New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1311891 = | 75 (0.950) | 4 (0.050) | 3/266 | NT | 5.6% | coding (356/399 nt) | yciA | acyl‑CoA esterase |
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AGCCAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAAATAATGCTTCTGTCGCTTTATAGCGTTGCCCAATTGGTTCAGACGCTACTTTTTTCACCCACACTTCAATATTAATGCTGACCGATGTCGTCCCTTTCTGGACACAGCGTGCATAGCAGCACACCACATCGCC > NC_000913/1311744‑1312036 | aggaatgactttcttacggccggtggcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctataaaGc > 1:282654‑M1/149‑150 (MQ=255) ggaatgactttcttacggccggttgcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctataaaGCg < 2:79588‑M1/3‑1 (MQ=255) gaatgactttcttacggccggttgcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctataaaGCGa < 2:193161‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGAc < 2:82518/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTATTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACa > 2:643661/1‑150 (MQ=255) aatgactttcttacggccggttgcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctgtaaaGCGAc > 2:296971‑M1/146‑150 (MQ=255) atgactttcttacggccggttgcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctataaaGCGACa < 2:349128‑M1/6‑1 (MQ=255) atgactttcttacggccggttgcggtcggcgatgtggtgtgctgctatgcacgctgtgtccagaaagggacgacatcggtcagcattaatattgaagtgtgggtgaaaaaagtagcgtctgaaccaattgggcaacgctataaaGCGACa > 1:322970‑M1/145‑150 (MQ=255) cAGTGGGATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACt > 1:1291994/1‑150 (MQ=255) ggATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaat < 1:1078208/150‑1 (MQ=255) ggATTGTGGTGAATATACTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCATACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGTATCAACCGCGACATACTTAaat > 2:753648/1‑150 (MQ=255) gATTGTGGTGAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACTTAaata < 1:555953/150‑1 (MQ=255) gtggtgAATATCCTGTTTAAAATTAACGGCACCACCGAAATTCAGTAAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTATTACTCAACAGGTAAGGCGCGAGG‑TTTTCCTTCAGGATCAACCGCGACATACATAATTAATGc > 1:671674/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |