (0.050) | 4/276 | NT | 5.4% | coding (252/390 nt) | ybaZ | excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL |
| ? | NC_000913 | = 476176 | 71 (0.910) | coding (196/390 nt) | ybaZ | excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL | |||||
GAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCTTCGGGAATAGCGGCGACGATTTGCCAGACGCGTTG > NC_000913/475975‑476269 | gagaGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGcc < 2:1100797/150‑1 (MQ=255) gagGGTTAGTAGTTCCAGCTATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGGCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAg < 2:52602/150‑1 (MQ=255) gTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCGTCCCGATACCGTCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGGAGATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTCACCACCCGGTGCCAGGGTa > 1:641013/1‑150 (MQ=255) tttgtagtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTaa < 1:579884/147‑1 (MQ=255) agtagtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTGCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAgg < 1:1061188/150‑1 (MQ=255) agtagtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCATCCAGATACCATCACACCTTCTTCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAAACCGGTCCGCTTAGAGAAATTGTGCCGTGTCGATAAACCACCCGGAACCAGTGTAAgg > 1:73952/1‑150 (MQ=255) agtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAATGtgc < 2:147013/150‑1 (MQ=255) gtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGtgct > 2:746971/1‑150 (MQ=255) gtTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGtgct > 1:931190/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGtgctg < 1:960009/150‑1 (MQ=255) ccAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGcc > 1:1196755/1‑150 (MQ=255) gCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTc < 2:1161630/150‑1 (MQ=255) cGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCa < 2:921296/150‑1 (MQ=255) cGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGACTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCAGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCa > 2:1086818/1‑150 (MQ=255) aTAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAgg < 2:1257335/150‑1 (MQ=255) cGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGcgccaggtgggcggtgtgttaaagcgtctc > 1:369915‑M1/1‑120 (MQ=255) gCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGAc > 1:858378/1‑150 (MQ=255) gCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGAc < 1:288377/150‑1 (MQ=255) gCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGAc > 2:481736/1‑150 (MQ=255) gCTGCAAGGCGATTTGCCCGCTTCCCGATACAATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGAc < 1:551343/150‑1 (MQ=255) cAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTACGGTTAGCGAAATTGTGACGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGACTTCAGGGAGACGCtt > 1:96527/1‑150 (MQ=255) cAAGTCGATTTGCCCGCTCCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCtt < 2:704069/150‑1 (MQ=255) aaGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCAACACACCTTCTGCAAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGAATAACCACCAGCTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCtat > 2:1058553/1‑148 (MQ=255) aGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTa > 1:1174200/1‑150 (MQ=255) tCGATTTGCCCGCTTCCCTATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGGCGTTGCGAATAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAac < 1:46371/150‑1 (MQ=255) tCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAac < 1:781153/150‑1 (MQ=255) cGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAacc > 2:732245/1‑149 (MQ=255) aTTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACGCCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGCCGCGGTTAATGCGGTCCGGGTCGCGAAAGTGTGCCGTGGCGATTAACCCCCGGGTGCCAGGGTTAGGTGCTGGGTGCTGGGAGGCGCTTTAgcacc > 2:885025/1‑149 (MQ=255) gCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGGGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGc > 1:1150986/1‑150 (MQ=255) cccGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGcc < 1:930620/150‑1 (MQ=255) cccGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGcc > 2:1055820/1‑150 (MQ=255) ttCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCt < 1:424730/150‑1 (MQ=255) tCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTg > 2:613140/1‑150 (MQ=255) tCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCATTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCACACCTg > 2:644467/1‑150 (MQ=255) gcccccagcaCACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAACTCCTGTCAGGTTAGCGAAATTGAGCCGTGGCGATTAACCACCCGGtgccaggtgggcggtgtgttaaagcgtctccctgaaggcagcaccttaccctggcac < 2:167335‑M1/146‑58 (MQ=255) gATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCTGTGGCGAGTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGc > 1:1196274‑M2/1‑149 (MQ=255) gATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGc < 2:1107511‑M2/150‑2 (MQ=255) tACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGcgccaggtgggcggtgtgttaaagcgtctccctgaaggcagcaccttaccctggcaccg < 2:1302773‑M1/150‑60 (MQ=255) ccgaTCACAGCTTCTGCCAGTAATGCCTGGCGCTGACGCAGTAAATCCGGTCCGGGTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGcgcgcg < 2:234259/147‑1 (MQ=255) ccATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGGTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCgcgcgg < 2:1278353/150‑1 (MQ=255) aTCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGcgccaggtgggcggtgtgttaaagcgtctccctgaaggcagcaccttaccctggcaccgggtg < 2:369915‑M1/150‑64 (MQ=255) acCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCgggg < 2:488778/150‑1 (MQ=255) acCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGATAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCgggg > 2:705786/1‑150 (MQ=255) 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aaaTCCGGTCCTGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGTTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCTCCTGGCGCGCGGCGCGGTGAGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAgtg < 1:1033985/150‑1 (MQ=255) aaTCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAgtgg < 1:268148/150‑1 (MQ=255) aaTCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGACTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCTCCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCCCATCACCGTAAgtcg > 1:640538/1‑148 (MQ=255) tccggtccggTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAgtggtg < 2:1208001/150‑1 (MQ=255) tccgggccggTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTACCCACCCGGTGGCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAgtggtg < 1:144107/150‑1 (MQ=255) ccggtccggtTAGCGAAATAGTGCCGTGGCGATTAACCCCCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTATCACTCCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTGGCCACTTCACCGTAAGTGGTGa < 1:49506/150‑1 (MQ=255) cggtccggtTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGAc < 2:324150/150‑1 (MQ=255) ggtTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGcc > 2:1097410/1‑150 (MQ=255) ttAGCGAAATTGTGCCGTGGCGAATAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTTCCTTAAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCTCGGGGCGATCACGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCtt < 1:673339/150‑1 (MQ=255) gCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCGGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCTTCgg < 1:1086818/150‑1 (MQ=255) 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GAGAGGGTTAGTAGTTCCAGCGATAACGCTGCAAGTCGATTTGCCCGCTTCCCGATACCATCACACCTTCTGCCAGTAATGCCTGTCGCTGACGCTGTAAATCCGGTCCGGTTAGCGAAATTGTGCCGTGGCGATTAACCACCCGGTGCCAGGGTAAGGTGCTGCCTTCAGGGAGACGCTTTAACACACCGCCCACCTGGCGCGCGGCGCGGGGCGATCCCGCCAGTTTCGCCACATCACCGTAAGTGGTGACATAGCCTTCGGGAATAGCGGCGACGATTTGCCAGACGCGTTG > NC_000913/475975‑476269 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |