| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,917,909 | T→G | 7.1% | intergenic (+96/+136) | barA → / ← gudD | hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY/D‑glucarate dehydratase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,917,909 | 0 | T | G | 7.1% | 364.2 / 15.4 | 127 | intergenic (+96/+136) | barA/gudD | hybrid sensory histidine kinase, in two‑component regulatory system with UvrY/D‑glucarate dehydratase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (60/57); new base G (6/3); total (66/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATG > NC_000913/2917761‑2918057 | tGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATc > 1:234583/1‑150 (MQ=255) ggACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCTGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATcc < 2:776563/150‑1 (MQ=255) ggACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATcc > 2:649214/1‑150 (MQ=255) ggACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATcc < 1:1327216/150‑1 (MQ=255) gagaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGcc < 2:542715/150‑1 (MQ=255) gagaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGcc < 1:1443758/150‑1 (MQ=255) gaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTa > 2:752917/1‑150 (MQ=255) tGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCCATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTGTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCATaaa < 1:123087/150‑3 (MQ=38) tGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACa < 2:1432574/150‑1 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCATaaac < 1:1395934/150‑4 (MQ=39) aTAATGTCGCGCTCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa < 2:211657/150‑1 (MQ=255) aTAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaaaa > 1:1715819/1‑150 (MQ=255) tAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc < 1:1616529/150‑1 (MQ=255) aTGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTACCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCa > 1:862090/1‑150 (MQ=255) tCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAAtt < 1:1353718/150‑1 (MQ=255) cgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCa < 1:123042/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGCAAAATTCTCGGGTCATGGATGTCTTGTCGAGTAGCACTGGGGTTTTTCTGACGCTCGTTTCTGCTTGGTGAGATAGTGCCTGTGTGTATTCCGGATGCGGGGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAATACCAATTAAATTGAAt < 2:1536765/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAAGCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAAt < 1:141186/150‑1 (MQ=255) aGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATg < 2:108181/150‑1 (MQ=255) aGCCAGCAAAATGCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATg < 1:437531/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGAGGCGTTAACGCCTTATCCGGCATACAAAACCAATTATATTCAATGa > 2:222838/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTcaatcaat > 1:1168584/1‑150 (MQ=255) aGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAtt > 1:840113/1‑150 (MQ=255) gCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTa > 1:1701795/1‑150 (MQ=255) aaaTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGACTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaa < 1:1043032/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaaa > 2:1381394/1‑150 (MQ=255) ctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTATCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatga < 2:1492045/150‑1 (MQ=255) ctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatga > 1:766184/1‑150 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt > 2:1160197/1‑150 (MQ=255) ggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCTGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTa < 1:745293/150‑1 (MQ=255) ggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTa > 1:971885/1‑150 (MQ=255) aaTGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGAc < 1:950661/150‑1 (MQ=255) ggATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTg < 1:490916/150‑1 (MQ=255) gATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGa > 1:1021704/1‑150 (MQ=255) tGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATa < 2:1611547/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATAc < 2:728133/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTATCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATAc < 2:734472/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACAt > 2:1371365/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAga > 1:480553/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGAGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGc > 1:1567863/1‑150 (MQ=255) cGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcaa > 1:663553/1‑149 (MQ=255) aGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAg < 2:920827/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCt < 2:1312345/150‑1 (MQ=255) aaTCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGACTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCt > 1:1029382/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTAtt > 2:1178943/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 1:810001/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTACCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 2:358495/1‑150 (MQ=255) tttttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGc < 1:260385/150‑1 (MQ=255) tttttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGc > 1:572869/1‑150 (MQ=255) aTGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGATTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAGCAATTAAAGTCATTGAATTAAAAAATGATGTAGCCCTGATACATAGCACAACAGGGTATTTTGCGGTTa > 2:271405/1‑150 (MQ=37) gACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGc > 1:873024/1‑150 (MQ=255) aCGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCa < 1:649214/150‑1 (MQ=255) gTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtc > 2:1136712/1‑150 (MQ=255) tttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgatg > 1:1492178/1‑101 (MQ=255) tttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgatg < 2:1492178/101‑1 (MQ=255) ttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCAGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtctc < 2:1061394/150‑1 (MQ=255) cAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGAACAACAGGCTTTTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaa > 1:1101430/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc > 1:748673/1‑150 (MQ=255) tGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCgg > 2:1353294/1‑150 (MQ=255) gACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTcc < 2:1021704/150‑1 (MQ=255) cAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACACCAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAg > 2:689925/1‑150 (MQ=255) cAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTctat > 2:946187/1‑147 (MQ=255) aGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATa < 2:1064262/150‑1 (MQ=255) tGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATaga > 1:1419112/1‑150 (MQ=255) ccTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGc > 1:1712823/1‑150 (MQ=255) ccTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGCAAATTTTGAGTTTAGAATCAGTATAAAACCGGCTCCAGATAGAGc > 2:292117/1‑150 (MQ=38) cTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGCGcc > 2:875456/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCg > 1:531162/1‑150 (MQ=255) tttgtaggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCAAGATAGAGCCggt > 2:1688563/8‑150 (MQ=38) ttttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtt < 1:1661270/149‑1 (MQ=255) ttttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggtt > 1:303291/2‑150 (MQ=255) tttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttt < 1:716812/150‑1 (MQ=255) tttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCC‑TATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 2:737239/150‑2 (MQ=39) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 1:1467764/150‑2 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 1:664293/150‑2 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAATAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 2:1197355/150‑2 (MQ=38) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttgag < 1:1600395/150‑4 (MQ=38) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg < 1:660552/150‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttgaga < 1:30055/150‑5 (MQ=38) tGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggt > 2:1417091/1‑150 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGAATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggttttggt > 1:1549449/2‑150 (MQ=255) cctgATGCGGCGTTAACGCCTTATACGGCCTACAATACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTTTTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggttt < 1:851301/147‑1 (MQ=255) ccGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttgagact < 1:1213814/150‑7 (MQ=38) ccGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggttt < 2:1493684/150‑1 (MQ=255) cggttaaggcgTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGCCCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGGTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggtttt > 1:1244643/8‑150 (MQ=255) cGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttggtttt > 1:984527/1‑150 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:1025606/150‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTACCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:358495/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACAAAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTc < 1:1113890/150‑1 (MQ=255) ggcgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCtt > 2:647608/1‑150 (MQ=255) cgTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGGCCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGG‑AATGGTTTTCTGTCTTAAc > 1:1597749/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCa > 2:659106/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCa > 2:42384/1‑150 (MQ=255) aaCGCCTTATCCGGCCTACAAAACAAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACACCAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGAGAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACgaa > 2:273373/1‑148 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCTATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCAcc > 2:176949/1‑150 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCTATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCAcc > 2:171327/1‑150 (MQ=255) cGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCAcc > 2:57417/1‑150 (MQ=255) gcattATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTGAATGAATTAAAAATTGATGTAGAACTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGTGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCCGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCa < 2:855005/147‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTTCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATg < 1:785396/150‑1 (MQ=255) cTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATg > 2:1606004/1‑150 (MQ=255) | TGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGTCTTAACGCACCATG > NC_000913/2917761‑2918057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |