| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 2817942 | 98 (0.690) | 4 (0.030) | 4/238 | NT | 3.8% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
| ? | NC_000913 | 2818492 = | 121 (0.990) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCG > NC_000913/2817796‑2818091 | gAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGc < 1:584970/150‑1 (MQ=255) gACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGcc < 1:143261/150‑1 (MQ=255) gACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCATATTATTCATCTGGAACACTTATTCTACTGCTTCTATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCTATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGcc < 1:143310/150‑1 (MQ=17) cTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCg < 2:1937054/150‑1 (MQ=255) tCGTTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCgg < 2:750275/150‑1 (MQ=255) tCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCgg < 2:2018539/150‑1 (MQ=255) gTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGcc < 1:86063/150‑1 (MQ=255) cGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGtt < 1:957780/150‑1 (MQ=255) gTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTTATAATGATACCGCTAATATAGCCATATCTATTTAGAGATGGTGCATCCGGGAGGCTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTg < 2:373847/150‑1 (MQ=17) gTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTg < 2:1485043/150‑1 (MQ=255) cgtggtctctATGCTGCTGAGCTTCGTATTCATCTGGAATACTTATTCTACTGCTTTTATTGATACATATTCTAAAGCCATATCAATTACGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:750021/144‑1 (MQ=17) cgtgTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGTGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGAGACAGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:1378984/147‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:2061270/150‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:280340/150‑1 (MQ=255) cGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTaaa < 1:155851/150‑1 (MQ=255) gAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAg < 2:522562/150‑1 (MQ=255) tACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCaa < 1:2348071/150‑1 (MQ=255) tctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGt > 1:682858/1‑150 (MQ=255) 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aTCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTa > 1:860320/1‑150 (MQ=255) tCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCGTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTaa > 1:490945/1‑150 (MQ=255) gggAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAAtt > 1:296696/1‑150 (MQ=255) ggAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTc < 1:1249100/150‑1 (MQ=255) cgAAAAATTATTCCACTCCTCATATCTATACCTCTATTATATCGATATTTTTTACCAGATGGTGCATACGGGTGTTTTTGTCTCATTGAGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTACAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTc < 2:481953/149‑1 (MQ=9) 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aTCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCg > 2:1194272/1‑150 (MQ=255) cGGGAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctc > 2:414736‑M1/1‑10 (MQ=255) gggAGGATTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcgg < 2:44046‑M1/84‑76 (MQ=255) ggaggaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTATTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCATCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCt > 1:1756379/1‑150 (MQ=255) gaggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcg < 2:425892‑M1/150‑144 (MQ=255) gaggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcg < 2:2216476‑M1/150‑144 (MQ=255) gaggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcg < 2:792655‑M1/150‑144 (MQ=255) aggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggat < 1:874030‑M1/62‑57 (MQ=255) aggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggat < 1:873946‑M1/62‑57 (MQ=255) aggaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggat > 2:874030‑M1/1‑6 (MQ=255) gtttACTAGCCTTGCGGATCGCCCTTCGGTCAGTTTGTACATCAACGTTTACATCCCTATTTCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa < 2:295697/148‑1 (MQ=18) gaTTcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgtggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggcc > 2:653587‑M1/1‑4 (MQ=255) gaTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGa < 2:123057/150‑1 (MQ=255) tcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttcgcaggggagcgccttcagcctctcggccacc > 1:1851954‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggccacc > 1:911909‑M1/1‑1 (MQ=255) tcgaacctccgaccgctcggttcgtagccgagtactctatccagctgagctacggatgcaaatggcggtgaggcggggattcgaaccccggatgcagcttttgaccgcatactcccttagcaggggagcgccttcagcctctcggccacc > 1:696919‑M1/1‑1 (MQ=255) | GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTGATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGACCG > NC_000913/2817796‑2818091 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |