New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 1327735 = | NA (NA) | 10 (0.030) | 10/256 | NT | NA | intergenic (+8/+32) | rluB/btuR | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase/cob(I)yrinic acid a,c‑diamide adenosyltransferase |
? | NC_000913 | 1327758 = | NA (NA) | intergenic (+31/+9) | rluB/btuR | 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase/cob(I)yrinic acid a,c‑diamide adenosyltransferase |
Only 100 of 391 total aligned reads displayed.
AAGTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGATGTGG > NC_000913/1327609‑1327907 | acgggtcgtggttgtcatcgggatattcttgaactggcagatacggtaagtgaattacgccccgtcaaacatgcgtttgatgccggtgtaaaagcgcagatagggatcgattattaatctgtaaaaATGCCGGACGTCATATCCGGCAtt > 2:4985221‑M1/127‑150 (MQ=255) aGTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCAttt < 1:60138/150‑1 (MQ=255) gTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCAtttt > 1:352166/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCAtttt > 2:5489414/1‑150 (MQ=255) cGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTa < 2:530576/150‑1 (MQ=255) cTGTAGAAAAAGACCGTCGTCTCTTGAAGGCGAATCATATTCGTCGTGCTGTGAATCGTCACAGTCAGTTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATTATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACa < 1:4877892/150‑1 (MQ=255) tGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAg > 2:2922596/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATta > 1:2695461/1‑150 (MQ=255) gAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATta < 2:3156538/150‑1 (MQ=255) aGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTaataat < 1:5344007/150‑1 (MQ=255) gACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATc < 1:114649/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATcc < 2:2359313/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATcc > 1:6501770/1‑150 (MQ=255) tcgCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTa > 1:2315321/1‑150 (MQ=255) cATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCt > 2:5816407/1‑150 (MQ=255) gCGAATCAGATTCGACGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGAGAGCGGCGGTCGTCGTACTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCttt > 2:5604994/1‑150 (MQ=255) aaTCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTac > 1:6106018/1‑150 (MQ=255) agtttCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCg < 1:4540769/147‑1 (MQ=255) 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gaattacgccccgtcaaacatgcgtttgatgccggtgtaaaagcgcagatagggatcgattattaatctgtaaaaATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATc < 1:3264279‑M1/41‑1 (MQ=255) gCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGc < 2:5198521/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCa < 1:4307256/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGACGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCa < 1:3592532/150‑1 (MQ=255) aaaCGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCt < 1:3367988/124‑1 (MQ=255) aaCGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTacac > 2:3791835/1‑130 (MQ=255) tCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACgg < 1:4588811/150‑1 (MQ=255) caGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGc < 2:2549392/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGt > 1:1050633/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAATTATGCCGGACGTCAAATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTAACTGCGCTTTTAAAACGGCATCAAACGCATGTTTGAAGGGGCGTa > 1:2744389/1‑150 (MQ=255) tCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTa > 2:3983391/1‑150 (MQ=255) 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CCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATa > 1:3784893‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATaa > 1:634651‑M1/1‑150 (MQ=255) ACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCa > 2:2693677‑M1/1‑150 (MQ=255) cATATCCGGAATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGt < 1:2062236/150‑1 (MQ=255) tatCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCt > 1:59867/1‑150 (MQ=255) tatCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCt < 1:554417/150‑1 (MQ=255) cggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTCTCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTg > 1:5622105‑M2/7‑150 (MQ=255) cggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTg > 1:5174670‑M2/7‑150 (MQ=255) cggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTg > 1:165374‑M2/7‑150 (MQ=255) ggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGt > 1:5253650‑M2/6‑143 (MQ=255) ggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGa > 1:2840989‑M2/6‑150 (MQ=255) ggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGa > 2:6186473‑M2/6‑150 (MQ=255) ggcatTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGa > 2:2429287‑M2/6‑150 (MQ=255) tTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGAtgtg < 1:1976555‑M2/149‑1 (MQ=255) ttttACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGATGTgg < 2:685380/150‑1 (MQ=255) | AAGTCGCTGTAGAAAAAGACCGTCGTCGCATGAAGGCGAATCAGATTCGTCGTGCGGTGAAACGTCACAGTCAGGTGAGCGGCGGTCGTCGTTCTGGCGGACGTAATAATAACGGTTAATCAAAGTATGCCGGACGTCATATCCGGCATTTTTACAGATTAATAATCGATCCCTATCTGCGCTTTTACACCGGCATCAAACGCATGTTTGACGGGGCGTAATTCACTTACCGTATCTGCCAGTTCAAGAATATCCCGATGACAACCACGACCCGTGATAATCACCGTCTGTTGATGTGG > NC_000913/1327609‑1327907 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |