Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,911,007 | 0 | G | A | 9.5% | 336.7 / 16.1 | 115 | R29C (CGT→TGT) | mazF | mRNA interferase toxin, antitoxin is MazE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/47); new base A (4/7); total (61/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.43e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.43e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGA > NC_000913/2910858‑2911155 | tACCTGATGAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACg < 2:1235405/150‑1 (MQ=255) tACCTGATCAGCTACCGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACg < 2:362681/150‑1 (MQ=255) aCCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa > 2:915260/1‑150 (MQ=255) 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cTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGt > 1:467001/1‑150 (MQ=255) cTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGt > 2:1192693/1‑150 (MQ=255) ggACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCACCCCAGTCGATATTCTCGTGGAg < 2:731375/150‑1 (MQ=255) gACAACAGCTGGACGATTTACAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTAGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGTTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAgg < 2:1231273/150‑1 (MQ=255) gACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAgg > 2:431/1‑150 (MQ=255) cgagcaaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGTGTC‑TAAATCAACCCAAATCAGATCGACCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTTCCAGACTTAATAATCTTTCGGCTCTCCCCAGTAGATATTATAGTGGAgg > 1:641443/7‑150 (MQ=255) acaacaGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGt < 2:1183397/150‑1 (MQ=255) agcaaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGtt > 1:1290106/5‑150 (MQ=255) agcaaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGtt > 1:1460093/5‑150 (MQ=255) gcaaGCTGGACATCGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCCCCCATATCGGGTACGTATCGGCTGCCCATTACCAGAGTTGCTGAGCTTTCGGCGCTCACCAGTCGGTATTCGCGTGGAGGgtt > 1:826646/4‑150 (MQ=255) acaGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGtttt > 1:579621/1‑150 (MQ=255) caGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTc < 1:915260/150‑1 (MQ=255) aGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTcc < 1:1633804/150‑1 (MQ=255) gCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCg > 2:141742/1‑150 (MQ=255) gCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCg > 1:1008192/1‑150 (MQ=255) cTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCgg > 1:1710802/1‑150 (MQ=255) cTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCgg < 1:1247828/150‑1 (MQ=255) tGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGCCTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGGCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGc < 1:1059507/150‑1 (MQ=255) ggACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCg < 1:1577195/150‑1 (MQ=255) gACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGt > 1:199389/1‑150 (MQ=255) cGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCACAGACGATTTTCGCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGa > 2:1324649/1‑150 (MQ=255) | TACCTGATCAGCTAACGCTACGCCATCACGTTCCTGACCGGATAAAACAACTTCGAACGGATATCCTTTTGATTGCGTTGTACAAGGAACACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGATGTCCAGCTTGCTCGCTACCTTTTGTCGGGTC‑AAAATCAACCCAAATCAGATCGCCCATATCGGGTACGTATCGGCTTACCATTACCAGACTTCCTTATCTTTCGGCTCTCCCCAGTCGATATTCTCGTGGAGGTTTTCCGGCGTGA > NC_000913/2910858‑2911155 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |