| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 156,519 | G→T | 5.2% | P122Q (CCA→CAA) | yadN ← | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 156,519 | 0 | G | T | 5.2% | 341.3 / 2.4 | 123 | P122Q (CCA→CAA) | yadN | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/62); new base T (5/3); total (58/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |