| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,560,985 | C→A | 15.7% | intergenic (+87/‑383) | yffL → / → yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,560,985 | 0 | C | A | 15.7% | 105.9 / 2.2 | 60 | intergenic (+87/‑383) | yffL/yffM | CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein/CPZ‑55 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/24); new base A (6/5); total (30/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAA > NC_000913/2560840‑2561134 | cGGCAGAAAGCGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGCCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCATTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCaaaa < 2:801972/150‑1 (MQ=255) ggCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGGCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAg < 2:1329638/150‑1 (MQ=255) ggCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAg > 2:909090/1‑150 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAAAAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTAAGTGGTGGGTCAAAAGt < 1:354572/150‑1 (MQ=255) gCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAACCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTACCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGTGTCAAAAGt > 2:1685988/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTTATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGATAGTGGTTTGTCAAAATTTGc > 2:1372528/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTTGGTAAAAATTTGc > 2:763541/1‑150 (MQ=255) aaaGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGcc < 1:453957/150‑1 (MQ=255) gttcAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:541631/147‑1 (MQ=255) gCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTGTGGAGGGTAATATTTTGAAGTTAAGGTg > 1:766307/1‑150 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAATTTGCCGTTAAggagtg > 1:981410/1‑146 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGTTGGGTCAAATGTTGCATTTAAGGAggg > 2:1174747/1‑150 (MQ=255) aaCGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTGCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGACAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg < 1:820202/150‑1 (MQ=255) ccAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTTGGTCAAAAGTTGACTTTAAGGATGCTCAAAAGt > 2:399783/1‑150 (MQ=255) aGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTg > 1:907429/1‑150 (MQ=255) gTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:520506/150‑1 (MQ=255) tattatTCAAGCAGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTCCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 2:1125410/150‑1 (MQ=255) ttattCAACCAGTAAAAGATGAAATTAAGTTATCAGTAGTGCAATGTTAACGCCATTTCTTTTCCTTAATTACATGAATTCAGGTGGGTAAATTTTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt < 2:1546816/150‑1 (MQ=16) cAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTATTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGAGGGTCAAAATTTTCCTTTAACGt > 2:1119789/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 1:909090/150‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAACAAGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCATTTTCTTTGCCTTAAATCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg < 2:871968/150‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAAAATGAAATAACGGAATCTGTCGGGCAATGTTCGCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGGGGGTGAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCTAAAGTTGCCGTTAAGTTg < 2:1326529/150‑1 (MQ=255) aGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg > 1:573806/1‑150 (MQ=255) cGTACAACATTAAATAAATTAATAAGTTGGGCATTTATCCAGCCTTTTGTTTTCCTTAAATTAATGAATTCATGTGTGTCAAAATTTGCCTTTATTGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc < 2:1107157/150‑1 (MQ=16) ttAACTGAATCAGTCGGGCAATGTTCCCGCGTTTTCTTTGCCATAATTCAATGAATTCTGGTGTGTCAAAAGTTTCCCTTATTGGTGGGTCAAATGTTGCCTTTAAGGTTGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAg < 1:578008/149‑1 (MQ=37) cAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTCAAAATTTGACTTTAAGGAGTGTCTATATTTCCGGGTAAGGTGAGTAAAAAATTGACTAGTAAGAATTct > 1:20130/1‑150 (MQ=255) cgccGGGCATTGATCCCGCCATTGCTTTTCCTTAAATCCATGAATTCCGGTGGGTAAAAAGTAGCCCTTATTGGTGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta < 1:658758/147‑1 (MQ=25) ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGTCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGACGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctaaaatt > 2:1709699/1‑145 (MQ=255) aaTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTAAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCTAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTAATATTatt > 1:1203429/1‑148 (MQ=255) cggcctttCTTTGCCATAAATCCCTGTATTCAGGCGGGTCAAAAGTTGCCGTTACTGGGGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg < 1:370196/145‑1 (MQ=37) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGATGGGTAAAATTTTGACTTTAAGGAGGGTCAAAATTTGACGTGAAGGTTTCTGAAAATTTGAATAGTAAAAATTATAATATTAAAAAtaatac > 2:1128773/1‑145 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGGGGGTCAAAACTTGCCGTTATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 1:1324279/150‑1 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGGTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGACGAGTAAGAATTCGACTATTAAGAATTCTAGGCGAc > 1:1584207/1‑150 (MQ=255) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAATTTGCCTAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGTAGtttt > 2:378706/1‑150 (MQ=255) ataccATCAATTCAGCTGCGTCAAAAGCACCCTTTCGTGGGGCGTCAAACGGTGCCGTTACGGTGGGTCAAAAGTTGCCCTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAg < 1:1684440/147‑1 (MQ=255) aatccatccaTTCAGGGTGGTCCACAGTGGCCGTTAGGGGTGGGTCAAAAGCTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAg < 1:879234/148‑1 (MQ=25) aTTCCATGAATTCAGGTGGGTAAATATCAGGCTTTATTTGTGGGTAAAAAGATGCCTTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAg < 1:1119789/150‑1 (MQ=25) tCCATGAATTCAGGTTGGTAAAAATATGGCCTTATTGGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGcc < 2:573806/150‑1 (MQ=37) ccATGAATTCAGTTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCt < 1:478581/150‑1 (MQ=255) tGAATTCCGGCGCGACAAAATTAGCCGTTAGTGGGGGGTCAAAAGCCGCCGTTAAGGTGGCTCAAAAGTAGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTccc < 1:1372528/150‑1 (MQ=37) gAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAATGGTGGGTAAAAATTTGCCTTGTAGGAGGGTCAAAAGTTGCAGGGTAGGTGTGTGAAATTTTGCGGAGAAAGAAGTCTACAATTAGGAATTATAGGCGTCGTGATTTTTGTAgtgtaggg > 2:959804/1‑143 (MQ=12) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGCGCAAAATTTTCAGAGTAACAATTATACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGCGTTTTTTATCCTACcgctcgtta > 2:1145528/1‑147 (MQ=21) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTTATGTGGGGCAAAAGTTTACGAGTAAGAATTCTACTATTAAGATTACTAGTCGACGGGAGTTATTAATACTCCAGCTCGGTCATaga > 1:1058462/1‑150 (MQ=21) gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCACGGTCGGTCATaga > 1:1331478/1‑150 (MQ=255) tCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGGTAAGGTGGGTCAAAAGTTTCCGTTAAGGTGGGGGAAATGTTGCGTAGTAAGCATTCTAATATTAAGAATACTATCCGTCTGGAGAGTTTTAGACGTCCGGTCGATCATagac > 2:1060994/1‑149 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag > 2:560326/1‑150 (MQ=255) aaaaGTTGCCGTTACTGGGGGGTCAAAACTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag < 1:755917/150‑1 (MQ=255) aaaaGTAGCCGTTTGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGTTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag < 1:1345359/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTGCCCTTAGTGGTGGGTCAAAACTCGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGGTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATagagag < 1:582942/150‑1 (MQ=39) atatGCCTTTATTGGGGGGTAAAAAGTTGCCGTTTAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg < 2:313629/147‑1 (MQ=38) aGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTAGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCg > 1:1257861/1‑150 (MQ=255) aggccttATTGGTGGGTCAAAAGTTGCCTTTAATGTGGGTAAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCt < 2:1462525/145‑1 (MQ=38) ccGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCGTag > 1:1280850/1‑150 (MQ=255) ttAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATAAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTACCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGt > 2:766204/1‑150 (MQ=255) gtgggggTAAAAAGGTGCCTTTAAGGTGGGTCAAAAGGTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTaaa < 1:555477/146‑1 (MQ=39) ggtggGTCAAAAGTTGACGTTACTGCGGGTCAAACGTTGCTCTTAAGGTTGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCAGGTCGGTCATAGAGAGTCGACTAGAGTTAAAc < 2:1617016/150‑1 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaat > 1:1553000/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaag > 1:1394383/1‑150 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaag > 1:1614973/1‑150 (MQ=255) gTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACagaag > 2:694090/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTTAGAATTCTAGGCGACGGCTGTATTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGACTAGAGTTAATCAtaagaa > 2:894425/1‑150 (MQ=37) | CGGCAGAAAGGGAGTGCAACGAATACCAGTTATTATTCAAGCCGTACAACATGAAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGGCGACGGGAGTTTTTTAGCCTCCCGGTCGGTCATAGAGAGTCGCCTAGAGTTAAACAGAAGAA > NC_000913/2560840‑2561134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |