| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1028361 = | NA (NA) | 11 (0.030) | 8/244 | NT | NA | intergenic (+2/+43) | yccU/hspQ | putative CoA‑binding protein/heat shock protein involved in degradation of mutant DnaA; hemimethylated oriC DNA‑binding protein |
| ? | NC_000913 | 1028395 = | NA (NA) | intergenic (+36/+9) | yccU/hspQ | putative CoA‑binding protein/heat shock protein involved in degradation of mutant DnaA; hemimethylated oriC DNA‑binding protein | |||||
Only 100 of 379 total aligned reads displayed.
CAACTGGGGGTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTT > NC_000913/1028246‑1028544 | aCTGGGGGTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGtt > 1:6248339/1‑150 (MQ=255) tGGGGGTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCa > 2:1546965/1‑150 (MQ=255) ggggTGATTAATGAGCATGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGATATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAgg < 1:3006966/150‑1 (MQ=255) ggggTGATTAATGAGCAAGCGGCCGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTACATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGTTATTGCCTTCCGGGGAttttttattt < 1:5347927/150‑5 (MQ=38) ggggTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAACAAATCCCCGGACGGTTTTTGCCTTCCGGGGAttttttattt < 1:6264146/150‑5 (MQ=37) gggTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCATATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAggg > 2:3387891/1‑150 (MQ=255) gggTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAggg > 1:1280167/1‑150 (MQ=255) gggTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGATAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCACTAGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAggg > 2:3696315/1‑150 (MQ=255) gTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGTTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCAAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGAt < 1:59866/150‑1 (MQ=255) tGATTACTGCGCAAGCGGCAGTACGGGCCCGGGATGCCGGGTTACATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAAGAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGAtt < 2:116197/150‑1 (MQ=255) aTTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAg > 2:4002318/1‑150 (MQ=255) aTTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAg > 1:2803454/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGtt > 1:804074/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGtt > 2:5407498/1‑150 (MQ=255) aaTGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTa > 2:680777/1‑150 (MQ=255) aTGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTAc > 2:4855108/1‑150 (MQ=255) aTGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTAc > 1:4605683/1‑150 (MQ=255) tGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGTGATGCCGGGTTACATGTGGTGTTGGATCGCTGCCCGGCTTTTGAGATCCATCGCCTGGGCCTGGCAAAATAAAAAATCCCCGTAATTCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACg < 1:3863830/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) CCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAg < 2:283486‑M1/150‑1 (MQ=255) cggaaggtttttgccttccggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGc > 2:5617890‑M2/28‑150 (MQ=255) CGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGc < 2:2956821‑M1/150‑1 (MQ=255) GGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGcc > 2:2123635‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGt > 1:1230295‑M1/1‑150 (MQ=255) GCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTa < 1:6696074‑M1/150‑1 (MQ=255) cAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtag < 2:6076180/150‑1 (MQ=255) aaaaaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtagg > 1:3356479/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtagg > 1:6489649/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtagg > 1:4344461/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtagg < 1:5115924/150‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTg < 1:4849929/60‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTAt < 1:3770004/150‑1 (MQ=255) aaCCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTAt > 1:1011135/1‑150 (MQ=255) ttccggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAAc > 1:554066‑M2/13‑150 (MQ=255) ccggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCg < 1:3089998‑M2/140‑1 (MQ=255) cggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCCGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCgg < 2:795343‑M2/141‑1 (MQ=255) ggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATc > 2:894607‑M2/9‑101 (MQ=255) ggggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATc < 1:894607‑M2/93‑1 (MQ=255) gggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTc > 1:2224528‑M2/8‑127 (MQ=255) gggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTc < 2:2224528‑M2/120‑1 (MQ=255) ggatttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAg < 1:4979842‑M2/144‑1 (MQ=255) atttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGc < 2:1953277‑M2/146‑1 (MQ=255) atttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGc < 2:3535360‑M2/146‑1 (MQ=255) tttGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCaggtagg > 2:5503284‑M2/4‑134 (MQ=255) tGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGt < 1:6115970‑M2/149‑1 (MQ=255) | CAACTGGGGGTGATTAATGAGCAAGCGGCAGTACTGGCACGGGATGCCGGGTTAAATGTGGTGATGGATCGCTGCCCGGCTATTGAGATCCCTCGCCTGGGCCTGGCCAAATAAAAAATCCCCGGAAGGCAAAAACCTTCCGGGGATTTGTTCAGGGATTAGTTACGCAGACGCGGGGCCTGGAGTTGTTTGCGGATGGTCTGCGCCAGCTCATCCATGGATGGCTGTTCAGGATGTTCATCCTGCAATTCGCTACTTAGCTGGGCTTCAGCCAGGTAGGTATGAACCGGTAGGCCGTT > NC_000913/1028246‑1028544 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |