| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 45814 | 57 (0.720) | 3 (0.040) | 3/270 | NT | 5.1% | coding (8/1332 nt) | yaaU | putative MFS sugar transporter; membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 45896 | 56 (0.730) | coding (90/1332 nt) | yaaU | putative MFS sugar transporter; membrane protein | |||||
TGATGTTGGTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAG > NC_000913/45748‑46044 | tGATGTTGGTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg < 2:970262‑M2/150‑2 (MQ=255)tGATGTTGGTCGGCTACGTAACCCCGAACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGTAATAACCATGCAACCGTCCCGAAACTTTGACGATGTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATg > 1:1276249‑M2/1‑149 (MQ=255) tGTTGGTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGAGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATggtt < 1:148250‑M2/150‑5 (MQ=255) gTTGGTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTa > 2:403994/1‑150 (MQ=255) gTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTa > 1:1132602/1‑150 (MQ=255) tGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCAGTGGGGCAGCGGGGGTCCGTTGCTGGATGGTTATGTACTg > 2:94154/1‑150 (MQ=255) gATACTTTACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTAGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTGACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTgg < 2:56533/150‑1 (MQ=255) aTACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGt < 2:587105/150‑1 (MQ=255) tACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGAAAAAAACAGGAATAACCATGCTACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTa < 1:580370/150‑1 (MQ=255) cGTAACGCCGCACTGACACTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCGCAATTCACCGCCTCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAAt < 1:806327/150‑1 (MQ=255) tAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACGGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGa > 2:1025881/1‑150 (MQ=255) ccgcACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATtggc > 2:157986/1‑150 (MQ=255) aCTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATtggcgtgg > 1:897520/1‑150 (MQ=255) aCTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCt < 1:1337953/150‑1 (MQ=255) ctctCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAACCTTAGACGATCTCAAATGCACCGCTCTTCCCCGCCGCATTTTGCTGGGGGGCAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTGCTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTg < 2:1284173/150‑1 (MQ=255) ctcATTGCAAAAAACAGCAATAACCATGCAACCGTCCAGAACCTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTAAGTACTGGTAATGAATGGCGTGGCGCTGGa < 1:738911/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACt > 2:613401/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCACTGGAGCAACt > 1:297018/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCACCTCTAAACACCGCCGCATTTTGCTGTGTGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACt < 1:826650/150‑1 (MQ=255) gCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTAAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACt > 2:758262/1‑150 (MQ=255) cAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTg < 1:459388/150‑1 (MQ=255) aaaaaCAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGTGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGAc > 1:1165535/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGc > 2:1168705/1‑150 (MQ=255) aaaCAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGc > 2:715206/1‑150 (MQ=255) aCAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCg > 2:396516/1‑150 (MQ=255) ggAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCCGTGGTCCGATTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGgcg > 2:808162/1‑150 (MQ=255) gAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGgcgc < 2:335971/150‑1 (MQ=255) gAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGgcgc < 2:550923/150‑1 (MQ=255) aCCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATggttgcatggttattcctgttttttgcaatgagagtcagtgcggcgtaacgtatcaa < 2:155273‑M2/150‑58 (MQ=255) ccATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATggttgcatggttattcctgttttttgcaatgagagtcagtgcggcgttacgtatcaaa < 2:1084153‑M2/150‑59 (MQ=255) cAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATggttgcatggttattcctgttttttgcaatgagagtcagtgcggcgttacgtatcaaaccaac < 2:1115232‑M2/150‑64 (MQ=255) aaCCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCACCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGTGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGAAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACg < 2:1012010/150‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGACGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGc > 2:736677/1‑150 (MQ=255) aCCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGc < 1:1025881/150‑1 (MQ=255) gTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGa < 1:943748/150‑1 (MQ=255) ccAGAAACTTTGACGATCTTAATTTCTCCTCTATTCCCCACCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGTTAATGCTTGCCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACt < 2:1268267/150‑1 (MQ=255) cAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTg > 1:1222091/1‑150 (MQ=255) aGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTgg > 2:927019/1‑150 (MQ=255) aGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTgg > 2:817728/1‑150 (MQ=255) gAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGa > 1:247213/1‑150 (MQ=255) tctcATAATCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCCTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTggg < 1:337317/150‑1 (MQ=255) tctcAAATTCTCCTCTATTCACCGCGGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTggg < 2:645035/150‑1 (MQ=255) ctcAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTgggg > 2:1287970/1‑149 (MQ=255) 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cgcATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTc > 1:906429/1‑150 (MQ=255) ggggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGc > 2:248193/1‑150 (MQ=255) gggAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCt > 1:1055066/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTg < 1:973764/150‑1 (MQ=255) ggtggtCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGt > 2:854224/1‑150 (MQ=255) 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cTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTCGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGTTTATATTTCCGAt > 2:571270/1‑150 (MQ=255) gATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACGTCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATaaa < 1:1300005/150‑1 (MQ=255) gATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATaaa < 1:970262/150‑1 (MQ=255) aTGGTTATGTACTTGTAATGAATGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCGGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAg < 2:907884/150‑1 (MQ=255) aTGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAg < 2:897520/150‑1 (MQ=255) | TGATGTTGGTTTGATACGTAACGCCGCACTGACTCTCATTGCAAAAAACAGGAATAACCATGCAACCGTCCAGAAACTTTGACGATCTCAAATTCTCCTCTATTCACCGCCGCATTTTGCTGTGGGGAAGCGGTGGTCCGTTTCTGGATGGTTATGTACTGGTAATGATTGGCGTGGCGCTGGAGCAACTGACGCCGGCGCTGAAACTGGACGCTGACTGGATTGGCTTGCTGGGCGCGGGAACGCTCGCCGGGCTGTTCGTTGGCACATCGCTGTTTGGTTATATTTCCGATAAAG > NC_000913/45748‑46044 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |