New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 1582493 = | 90 (1.150) | coding (32/1683 nt) | ydeN | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
TATTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAA > NC_000913/1582347‑1582642 | tatTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGATTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCTAAGATATCGAGGTACTTa > 1:205550/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGacac > 1:201213/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGacac > 1:804163/1‑150 (MQ=255) 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aCTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGc < 2:352349/150‑1 (MQ=255) tATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGAc > 2:1148045/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACt > 2:794814/1‑150 (MQ=255) ttatGTCTGCGTAAATTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCTCATTAGCATCAAATGCAGCCATAACAGATTCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACtt < 1:267333/147‑1 (MQ=255) tCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTc < 2:499887/150‑1 (MQ=255) 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cGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAg < 1:617019/150‑1 (MQ=255) gAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAgg < 1:1111431/150‑1 (MQ=255) gAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAgg < 1:113256/150‑1 (MQ=255) gAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAgg < 1:1006351/150‑1 (MQ=255) tggTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAggg < 2:804163/149‑1 (MQ=255) ggTACTTACGACACTTTTCTTTAATTCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGCACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGa < 2:178524/150‑1 (MQ=255) cTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGaaaaa > 1:465493/1‑150 (MQ=255) | TATTTGGCTTTCCTTTGGTACTGTATTCTGTCGGCGTAAAGTCTGAGAAAGCAACGTTTGTTTTGGTTGCTTTCAGCTTTACATCATCTGCCGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAA > NC_000913/1582347‑1582642 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |