| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,515,338 | G→T | 7.5% | G193* (GGA→TGA) | ydcV → | putative ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,515,338 | 0 | G | T | 7.5% | 482.7 / 19.1 | 133 | G193* (GGA→TGA) | ydcV | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/78); new base T (5/5); total (50/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCACTGCTG > NC_000913/1515191‑1515484 | tgtgTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagga < 2:1434771/150‑1 (MQ=255)tgtgTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagga < 2:1434840/150‑1 (MQ=255)tgtgTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagga < 1:2030678/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggag > 2:2225018/1‑150 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggag > 2:2225245/1‑150 (MQ=255) ttGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGc > 2:2301789/1‑150 (MQ=255) gtggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTg < 2:115738/150‑1 (MQ=255) tggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg > 2:1015299/1‑150 (MQ=255) tggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg > 2:2098893/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 2:1167291/150‑1 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 1:1989985/150‑1 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 1:1569586/150‑1 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 2:629583/150‑1 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 2:1322627/150‑1 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt > 2:2090442/1‑150 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGtt > 1:1815159/1‑150 (MQ=255) tttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGttt > 2:1574229/1‑150 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTTGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAATCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGAGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTg < 1:2394263/150‑1 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTg < 2:2203697/150‑1 (MQ=255) tgaCAATGTCATCGACAGTTTTAGAAGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGAGTCAAGTGATATTGGGTCAAATGGATGGAAAAAATTCCGATAAGTAGTGTTGACGAATCTCAGTTAGGCGTTACTGTCAGGAGGAATGATGGCGttaga > 2:193269/3‑147 (MQ=255) tAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGc < 1:2019425/150‑1 (MQ=255) aCAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt > 2:2415035/1‑139 (MQ=255) aaTGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTg < 2:719603/150‑1 (MQ=255) tGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTc < 2:2220145/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc < 1:2100359/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc < 1:2268009/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc < 1:2267999/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc < 1:1127548/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc < 1:1127500/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTc > 1:948546/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCGTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGACTGCTGGCGGTTGCCGTGGCGTTc > 2:461713/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGAt > 1:2230704/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTTGTTGAGGCGTCATTTGATCTTGGGGCAAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTTCGTAGTGTTGCCGAATCTCTGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGaa < 1:1472355/150‑1 (MQ=255) cGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGaa < 1:2004401/150‑1 (MQ=255) tttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatc > 2:2284331/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatcat > 2:515269/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatcat > 2:575972/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatcat > 2:515253/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatcat > 2:2145923/1‑150 (MQ=255) cgccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAatcatc < 1:289816/150‑1 (MQ=255) cACCTGCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTAc < 2:933400/150‑1 (MQ=255) cACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTAc < 2:1854098/150‑1 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGa < 1:1875435/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCa < 1:1053802/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCa < 1:716437/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCa < 1:1053756/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCa < 1:169483/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCa < 1:1395555/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAgg < 2:1661865/150‑1 (MQ=255) gCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATgaa < 2:2387684/150‑1 (MQ=255) gCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATgaa < 1:2306317/150‑1 (MQ=255) cGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATgaac < 1:1866454/150‑1 (MQ=255) cGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATgaac < 2:489040/150‑1 (MQ=255) tCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTAcc < 2:1636569/150‑1 (MQ=255) ttGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGt > 2:926488/1‑150 (MQ=255) ttGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCGTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCGTTACGGCCGGGCAGGAACGAACGGTACCGt > 1:29924/1‑150 (MQ=255) gggCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTtgt < 2:2363909/150‑1 (MQ=255) ggCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTtgtg < 1:2236321/150‑1 (MQ=255) gcAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCa < 1:454868/150‑1 (MQ=255) gcAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCa > 1:1982750/1‑150 (MQ=255) gcAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCa < 1:2327804/150‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGc > 2:70521/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGc > 1:160299/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGc > 1:1936087/1‑150 (MQ=255) aaaCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCGTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGGTGTGGTTGCTCAATCAGc > 2:70528/1‑150 (MQ=255) aCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCtt < 1:1714191/150‑1 (MQ=255) aCCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCtt < 1:30796/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTgg < 2:2363469/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTgg < 2:603272/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTgg < 1:1088896/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTgg < 1:76110/150‑1 (MQ=255) cTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATAGTTACGACCTTTACGGCAGGGTATGAACGAACGTTACCGTTGGGGTTGCTCAATCAGCTTgg > 1:631125/1‑150 (MQ=255) ttCCGCGACGTAGTGGTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTggg < 1:1724825/150‑1 (MQ=255) cGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGa < 2:406278/150‑1 (MQ=255) cTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGAcc < 1:1519375/150‑1 (MQ=255) tACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACcg > 1:704972/1‑150 (MQ=255) aGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATTAAAACATCGTTACGACCGTTACGGCAGGTCATGAAAGAACCTTACCGTTTTGGTTGCTCAAACAGCTTGGGCGACCGCGTGa > 1:1698035/1‑150 (MQ=255) aGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGa > 1:1698004/1‑150 (MQ=255) aGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGa > 1:2147305/1‑150 (MQ=255) gtgtTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGAt < 2:239786/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACg < 2:738523/87‑1 (MQ=255) ttGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACg > 1:738523/1‑87 (MQ=255) tGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTAc < 2:1943460/150‑1 (MQ=255) aaTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTAAGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTAAATCAGCGTGGGCGACCGCGTGATGTACCCGta > 1:2107004/1‑150 (MQ=255) aaTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCAACGGTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGGTGTGGTTGCTCAAACAGCGTGGGCGACCCCGTGATGTAACGGta > 1:1202994/1‑150 (MQ=255) aTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGtaa < 1:515269/150‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGtaa < 1:2145923/150‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGtaa < 1:515052/150‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGtaa < 1:515253/150‑1 (MQ=255) aTCTCAGTTCGGCGTTACTGGCATGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGtaa < 1:575972/150‑1 (MQ=255) tcAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTTCCTTGTCGTTCGATGAAATCAACGTTAAGACCTTTACGGCAGGTCAAGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGCTGTACCGGtaacga > 1:2057233/1‑148 (MQ=255) ttACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCa > 2:1801522/1‑150 (MQ=255) ttACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCAACGTTACGACCATTAACGCAGGTCATGAAAGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATAAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACAAACGTGGTGGCa > 1:1508373/1‑150 (MQ=255) tACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCAc < 1:901021/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 2:1982767/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 2:1982750/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 2:1957934/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 1:2233652/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 2:1333233/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCActgctg < 1:987866/150‑1 (MQ=255) | TGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTCGTTCGATGAAATCATCGTTACGACCTTTACGGCAGGTCATGAACGAACGTTACCGTTGTGGTTGCTCAATCAGCTTGGGCGACCGCGTGATGTACCGGTAACTAACGTGGTGGCACTGCTG > NC_000913/1515191‑1515484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |