Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,889,832 | T→C | 5.4% | L368S (TTG→TCG) | tnaA → | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,889,832 | 0 | T | C | 5.4% | 221.1 / 3.1 | 76 | L368S (TTG→TCG) | tnaA | tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/23); new base C (2/2); total (50/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.45e-01 |
GGCGGTAGGTCTGTATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTG > NC_000913/3889683‑3889975 | ggCGGTAGGTCTGTATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGtt > 1:496265/1‑150 (MQ=255) cGGTAGGTCTGTATTCCGGAATAAAAATCGACTGTCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACACTATCTTGTCCAAGGGCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGAAGGCGGGCGGTCACGCTGCATTCGTTGATGCCGGTACACTGTTGc > 2:62350/1‑150 (MQ=255) gTATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCCGCAGGCGGGCGGACACCCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCAAATccc > 2:229339/1‑150 (MQ=255) tATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTCGCCGCATATCCCg > 2:127693/1‑150 (MQ=255) tATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGAATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTCGCCGCATATCCCg > 2:131887/1‑150 (MQ=255) aTGACGGCCTGAATCTCGACTGGCCGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCgg < 2:75880/150‑1 (MQ=255) aTGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCATTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCgg < 2:943640/150‑1 (MQ=255) tgccGGCATGAAGCGCGACTGGCTGGCGTATCGTCTCGCGCAGGTACAGGAGCTGGTCGATGGGCTGGAAGAGATGGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGc < 1:190303/147‑1 (MQ=255) ggCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAgcc > 1:583269/1‑148 (MQ=255) gCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACATTATCTGGTAGATGGTCTGGAAGAGATTTGCGTTGTCTGACAGCAGGCGTGCGGTCACGCGGCATTCGTTTATGACGGTAAACTGTTACCGCATATCCCGGCATAca > 2:982760/1‑149 (MQ=255) cATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCa > 2:891371/1‑150 (MQ=255) gAATCTCGACTTGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGCGAGGTCACGCGGCATTCGTTGATGACTGTAAACTGTTGCCGCATATCCAGGCAGACGAGtt > 1:106914/1‑150 (MQ=255) aaTCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTc > 1:1250447/1‑150 (MQ=255) aTCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGCCCAGTTcc > 1:1323261/1‑150 (MQ=255) aTCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTcc > 2:956642/1‑150 (MQ=255) tctcGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTccc > 1:1072212/1‑150 (MQ=255) tcGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCgg > 1:1186338/1‑150 (MQ=255) tcGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCgg < 2:1239267/150‑1 (MQ=255) cttgctTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGACACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAACCTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCAGGCACAGgcg > 2:1176838/4‑150 (MQ=255) ctTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTgg > 1:1023674/1‑150 (MQ=255) atcgtatcgCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTACCGGCACAGGCGCTGGCCt > 2:925349/1‑150 (MQ=255) tatcgCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGa < 1:84949/150‑1 (MQ=255) tatcgCGCAGGTACAGAATATGGTCGATGGTCTGGAAGAGATAGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGAGGCATTCGTTGATTCCGGAAAACTGTTGCAGCATATCCCGCAAGACCAGTTCCCGGAGCAGGCGCTGTCCTGCGa > 1:81929/1‑150 (MQ=255) tcgCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGc < 2:1072212/150‑1 (MQ=255) tcgCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGc < 1:453780/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTg < 1:991951/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTACAGTATCTGGGCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGGTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTg < 2:786822/150‑1 (MQ=255) cgcAGGTCCAGTATCTGGTCGCTGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGt < 1:661432/150‑1 (MQ=255) gcAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGta > 1:1159420/1‑150 (MQ=255) tATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGcc < 1:1043167/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGTCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGCGCTGTATTAAGTCGCCGGt > 2:19888/1‑150 (MQ=255) tGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTa > 2:905336/1‑150 (MQ=255) ggTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTAt > 1:827980/1‑150 (MQ=255) gATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGAGCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAATGTCGCGGGTATCCgg > 2:249117/1‑149 (MQ=255) gATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGt > 1:1107705/1‑150 (MQ=255) gATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGt > 2:716018/1‑150 (MQ=255) tcgggAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGt < 2:868020/147‑1 (MQ=255) tGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAg > 2:24769/1‑150 (MQ=255) ggAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGa > 2:935792/1‑150 (MQ=255) agagATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAAt > 2:1005225/1‑150 (MQ=255) agagATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAAt > 2:701202/1‑150 (MQ=255) agaTTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTg > 2:351008/1‑150 (MQ=255) gaTTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTgg < 1:438829/150‑1 (MQ=255) agtGGAGTTGTCTGCCAGCAGGCTGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGTTGGCGGTAAACTGTTGCCGCAAATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGc < 2:877317/148‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGctct < 2:1272291/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGcgct > 2:518482/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTAGAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGctcg > 1:511209/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCtt > 1:2355/1‑150 (MQ=255) gTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTc > 1:743404/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGCCAGAAGGCGGTCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTAGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTcc < 2:836687/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGCGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGGAGAAATTGGCTCTTTCCt > 2:230108/1‑150 (MQ=255) gCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAg > 1:887844/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCGGGTATCCGTGGCGTAGAAATGGGCTGTTTCCTGTTGGGc > 1:955257/1‑150 (MQ=255) cagcagGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGc < 1:1314975/150‑1 (MQ=255) agcagGGGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTCGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGcc < 1:131887/150‑1 (MQ=255) agcagGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTCGCCGCATATCCCGGCAGTCCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGcc < 1:127693/150‑1 (MQ=255) cagGCGGGCGGGCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGACGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCTCAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATAGGCTCTTTCCTGTTAGGCcgc < 1:833754/150‑1 (MQ=255) ggcgggcgGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGa > 2:1209505/1‑150 (MQ=255) gcgggcggTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAATTTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGAt > 2:566406/1‑150 (MQ=255) gcgggcggTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGAt < 2:364891/150‑1 (MQ=255) gcgggcggTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGGATAAAGTCGCCGGGATCCGTGCGGTAGATATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCcgcgct > 2:267974/1‑148 (MQ=255) gcgggcggTCACGCGGCATTCGGTGATGCCGGTAAACTGGTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACTGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGAt < 2:46654/150‑1 (MQ=255) cACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAAcc > 2:1134341/1‑150 (MQ=255) cACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAAcc < 1:476470/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCg > 1:971689/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTg > 1:39310/1‑150 (MQ=255) gTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTg > 1:965557/1‑150 (MQ=255) gATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGCCCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGGGGCCGTGCGGTAGCAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTCACCCACTGCCa > 1:374480/1‑150 (MQ=255) gATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCa > 2:735347/1‑150 (MQ=255) gATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCACGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCa > 2:61936/1‑150 (MQ=255) gCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGc > 2:53071/1‑150 (MQ=255) ccGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGcc > 2:1181538/1‑150 (MQ=255) ccGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAAACGGTTAAAACCTGCCATGcc > 2:1181540/1‑150 (MQ=255) cGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGccc < 1:1028364/150‑1 (MQ=255) ggTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAGACAACTGCCATGCCCg > 2:1121177/1‑150 (MQ=255) tAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGc < 1:891371/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGGATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTg < 1:1176838/150‑1 (MQ=255) | GGCGGTAGGTCTGTATGACGGCATGAATCTCGACTGGCTGGCTTATCGTATCGCGCAGGTACAGTATCTGGTCGATGGTCTGGAAGAGATTGGCGTTGTCTGCCAGCAGGCGGGCGGTCACGCGGCATTCGTTGATGCCGGTAAACTGTTGCCGCATATCCCGGCAGACCAGTTCCCGGCACAGGCGCTGGCCTGCGAGCTGTATAAAGTCGCCGGTATCCGTGCGGTAGAAATTGGCTCTTTCCTGTTAGGCCGCGATCCGAAAACCGGTAAACAACTGCCATGCCCGGCTG > NC_000913/3889683‑3889975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |