| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 3,073,001 | 0 | C | T | 5.9% | 435.7 / 9.8 | 137 | E231K (GAA→AAA) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (66/62); new base T (2/6); total (69/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
TTCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTCAAAGCGATCGTTAAATTGCGGAAAAAATCGTGTGATACCGGCGGCCAGTTTAGTATCGACCGGAATGATCGA‑‑‑‑CTGGCTGGCTGCCCGGGTGCGACGCAGGTCAGGATGGTATGCATCAATAACCTGTTGATCGTGCATGGCGGAGT > NC_000913/3072852‑3073147 | ttCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTc < 2:1034982/150‑1 (MQ=255)ttCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTc < 1:748834/150‑1 (MQ=255)atCCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTc < 1:1167302/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |