| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2730003 = | NA (NA) | 4 (0.040) | 4/264 | NT | NA | noncoding (1155/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA of rrnG operon |
| ? | NC_000913 | 2730041 = | NA (NA) | noncoding (1117/1542 nt) | rrsG | 16S ribosomal RNA of rrnG operon | |||||
ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2730158‑2730003‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caaaggaTAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGT > NC_000913/2730041‑2730189 cCGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATCTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC < 1:462352/149‑1ACGGAATTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGGGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC < 2:1123855/150‑1ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGCCAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCACCGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC > 2:1291222/1‑150ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC > 2:125189/1‑150ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC > 1:649675/1‑150ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC > 1:1670500/1‑150ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTC < 2:1623422/150‑1 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1:1655429/150‑1 GAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAA < 2:1462231/150‑1 GAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAA > 2:1646643/1‑150 GAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTT‑TGCTTTGTTTGAAGGGGTACGGCCCGGGACTAAAAa > 1:503672/1‑149 GAAGTTTGCAGAGATGAGAATGGGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGGCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAA < 2:808512/150‑1 AAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCGAAG < 1:1632805/150‑1 AAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAG < 2:1563122/150‑1 AAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAG < 2:992890/150‑1 AAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAG < 1:1691154/150‑1 AAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCGGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAG < 1:1390707/150‑1 AAGTTATCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGCTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCACCGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAG < 2:216215/150‑1 cGTTTTAATAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGGGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCTCATCGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG < 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AGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG < 1:935210/150‑1 AGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG < 2:753960/150‑1 AGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG > 1:689772/1‑150 AGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG < 1:645548/150‑1 AGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGG < 1:327307/150‑1 GTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGA < 2:972943/150‑1 GTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTAAGCGCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTACGTACCGCAACGAGCGCAACCCAGATCCATGGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAAAGCAAAGGA > 2:292184/1‑150 GTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCGGTCGGCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCCTCGAGCGCCACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGCAGTCAAAGGA > 2:158569/1‑150 GCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCAT > 1:1144517/1‑150 CCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCT > 1:1578465/1‑150 CCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTG > 1:1460488/1‑150 TATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGCCTTACCCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGCCGGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAGGGCCCATTGTCTTGTCTGAta > 1:1168616/1‑148 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT > 2:777824/1‑150 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT < 2:859717/150‑1 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT > 2:1464541/1‑150 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT > 2:1191401/1‑150 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT > 1:749081/1‑150 CAAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCT < 1:662649/150‑1 AAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTT < 2:1425992/150‑1 AAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTT > 1:1697792/1‑150 AAAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTT > 1:113860/1‑150 AAGGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTC < 2:1151783/150‑1 AGGATCAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTCACACAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCCCCTGTCTCACGGGTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCG < 1:205135/150‑1 AGGATAATGGGTTCGCTCGTTGCGGGACTTAAACCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCG < 1:942111/150‑1 GGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC > 2:1639488/1‑150 GGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC > 2:1311298/1‑150 GGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC > 2:1656321/1‑150 GGATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC > 1:872469/1‑150 GGATAAGGGTTGCGCGCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC < 2:406879/150‑1 GGATAAGGGATGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGC < 1:269045/150‑1 GATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCG < 1:565994/150‑1 GATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCG < 2:1476038/150‑1 ATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACGTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGGGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGT < 1:1065403/150‑1 ATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGT < 2:940144/150‑1 ATAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGT > 1:430041/1‑150 ACGGAAGTTTTCAGAGATGAGAATGTGCCTTCGGGAACCGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCCTTTGTTGCCAGCGGTCCGGCCGGGAACTCAAAGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2730158‑2730003‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caaaggaTAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATTTCACAACACGAGCTGACGACAGCCATGCAGCACCTGTCTCACGGTTCCCGAAGGCACATTCTCATCTCTGAAAACTTCCGTGGATGTCAAGACCAGGTAAGGTTCTTCGCGT > NC_000913/2730041‑2730189 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |