Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 843,216 | G→T | 14.6% | M295I (ATG→ATT) | rlmF → | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 843,216 | 0 | G | T | 14.6% | 697.0 / 25.6 | 252 | M295I (ATG→ATT) | rlmF | 23S rRNA m(6)A1618 methyltransferase, SAM‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (79/129); new base T (41/2); total (121/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.65e-13 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
CAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGTTT > NC_000913/843067‑843365 | cAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATg > 2:3384916/1‑150 (MQ=255) ggTGATTTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAATATTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGTCGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAATAGATTGCCCAGTGTCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACCTTTATGaa < 1:6044343/150‑1 (MQ=255) gtgGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAAcgacga < 2:2846696/150‑1 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTTCCTGGGCCGTTATGAAAGACGagca > 2:1755217/1‑150 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGagca > 2:407614/1‑150 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGagca < 2:3925967/150‑1 (MQ=255) gTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCATTATTAACGACGagca > 2:3784152/1‑150 (MQ=255) tttACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCTGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGagcag > 2:3589882/1‑150 (MQ=255) ttACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGagcagc < 1:1404272/150‑1 (MQ=255) gtACATCACTGGTATCTCGTGGTGAACACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGagcagc < 2:5596875/149‑1 (MQ=255) aTCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGGCTGGACCGTTATTTACGAAGAGCAGcgccg > 1:6654079/1‑150 (MQ=255) tCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGTTGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGcgccgc < 1:3769037/150‑1 (MQ=255) tCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCAGGAGCTTTTTTAAAGACGAGCAGcgccgc > 1:4856860/1‑150 (MQ=255) cACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGAGGTGGGCGCGGTGAAGGTGTTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCgccgcc < 1:4690242/150‑1 (MQ=255) tGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCAGGACCGTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCCtt > 1:572269/1‑150 (MQ=255) ggTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGttt < 2:5953241/150‑1 (MQ=255) ggctctcGTGGGGACCACTTCCCGCCGTTGTATCGGGCCCGGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAACAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGtttt < 2:4256561/147‑1 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGTACCTTTATTAACGACGAGCAGCGCCGCCGtttt < 1:3921720/150‑1 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGtttt < 1:2107309/150‑1 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGtttt < 1:6531911/150‑1 (MQ=255) gTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGtttt < 2:1551274/150‑1 (MQ=255) aTCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGTGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGt < 1:4742981/150‑1 (MQ=255) tcGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCaa < 1:2807277/150‑1 (MQ=255) tcGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCaa < 1:5063743/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAAt < 1:3411853/150‑1 (MQ=255) cGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCGGTAATAACGACCAGCAGCGCCGCCGGTTTGTCacg > 2:3265751/1‑148 (MQ=255) gtggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTAATTGACCGTTATTAAAAACGAGAAGCGCCCCCCTTTTGTCaaaa > 1:1210657/1‑148 (MQ=255) gtggtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATc < 2:4313373/150‑1 (MQ=255) gtgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCCTGGACCATTATAAAAGACGATCAGCGCCGCCCTTTTTTAAATCGcc > 2:5643807/1‑150 (MQ=255) tgAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCGGGACCGTTATGAAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGccc > 2:2694926/1‑149 (MQ=255) aaaCTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTCCTGGGCCGTTATTTAACACCAGCAGCCCCCCCCGTTTTTCAAACGCCACCg > 1:5504719/1‑150 (MQ=255) aaCTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGTCCATTATGAACCACGAGCAGCGCCGCCGGTTTGTCAATAGCCAGCgg > 2:2558697/1‑149 (MQ=255) cTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCGGGACCATTATTAAAGACGAGCACCGCCGCCGGTTTTTAAAAAGCCACCGTTa > 2:1408602/1‑150 (MQ=255) tACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTaaa < 2:2157995/150‑1 (MQ=255) aCCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCCGGACCATTATGAACGCCGCGCAGCGCCGCCCGTTTGTCAAACGCCAGCGGTAAAg > 2:2722807/1‑150 (MQ=255) ccgccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGc < 1:2586727/150‑1 (MQ=255) cgccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCGGGACCATTTTTTAAGACCAGCACCGCCGCCCGTTTGTCAAACGCCCGCCGTaaaaag > 1:5918695/1‑147 (MQ=255) gccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGAAGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCAGGACCAGTATGAACCAAGAGCACCGCACCCGCTTTGACAATCCCCAACGTTAAAGCG‑t > 2:6773418/1‑150 (MQ=255) ccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑tt < 1:725956/150‑1 (MQ=255) ccgTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑tt < 2:1086260/150‑1 (MQ=255) gTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGCCTGGACCTTTAATAACGACGAGCAGCCCCGCCGGTTTGTCAATCGCCAGCGGTAAAGCG‑TTgg > 2:1453977/1‑150 (MQ=255) cGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTccccc < 1:1560194/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCcgg < 2:5757211/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCcgg < 1:1408602/150‑1 (MQ=255) tGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCcgg < 2:5278158/150‑1 (MQ=255) ccTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGGCCTTTATGAACGACGAGCCGCGCCGCCGGTTTGTCAAACGCCAGCGGTAAATCG‑TTGGTTCCCCccgcgg > 1:4975917/1‑150 (MQ=255) ccTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCcggcgg > 2:6171845/1‑150 (MQ=255) ccTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGGTTTTTGCTGGGCCGTTATTAAAGACCAGCACCCCCCCCCGTTTTTGAATAGCCCCCGGTAAAGCG‑GTGGTTGCCCccgcgg > 1:3184412/1‑150 (MQ=255) tGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGCTGGACCGTTATTAAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTTTGAATAGCCACCGGTAAAGCG‑TTGGTTGCCCccgcggga > 1:1637652/1‑148 (MQ=255) gacggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCGGGGCCATTATTAAAGACCAGCAGCGCCGCCCGGTTTTGAAACGCCACCGGTTAAGCGTTTGTTTCCCCcgccggaa > 1:6539084/1‑148 (MQ=255) cggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACg < 1:1025269/150‑1 (MQ=255) cggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACg < 1:2205874/150‑1 (MQ=255) ggacgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACgg < 1:5020080/150‑1 (MQ=255) acgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGtt < 1:2438788/150‑1 (MQ=255) acgTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGtt < 2:4746789/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCa < 1:3514351/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCgg < 1:1821427/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCgg < 1:3100841/150‑1 (MQ=255) gcgGTGAAGGTTGTTAAAAAAGAGAGGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGCCCGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TGGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCggg < 2:4030279/150‑1 (MQ=255) ggtggtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTTTTTGCGGGGCCATTATTAAAGACGAGCAGCCCCCCCCGTTTTTGAAAAGCCACCGGTAAAACG‑TTGGTTCCCCCCGCGGGAAACGTTCAACCGGGGTGGCGcc > 1:4461309/1‑150 (MQ=255) gtggtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACCGTTATTAAAGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAAAAGCCAGCGTTAAATCG‑TTTGTTACCCCCGCGGTAAACGTTCAGCCGGGGTCGCGccc > 2:848680/1‑150 (MQ=255) gtggtTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCGGGACCATTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGccc > 2:4533973/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgc < 2:5918695/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgca < 2:500924/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCGTTATTTGCGGGACCGTTATTAAAGAAGAGCAGCGCCGCCCGTTTGTGAAAAGCCACCCGTTAAGCG‑GTGGTTGCCCCCGCCGGAAAGGTTCAGCCGGGGTGGCGCCCGGAgca > 2:2352271/1‑150 (MQ=255) aaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcag < 2:637245/150‑1 (MQ=255) aaaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGGTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCCGGGTCGCGCCCGGAgcag > 2:1692308/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTCCTGGACCTTTATGAAAGACGAGCAGCGCCGCCCTTTTGTCAAAAGCCACCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTAAGCCGGGGTCGCGCCCGGAgcagg > 2:2770419/1‑150 (MQ=255) aaaGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTTGCGGGACCTTTATTAAAGACGAGCAGCGCCCCCGTTTTTTAAAAAGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCCGCGGTAACCGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCCGAgcaggc > 2:2983116/1‑150 (MQ=255) aTGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCAcc < 1:900978/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCAcc < 2:5729729/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGGTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCt < 2:3811293/150‑1 (MQ=255) cccAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGCCTGGACCTTTTTGAACGACGAGCCGCGCCGCCCTTTTGTCCATCGCCAGCGGTAAAGCG‑TTTGGTCCCCCGGCGGTAACGGGTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGCGCAGGCCGCACCGGAt > 2:2636541/1‑150 (MQ=255) ccAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTTTTGCCGGGACCTTTATGAACGCCGCGCAGCGCCGCCGGTGTGTCAATCGCCAGCGGTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGGAACGGTGCCGCCGGGGGCGCGCCCGGGGCCGGCGGccccggcta > 2:3690185/1‑145 (MQ=255) cAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATaa < 2:1637652/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATaa < 2:5471761/150‑1 (MQ=255) gCAAACGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTg < 2:6689651/150‑1 (MQ=255) aaaaGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCa < 1:5127318/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGAGTCGCTTTATTGGCGGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAAACTCCACCGTTAAATCG‑CAGGTTAACCCCGCGGTAACGGTTAAGCCCGGGTCGCGCCCCGAGCAGGCAGCACCAGATAATTATGCaa > 2:1945429/1‑149 (MQ=255) aGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTg < 2:1809475/150‑1 (MQ=255) cAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGgc < 2:5093855/150‑1 (MQ=255) tCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑GTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGcgcgcg > 1:6753870/1‑150 (MQ=255) cTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAc > 1:6227574/1‑150 (MQ=255) tttATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcg > 2:3064167/1‑150 (MQ=255) ttATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCTGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgc > 1:3686999/1‑150 (MQ=255) ttATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgc < 2:4547574/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTTTAAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTTATATGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgccc < 1:407614/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGTTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCTGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgccc < 1:5633045/150‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgccc < 1:6085032/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGa > 2:203977/1‑107 (MQ=255) ttGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAAcgcccg > 1:3867958/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCa < 2:3184412/150‑1 (MQ=255) cTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGATAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGAGGTAACGGTTCATCCGTGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCTCGCGAACGCCCGCCAg > 2:4160858/1‑150 (MQ=255) ggACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGGGCGTTCGCGCGCCAgtg < 2:2263075/150‑3 (MQ=255) cTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGaa > 2:4707165/1‑150 (MQ=255) cTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGaa > 2:4444588/1‑150 (MQ=255) tATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATg > 1:994334/1‑150 (MQ=255) aTGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGt > 1:3314955/1‑150 (MQ=255) gAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGttt < 1:6171845/150‑1 (MQ=255) gAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGttt > 2:609201/1‑150 (MQ=255) | CAGGTGATGTGGTTTACATCACTGGTATCTCGTGGTGAAAACTTACCGCCGTTGTATCGTGCCCTGACGGACGTGGGCGCGGTGAAGGTGGTTAAAAAAGAGATGGCCCAGGGGCAAAAGCAGAGTCGCTTTATTGCCTGGACCTTTATGAACGACGAGCAGCGCCGCCGTTTTGTCAATCGCCAGCGTTAAAGCG‑TTGGTTCCCCCGGCGGTAACGGTTCAGCCGGGGTCGCGCCCGGAGCAGGCAGCACCTGATAAGTCTGCACTGGCGCGCGAACGCCCGCCAGGTCGAAATGTTT > NC_000913/843067‑843365 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |