| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,272,426 | T→A | 7.9% | intergenic (+77/‑81) | chaB → / → chaC | cation transport regulator/cation transport regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,272,426 | 0 | T | A | 7.9% | 199.5 / 3.5 | 71 | intergenic (+77/‑81) | chaB/chaC | cation transport regulator/cation transport regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/30); new base A (3/3); total (38/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTGAAGAATCAC > NC_000913/1272282‑1272573 | tGGCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGttt < 1:858437/150‑1 (MQ=255)tGGCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGAGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGttt > 2:671047/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAATTTGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTc < 1:1073515/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTc < 2:925430/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCCAGTGGTCCGTGGATTGCATATTTTCCCGTTAGAGGTTTCa > 1:1219895/1‑150 (MQ=255) gCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTAGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGAGGTTTCa > 1:1214239/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGACTTGCAAGAGGTCCGTGGATTGCATAATGTACAGTTAGAGGTTTCaa > 2:362833/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCaaa > 2:710740/1‑150 (MQ=255) tGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCaaaa < 1:1176296/150‑1 (MQ=255) gggCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAAt > 1:1165293/1‑150 (MQ=255) tgctgTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGc < 1:1078705/150‑1 (MQ=255) tgctgTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGc < 2:641887/150‑1 (MQ=255) tgctgTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGAATAAAAAATCGTAAAACCGGTGGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGc < 2:1160221/150‑1 (MQ=255) gctgTGAAGCATGAATATGCCACAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCa > 2:333109/1‑150 (MQ=255) gctgTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCa > 2:328124/1‑150 (MQ=255) gtgAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGCGCAGTa > 1:669557/1‑150 (MQ=255) tgAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAACTATTCGTTCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGTATTGCATATTGTCACGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTaa > 1:314669/1‑150 (MQ=255) tcATGAATATGCCAAAGTGGATGTTGATAAATGGCATAAAAAATAGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGGGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAAt < 1:740562/149‑1 (MQ=255) gCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGTTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTTCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAAt > 1:974698/1‑150 (MQ=255) atGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATTTCCGGaa > 1:564951/1‑150 (MQ=255) tGCCAAAGGGGATGATGAAAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGGTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAg < 2:122100/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGac > 1:591017/1‑150 (MQ=255) aaGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTTAAAATGTCCGGAAGACAcc < 1:121650/150‑1 (MQ=255) aGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCa < 2:987913/150‑1 (MQ=255) ggATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTACCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTACGGAAGACACCaaaa > 2:1142578/1‑150 (MQ=255) atgatgatAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGTATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAg < 1:807496/150‑1 (MQ=255) atgatgatAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAg < 1:544151/150‑1 (MQ=255) tgatAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGt > 2:896923/1‑150 (MQ=255) tAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGc < 1:333109/150‑1 (MQ=255) tAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGc < 1:328124/150‑1 (MQ=255) aaTGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCGGGGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAg < 2:495924/150‑1 (MQ=255) aaaaaTCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATg < 1:312244/150‑1 (MQ=255) aaTCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTTTTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTTGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAg < 1:115688/150‑1 (MQ=255) gTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGc > 1:1182105/1‑150 (MQ=255) tAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCg > 1:596080/1‑150 (MQ=255) aaaaCCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGAATGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTGCGGAAGCCACCAAAAAGTTGTCGAAGGGAAGTATCCAGTGGCgg > 2:672866/1‑150 (MQ=255) ccGGTCGCATAGTTAAATCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTTGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAgt < 1:809318/150‑1 (MQ=255) tAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTTGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGa > 1:1184679/1‑150 (MQ=255) gCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGt > 1:1154669/1‑150 (MQ=255) cTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGACCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTg < 1:1099810/150‑1 (MQ=255) tATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGa > 1:875980/1‑150 (MQ=255) ttCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGAtt < 2:539190/150‑1 (MQ=255) gTGCGGGGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTTTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCt < 2:1346458/150‑1 (MQ=255) gtTGCCTTGCAAGTGGTCAGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGaa < 1:896923/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGcc < 2:1165293/150‑1 (MQ=255) cTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGCCACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCg > 2:976781/1‑150 (MQ=255) gCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGAtt > 2:1056756/1‑150 (MQ=255) gCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGAtt > 2:464218/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTg > 2:1128232/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGAAGTGGGGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATTAATGCCGATTg > 2:828684/1‑150 (MQ=255) cAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGAGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTg < 2:918741/150‑1 (MQ=255) tGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTaaa > 1:658747/1‑150 (MQ=255) ggTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTaaaa > 1:1299705/1‑150 (MQ=255) gTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAACTGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCTGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAAc < 1:667578/150‑1 (MQ=255) ccGTGGATTGCATATTGTCCCGTTTGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACgg > 2:692049/1‑150 (MQ=255) cGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATACCGATTGTAAAACGGc > 2:718525/1‑150 (MQ=255) gTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCa > 1:380145/1‑150 (MQ=255) aTTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTg > 2:48808/1‑150 (MQ=255) aTTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTg > 1:269169/1‑150 (MQ=255) gaatatTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTg < 1:979319/148‑1 (MQ=255) gCATATTGGCCCGATCGTGGTCTCAAAATGAGCAGTAAAAATCTCCGGAAGACACCAAAAAGTTCTCGCAGGGCAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGAGTTCTTGATGAATGCCGTTTTACAATCGGCAttcatca < 2:1300723/150‑6 (MQ=255) tatTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCa > 1:290188/1‑150 (MQ=255) atTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCAt > 2:773655/1‑150 (MQ=255) atTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGACGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGAGTGTAAAACGGCATATGGTGCCAt > 2:706216/1‑150 (MQ=255) ttGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCAtt < 1:27789/150‑1 (MQ=255) tGTCCCGTTCGAGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGAAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTg < 2:1214239/150‑1 (MQ=255) tGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGCGCAGAAAAAATGTCCGGAAGACTCCAAAAAGTTGTCTCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTTATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTg < 2:361080/150‑1 (MQ=255) tGTCCCGTTAGAGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTg < 2:1219895/150‑1 (MQ=255) gTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTga > 2:1246001/1‑150 (MQ=255) ttAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGCATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTGAAGAATc < 2:669557/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTGAAGAATCAc > 2:569957/1‑150 (MQ=255) | TGGCCTGGGCTGCTGTGAAGCATGAATATGCCAAAGGGGATGATGATAAATGGCATAAAAAATCGTAAAACCGGTCGCTTAGTTAAAGCTATTCGTGCGGTGTTGCCTTGCAAGTGGTCCGTGGATTGCATATTGTCCCGTTAGTGGTTTCAAAATGAGCAGTAAAAATGTCCGGAAGACACCAAAAAGTTGTCGCAGGGAAGTATGCAGTGGCGGAAGTGTAAGGTGATAACGCGTGATTTCTTGATGAATGCCGATTGTAAAACGGCATTTGGTGCCATTGAAGAATCAC > NC_000913/1272282‑1272573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |