| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1465092 = | 134 (1.350) | 7 (0.080) | 7/256 | NT | 5.8% | intergenic (+31/+73) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein |
| ? | NC_000913 | 1465125 = | 105 (1.150) | intergenic (+64/+40) | paaY/ynbG | thioesterase required for phenylacetic acid degradation; trimeric; phenylacetate regulatory and detoxification protein; hexapeptide repeat protein/uncharacterized protein | |||||
TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465251‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG > NC_000913/1465125‑1465272 TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAAC < 2:1573657/150‑1 CAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACT > 2:569095/1‑150 CAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACT > 2:364288/1‑150 tGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCT < 1:1331826/149‑1 AATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATTAATTACAAATTAAAACCACAATCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTT < 1:1279622/150‑1 AATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTT < 2:839025/150‑1 ATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTT < 1:794289/150‑1 TAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTA > 2:1403406/1‑150 AAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATTAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGATTTAT > 1:1526942/1‑150 AAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT < 2:498702/150‑1 AAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT > 2:108839/1‑150 AAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAA > 2:979050/1‑150 AATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTGAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTa > 1:1656129/1‑149 ACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATG > 1:168065/1‑150 AATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTT > 2:1483533/1‑150 TAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTT > 2:1592499/1‑150 ATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTT > 1:1291569/1‑150 CAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCAC > 1:1583534/1‑150 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTG < 1:1070645/150‑1 CTCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACATGAATTATAATTGTG > 2:1702848/1‑150 TCTGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGA < 1:979050/150‑1 TGCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACAGTTTTTTAATCATATAATTATTTATAATGATAATGTGGTTTTAATTTGTATTTTATATTATATAAACAATTTATATATATCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAAT < 1:293672/150‑1 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT < 2:1506594/150‑1 GCTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATT > 1:1408035/1‑150 CTTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACATGAATTATAATTGTGAATTA > 1:1471122/1‑150 TTTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATAAACAATTTATATATTTAATGTTATTTTTTTATTCAAATGAATTATAATTTTGAATTAT > 1:1694435/1‑150 TTATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATTGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATA < 2:1520900/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 2:731616/150‑1 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTAACCTGAATTATAATTTTGAATTATAt > 1:714574/1‑149 TATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCAAATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAG < 1:294488/150‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG < 1:920766/150‑1 ATTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACATGAATTATAATTGTGAATTATAGG > 2:29176/1‑150 TCAGGTGAATAAAAAAAGACCATGAAATATATAAATTGTGTATATAATATAAATTACAAATTAAAACCACATTCTCATTATAAATAATTATATGATGAAAAAACGGTATGAATTAATACTCAAATAAATAAAGCAGAGCTTAAACATAACTCTGCTTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1465251‑1465092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctctgctttatTTATTTGAGTATTAATTCATACCGTTTTTTCATCATATAATTATTTATAATGAGAATGTGGTTTTAATTTGTAATTTATATTATATACACAATTTATATATTTCATGGTCTTTTTTTATTCACCTGAATTATAATTGTGAATTATAGG > NC_000913/1465125‑1465272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |