Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,073,002 | 0 | A | G | 5.9% | 409.5 / 11.2 | 136 | F230F (TTT→TTC) | epd | D‑erythrose 4‑phosphate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/62); new base G (2/6); total (68/68) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CCGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTCAAAGCGATCGTTAAATTGCGGAAAAAATCGTGTGATACCGGCGGCCAGTTTAGTATCGACCGGAATGATCGACTGGCTGGCTGCCCGGGTGCGACGCAGGTCAGGATGGTATGCATCAATAACCTGTTGATCGTGCATGGCGGAGTGAAT > NC_000913/3072854‑3073151 | ccGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTCaa > 1:1046761/1‑150 (MQ=255) cGTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACATTTATGGTTGGCACACGTACCGCAATCGCTTCaaa > 2:746878/1‑150 (MQ=255) gTATAGTCAACTATACCATGAAATGCACCTTGTGCTGCTTTTTGCAGCAACAGGTTGACTTCATTGGCTTTTACAGGTTTCTTCACCGTCACGCTTAAATCGATTGCCGTCACA‑TTATTGGTGGCCCACGTACCGCCATAGCTTGAAAGc > 1:652742/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |