| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,801,056 | A→T | 5.3% | N31I (AAT→ATT) | nrdI → | NrdEF cluster assembly flavodoxin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,801,056 | 0 | A | T | 5.3% | 310.4 / 4.8 | 108 | N31I (AAT→ATT) | nrdI | NrdEF cluster assembly flavodoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/49); new base T (2/4); total (55/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGTTTCCGTCCGGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGCT > NC_000913/2800909‑2801204 | ggtTTCCGTCCGGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATg > 2:751017/1‑150 (MQ=255) tttCCGTCCGGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGAGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGATTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGAGCATCCCGCGCAATGAg > 1:975738/1‑150 (MQ=255) cgtccgGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCAGGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCggg < 2:1219658/150‑1 (MQ=255) tccgGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCATTGAGCGGGat < 2:1465190/150‑2 (MQ=255) cgGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGCACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCATTGAGCGGGatgc < 1:831089/150‑4 (MQ=255) aTGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACAAGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTc < 2:904739/150‑1 (MQ=255) aTTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAgg < 1:1471180/150‑1 (MQ=255) ttATCCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGt < 1:1638197/150‑1 (MQ=255) ttAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGGGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGt < 1:382349/150‑1 (MQ=255) ttAACCGGCTGCATCCAGCGCCACCCGCGGCCAGTGGATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGt < 2:263276/150‑1 (MQ=255) ccGTCTGCCTCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGAc < 2:263102/150‑1 (MQ=255) ccGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGAc > 1:448738/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGAc > 1:1379582/1‑150 (MQ=255) tCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAg < 2:782787/150‑1 (MQ=255) tGCATCCAGCGCCACACGCGTCAAGTGCATGATCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACTCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGcc < 2:1195442/150‑1 (MQ=255) tGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGcc > 2:1430786/1‑150 (MQ=255) tGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGcc < 1:317442/150‑1 (MQ=255) tGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGcc < 2:1579156/150‑1 (MQ=255) tGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGcc > 2:127552/1‑150 (MQ=255) cATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCtt > 1:431962/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGCGCGGGAGCGGATTCAGGTAGACGAGCCTTAc > 1:1164207/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTAc > 1:876375/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTGTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTAAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACa > 2:854937/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACAt > 2:1267530/1‑150 (MQ=255) aGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGGGCGCATCCCGCTCAATGAGGGGGAGCGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATc > 1:1330934/1‑150 (MQ=255) gcgcCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATcc < 2:431962/150‑1 (MQ=255) gcCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTg > 1:950615/1‑150 (MQ=255) cacGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCg < 1:558370/150‑1 (MQ=255) acGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCATTGAGCGGGatgc > 1:1630489/1‑114 (MQ=255) acGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCATTGAGCGGGatgc < 2:1630489/117‑4 (MQ=255) cgGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGcc < 2:1327415/150‑1 (MQ=255) cgGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGcc < 2:863454/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGccc < 2:937823/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGccc < 2:747379/150‑1 (MQ=255) cccAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTACAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGGTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCct < 1:1054903/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCctc > 1:402517/1‑150 (MQ=255) aTGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTAcggc > 1:1015803/1‑150 (MQ=255) aTGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTAcggc > 1:1355483/1‑150 (MQ=255) aGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTAcggcggc > 2:1538308/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGACCGTTTAGGTCTGCCCGCGGGGCGCATCCCGGTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACAGCCTGATCGTGGCCACGTAcggcggcggc > 2:286401/1‑150 (MQ=255) cAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCAGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTAcggcggcggc > 1:593856/1‑150 (MQ=255) aGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTAcggcggcggcg > 1:149277/1‑150 (MQ=255) gTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACg > 1:599972/1‑150 (MQ=255) gTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACg > 1:1182077/1‑150 (MQ=255) tACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCt < 2:22230/150‑1 (MQ=255) tACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCt > 1:949923/1‑150 (MQ=255) ttCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGGTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGgc < 2:302142/150‑1 (MQ=255) tctcCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGgcg > 2:27620/1‑150 (MQ=255) ctcCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGgcgc > 1:876685/1‑150 (MQ=255) tcCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGcgcg < 1:1136337/150‑1 (MQ=255) tcCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGcgcg > 1:1324576/1‑150 (MQ=255) ccAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCgg > 2:672226/1‑150 (MQ=255) agcagcTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTg < 2:618990/150‑1 (MQ=255) cagcTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGcc < 1:751017/150‑1 (MQ=255) cagcTCCGAAAACACGCAGAGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGcc < 1:357840/150‑1 (MQ=255) agcTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCa > 1:1123906/1‑150 (MQ=255) agcTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCa > 2:1439507/1‑150 (MQ=255) cTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGGGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACg < 1:817251/150‑1 (MQ=255) tCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGa > 2:964005/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGAc < 1:508126/150‑1 (MQ=255) ccGAAAACACGCAGCGGTTTAGCGAACGTTTAGGTCGGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGCGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGAc < 1:169857/150‑1 (MQ=255) gAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCCGGCGCGGTGCCACGCCAg > 1:1086386/1‑150 (MQ=255) aaaCACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCAACCCGCTCAAAGAGCGGGAACGGTTTCAGGTAGAGGAGCGATACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACCGCTCGCGCGGTGCCACGACAGGt > 1:128197/1‑150 (MQ=255) aaCACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGGGCCACGACAGGTa < 1:672226/150‑1 (MQ=255) aaCACGCAGCGTGTTATCGAACGTTTCGGTCCGCCCGCGGCGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTa < 1:1626687/150‑1 (MQ=255) cacGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAAt > 2:1492852/1‑150 (MQ=255) acGCAGCCTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCCCATCCCGCTCAATGAGAGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGAGCCCTCATACGGCGGCGGCGGTTCGGATGGCGCCGTTCCACGACAGGTAAtt > 1:338928/1‑150 (MQ=255) gCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATGCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGTCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTct < 2:847529/150‑2 (MQ=255) gTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCtttt > 2:1220715/1‑150 (MQ=255) gTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCtttt > 1:1097161/1‑150 (MQ=255) ttttATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCttttt < 2:646752/150‑1 (MQ=255) ttttATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCttttt < 2:133037/150‑1 (MQ=255) tATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTaaa < 1:1435359/150‑1 (MQ=255) cGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAacga > 2:1653828/1‑150 (MQ=255) cGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAacga > 2:502412/1‑150 (MQ=255) gAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCGCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAacgac > 1:124163/1‑150 (MQ=255) gAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAacgac > 2:1237121/1‑150 (MQ=255) gAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAacgac < 2:876375/150‑1 (MQ=255) cGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGCCAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAg > 2:379236/1‑150 (MQ=255) tttAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGca < 1:1042122/150‑1 (MQ=255) ttAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGcac < 1:1267926/150‑1 (MQ=255) gTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCCCGACAGGGAATTCGCTTTTTAAACGGCGAGCACAAcc > 1:285624/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCg < 1:1538308/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGc > 2:1677052/1‑150 (MQ=255) ccGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGt > 2:1390014/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGtt < 1:1597211/150‑1 (MQ=255) gTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGTTTCAGGTAGACGAGCCTGACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTATAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCtt > 1:324978/1‑150 (MQ=255) tGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTc > 1:815035/1‑150 (MQ=255) gcATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTcgcg > 1:1463/1‑150 (MQ=255) gcAGCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAATCGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTcgcg < 1:1052909/150‑1 (MQ=255) cgttCCCGCTCATTGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTcgcg > 1:1626773/4‑150 (MQ=255) cccGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGt > 2:1244780/1‑150 (MQ=255) cccGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGt < 1:1430786/150‑1 (MQ=255) ccGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGtt > 2:299054/1‑150 (MQ=255) ccGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCGGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGtt < 2:154742/150‑1 (MQ=255) gCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCATCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAACCGCCGAGCACCACCGGGCGTAGCGTCGCGGCGTTAt > 1:870075/1‑150 (MQ=255) tCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTg < 1:1677052/150‑1 (MQ=255) gcAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGTGGCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTTCGTCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTTATTCGCTTTTTTAACTACGATCACATGCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTg < 1:929190/149‑1 (MQ=255) cAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGGGCCCTCTTCCGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGc < 2:1483609/150‑1 (MQ=255) aaTGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGCt < 1:854937/150‑1 (MQ=255) | GGTTTCCGTCCGGACATGATTAACCGTCTGCATCCAGCGCCACACGCGGCCAGTGCATGAGCCAGCTCGTCTACTTCTCCAGCAGCTCCGAAAACACGCAGCGTTTTATCGAACGTTTAGGTCTGCCCGCGGTGCGCATCCCGCTCAATGAGCGGGAACGGATTCAGGTAGACGAGCCTTACATCCTGATCGTGCCCTCTTACGGCGGCGGCGGTACGGCTGGCGCGGTGCCACGACAGGTAATTCGCTTTTTAAACGACGAGCACAACCGGGCGTTGCTTCGCGGCGTTATTGCT > NC_000913/2800909‑2801204 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |